RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRVP-202ENST00000490575 JPH4Q96JJ6 628 aa27.55■■■□□ 2
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.55■■■□□ 2
PTPRVP-202ENST00000490575 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.54■■■□□ 2
PTPRVP-202ENST00000490575 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PTPRVP-202ENST00000490575 PRXQ9BXM0 1461 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PTPRVP-202ENST00000490575 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRVP-202ENST00000490575 IQGAP2Q13576 1575 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRVP-202ENST00000490575 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRVP-202ENST00000490575 EEA1Q15075 1411 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRVP-202ENST00000490575 DISP1Q96F81 1524 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRVP-202ENST00000490575 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.26■■□□□ 1.96
PTPRVP-202ENST00000490575 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA0556O60303 1618 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF21BO75037 1637 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRGP23470 1445 aa27.14■■□□□ 1.93
PTPRVP-202ENST00000490575 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRVP-202ENST00000490575 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRVP-202ENST00000490575 P3H3Q8IVL6 736 aa27■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 SAMD9Q5K651 1589 aa27■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGA3Q08378 1498 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 UACAQ9BZF9 1416 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.95■■□□□ 1.91
PTPRVP-202ENST00000490575 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC2Q92887 1545 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRVP-202ENST00000490575 MAPKBP1O60336 1514 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCA8O94911 1581 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRVP-202ENST00000490575 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 DIP2BQ9P265 1576 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRVP-202ENST00000490575 ASXL2Q76L83 1435 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRVP-202ENST00000490575 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRVP-202ENST00000490575 ARID3CA6NKF2 412 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRVP-202ENST00000490575 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRVP-202ENST00000490575 ATP10BO94823 1461 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRVP-202ENST00000490575 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPOAP1O95153 1857 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRVP-202ENST00000490575 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PTPRVP-202ENST00000490575 GLI2P10070 1586 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRVP-202ENST00000490575 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRVP-202ENST00000490575 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNH8Q96L42 1107 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRVP-202ENST00000490575 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRVP-202ENST00000490575 CLIP1P30622 1438 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRVP-202ENST00000490575 FMN1Q68DA7 1419 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRVP-202ENST00000490575 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 HECW1Q76N89 1606 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 CEP162Q5TB80 1403 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRVP-202ENST00000490575 CD109Q6YHK3 1445 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRVP-202ENST00000490575 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM6BO15054 1643 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRVP-202ENST00000490575 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRVP-202ENST00000490575 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRVP-202ENST00000490575 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRVP-202ENST00000490575 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF14Q15058 1648 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRVP-202ENST00000490575 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRVP-202ENST00000490575 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRVP-202ENST00000490575 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRVP-202ENST00000490575 NEO1Q92859 1461 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRVP-202ENST00000490575 PLCH2O75038 1416 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 FANCAO15360 1455 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 RAPGEF3O95398 923 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 AKNAQ7Z591 1439 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRVP-202ENST00000490575 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRVP-202ENST00000490575 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRVP-202ENST00000490575 RICTORQ6R327 1708 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRVP-202ENST00000490575 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRVP-202ENST00000490575 PREX2Q70Z35 1606 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRVP-202ENST00000490575 TIAM1Q13009 1591 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.93■■□□□ 1.74
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