RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490386.1

CLEC3B-203, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 3

Gene CLEC3B, Length 708 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-203ENST00000490386 CUL7Q14999 1698 aa49.78■■■■■ 5.56
CLEC3B-203ENST00000490386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.73■■■■■ 5.55
CLEC3B-203ENST00000490386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.7■■■■■ 5.55
CLEC3B-203ENST00000490386 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.7■■■■■ 5.55
CLEC3B-203ENST00000490386 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.38■■■■■ 5.5
CLEC3B-203ENST00000490386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.29■■■■■ 5.48
CLEC3B-203ENST00000490386 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.26■■■■■ 5.48
CLEC3B-203ENST00000490386 PTPRGP23470 1445 aa49.2■■■■■ 5.47
CLEC3B-203ENST00000490386 IQGAP2Q13576 1575 aa49.17■■■■■ 5.46
CLEC3B-203ENST00000490386 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.15■■■■■ 5.46
CLEC3B-203ENST00000490386 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.07■■■■■ 5.45
CLEC3B-203ENST00000490386 MAPKBP1O60336 1514 aa49.04■■■■■ 5.44
CLEC3B-203ENST00000490386 FAM69CQ0P6D2 419 aa49■■■■■ 5.43
CLEC3B-203ENST00000490386 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.99■■■■■ 5.43
CLEC3B-203ENST00000490386 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.93■■■■■ 5.42
CLEC3B-203ENST00000490386 DISP1Q96F81 1524 aa48.93■■■■■ 5.42
CLEC3B-203ENST00000490386 PRXQ9BXM0 1461 aa48.87■■■■■ 5.41
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.86■■■■■ 5.41
CLEC3B-203ENST00000490386 UACAQ9BZF9 1416 aa48.82■■■■■ 5.41
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCC2Q92887 1545 aa48.81■■■■■ 5.4
CLEC3B-203ENST00000490386 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.8■■■■■ 5.4
CLEC3B-203ENST00000490386 DIP2BQ9P265 1576 aa48.73■■■■■ 5.39
CLEC3B-203ENST00000490386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.73■■■■■ 5.39
CLEC3B-203ENST00000490386 KIAA0556O60303 1618 aa48.69■■■■■ 5.38
CLEC3B-203ENST00000490386 GOLGA3Q08378 1498 aa48.67■■■■■ 5.38
CLEC3B-203ENST00000490386 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.63■■■■■ 5.38
CLEC3B-203ENST00000490386 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.62■■■■■ 5.37
CLEC3B-203ENST00000490386 ASXL2Q76L83 1435 aa48.59■■■■■ 5.37
CLEC3B-203ENST00000490386 EEA1Q15075 1411 aa48.58■■■■■ 5.37
CLEC3B-203ENST00000490386 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.54■■■■■ 5.36
CLEC3B-203ENST00000490386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
CLEC3B-203ENST00000490386 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
CLEC3B-203ENST00000490386 GLI2P10070 1586 aa48.39■■■■■ 5.34
CLEC3B-203ENST00000490386 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
CLEC3B-203ENST00000490386 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCA8O94911 1581 aa48.26■■■■■ 5.32
CLEC3B-203ENST00000490386 TSPOAP1O95153 1857 aa48.25■■■■■ 5.32
CLEC3B-203ENST00000490386 P3H3Q8IVL6 736 aa48.23■■■■■ 5.31
CLEC3B-203ENST00000490386 KDM6BO15054 1643 aa48.22■■■■■ 5.31
CLEC3B-203ENST00000490386 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.18■■■■■ 5.3
CLEC3B-203ENST00000490386 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.14■■■■■ 5.3
CLEC3B-203ENST00000490386 SAMD9Q5K651 1589 aa48.05■■■■■ 5.28
CLEC3B-203ENST00000490386 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.05■■■■■ 5.28
CLEC3B-203ENST00000490386 KCNH8Q96L42 1107 aa48.04■■■■■ 5.28
CLEC3B-203ENST00000490386 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.03■■■■■ 5.28
CLEC3B-203ENST00000490386 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF21BO75037 1637 aa47.96■■■■■ 5.27
CLEC3B-203ENST00000490386 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
CLEC3B-203ENST00000490386 ATP10BO94823 1461 aa47.94■■■■■ 5.26
CLEC3B-203ENST00000490386 CD109Q6YHK3 1445 aa47.91■■■■■ 5.26
CLEC3B-203ENST00000490386 ARID3CA6NKF2 412 aa47.89■■■■■ 5.26
CLEC3B-203ENST00000490386 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.83■■■■■ 5.25
CLEC3B-203ENST00000490386 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.8■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.79■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.76■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.76■■■■■ 5.24
CLEC3B-203ENST00000490386 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.68■■■■■ 5.22
CLEC3B-203ENST00000490386 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
CLEC3B-203ENST00000490386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.63■■■■■ 5.22
CLEC3B-203ENST00000490386 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.6■■■■■ 5.21
CLEC3B-203ENST00000490386 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.56■■■■■ 5.2
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.51■■■■■ 5.2
CLEC3B-203ENST00000490386 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.45■■■■■ 5.19
CLEC3B-203ENST00000490386 FMN1Q68DA7 1419 aa47.43■■■■■ 5.18
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.36■■■■■ 5.17
CLEC3B-203ENST00000490386 NEO1Q92859 1461 aa47.35■■■■■ 5.17
CLEC3B-203ENST00000490386 ADGRL1O94910 1474 aa47.32■■■■■ 5.17
CLEC3B-203ENST00000490386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
CLEC3B-203ENST00000490386 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
CLEC3B-203ENST00000490386 RAPGEF3O95398 923 aa47.19■■■■■ 5.14
CLEC3B-203ENST00000490386 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
CLEC3B-203ENST00000490386 HECW1Q76N89 1606 aa47.14■■■■■ 5.14
CLEC3B-203ENST00000490386 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.14
CLEC3B-203ENST00000490386 AKNAQ7Z591 1439 aa47.07■■■■■ 5.13
CLEC3B-203ENST00000490386 FANCAO15360 1455 aa47.06■■■■■ 5.12
CLEC3B-203ENST00000490386 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
CLEC3B-203ENST00000490386 PLCH2O75038 1416 aa46.98■■■■■ 5.11
CLEC3B-203ENST00000490386 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.98■■■■■ 5.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.97■■■■■ 5.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.91■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CLIP1P30622 1438 aa46.89■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.89■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.88■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.81■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.78■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF14Q15058 1648 aa46.76■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 RICTORQ6R327 1708 aa46.75■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.73■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.7■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.69■■■■■ 5.06
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.67■■■■■ 5.06
CLEC3B-203ENST00000490386 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.66■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms