RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490320.2

C3orf80-202, Transcript of chromosome 3 open reading frame 80, humanhuman

TSL 3

Gene C3orf80, Length 1,110 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf80-202ENST00000490320 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
C3orf80-202ENST00000490320 CUL7Q14999 1698 aa44.42■■■■■ 4.7
C3orf80-202ENST00000490320 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.29■■■■■ 4.68
C3orf80-202ENST00000490320 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.2■■■■■ 4.67
C3orf80-202ENST00000490320 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.62
C3orf80-202ENST00000490320 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.88■■■■■ 4.62
C3orf80-202ENST00000490320 IQGAP2Q13576 1575 aa43.87■■■■■ 4.61
C3orf80-202ENST00000490320 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.85■■■■■ 4.61
C3orf80-202ENST00000490320 MAPKBP1O60336 1514 aa43.84■■■■■ 4.61
C3orf80-202ENST00000490320 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.84■■■■■ 4.61
C3orf80-202ENST00000490320 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.84■■■■■ 4.61
C3orf80-202ENST00000490320 PTPRGP23470 1445 aa43.8■■■■■ 4.6
C3orf80-202ENST00000490320 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.76■■■■■ 4.6
C3orf80-202ENST00000490320 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.76■■■■■ 4.6
C3orf80-202ENST00000490320 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.65■■■■■ 4.58
C3orf80-202ENST00000490320 DISP1Q96F81 1524 aa43.63■■■■■ 4.58
C3orf80-202ENST00000490320 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.63■■■■■ 4.58
C3orf80-202ENST00000490320 DIP2BQ9P265 1576 aa43.63■■■■■ 4.57
C3orf80-202ENST00000490320 ABCC2Q92887 1545 aa43.55■■■■■ 4.56
C3orf80-202ENST00000490320 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
C3orf80-202ENST00000490320 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.53■■■■■ 4.56
C3orf80-202ENST00000490320 UACAQ9BZF9 1416 aa43.48■■■■■ 4.55
C3orf80-202ENST00000490320 PRXQ9BXM0 1461 aa43.47■■■■■ 4.55
C3orf80-202ENST00000490320 KIAA0556O60303 1618 aa43.46■■■■■ 4.55
C3orf80-202ENST00000490320 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.45■■■■■ 4.55
C3orf80-202ENST00000490320 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.38■■■■■ 4.53
C3orf80-202ENST00000490320 ASXL2Q76L83 1435 aa43.34■■■■■ 4.53
C3orf80-202ENST00000490320 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.32■■■■■ 4.52
C3orf80-202ENST00000490320 GOLGA3Q08378 1498 aa43.32■■■■■ 4.52
C3orf80-202ENST00000490320 GLI2P10070 1586 aa43.25■■■■■ 4.51
C3orf80-202ENST00000490320 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
C3orf80-202ENST00000490320 TSPOAP1O95153 1857 aa43.22■■■■■ 4.51
C3orf80-202ENST00000490320 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.17■■■■■ 4.5
C3orf80-202ENST00000490320 KDM6BO15054 1643 aa43.17■■■■■ 4.5
C3orf80-202ENST00000490320 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
C3orf80-202ENST00000490320 EEA1Q15075 1411 aa43.12■■■■■ 4.49
C3orf80-202ENST00000490320 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
C3orf80-202ENST00000490320 ABCA8O94911 1581 aa43.07■■■■■ 4.48
C3orf80-202ENST00000490320 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
C3orf80-202ENST00000490320 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.99■■■■■ 4.47
C3orf80-202ENST00000490320 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.98■■■■■ 4.47
C3orf80-202ENST00000490320 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
C3orf80-202ENST00000490320 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.88■■■■■ 4.46
C3orf80-202ENST00000490320 SAMD9Q5K651 1589 aa42.87■■■■■ 4.45
C3orf80-202ENST00000490320 P3H3Q8IVL6 736 aa42.8■■■■■ 4.44
C3orf80-202ENST00000490320 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.72■■■■■ 4.43
C3orf80-202ENST00000490320 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
C3orf80-202ENST00000490320 KIF21BO75037 1637 aa42.71■■■■■ 4.43
C3orf80-202ENST00000490320 ATP10BO94823 1461 aa42.69■■■■■ 4.42
C3orf80-202ENST00000490320 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.69■■■■■ 4.42
C3orf80-202ENST00000490320 KCNH8Q96L42 1107 aa42.68■■■■■ 4.42
C3orf80-202ENST00000490320 CD109Q6YHK3 1445 aa42.68■■■■■ 4.42
C3orf80-202ENST00000490320 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.63■■■■■ 4.41
C3orf80-202ENST00000490320 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.6■■■■■ 4.41
C3orf80-202ENST00000490320 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.56■■■■■ 4.4
C3orf80-202ENST00000490320 ARID3CA6NKF2 412 aa42.55■■■■■ 4.4
C3orf80-202ENST00000490320 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.53■■■■■ 4.4
C3orf80-202ENST00000490320 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.53■■■■■ 4.4
C3orf80-202ENST00000490320 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
C3orf80-202ENST00000490320 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
C3orf80-202ENST00000490320 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.45■■■■■ 4.39
C3orf80-202ENST00000490320 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
C3orf80-202ENST00000490320 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
C3orf80-202ENST00000490320 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.35■■■■■ 4.37
C3orf80-202ENST00000490320 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.35■■■■■ 4.37
C3orf80-202ENST00000490320 ADGRL1O94910 1474 aa42.34■■■■■ 4.37
C3orf80-202ENST00000490320 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
C3orf80-202ENST00000490320 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.24■■■■■ 4.35
C3orf80-202ENST00000490320 NEO1Q92859 1461 aa42.23■■■■■ 4.35
C3orf80-202ENST00000490320 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.15■■■■■ 4.34
C3orf80-202ENST00000490320 FMN1Q68DA7 1419 aa42.14■■■■■ 4.34
C3orf80-202ENST00000490320 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.13■■■■■ 4.34
C3orf80-202ENST00000490320 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
C3orf80-202ENST00000490320 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
C3orf80-202ENST00000490320 HECW1Q76N89 1606 aa42.02■■■■■ 4.32
C3orf80-202ENST00000490320 RAPGEF3O95398 923 aa42■■■■■ 4.31
C3orf80-202ENST00000490320 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.97■■■■■ 4.31
C3orf80-202ENST00000490320 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.95■■■■■ 4.31
C3orf80-202ENST00000490320 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.95■■■■■ 4.31
C3orf80-202ENST00000490320 FANCAO15360 1455 aa41.94■■■■■ 4.3
C3orf80-202ENST00000490320 AKNAQ7Z591 1439 aa41.92■■■■■ 4.3
C3orf80-202ENST00000490320 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
C3orf80-202ENST00000490320 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
C3orf80-202ENST00000490320 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
C3orf80-202ENST00000490320 RICTORQ6R327 1708 aa41.83■■■■■ 4.29
C3orf80-202ENST00000490320 PLCH2O75038 1416 aa41.82■■■■■ 4.29
C3orf80-202ENST00000490320 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.74■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.73■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.71■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.7■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 KIF14Q15058 1648 aa41.7■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 CLIP1P30622 1438 aa41.69■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.69■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.69■■■■■ 4.27
C3orf80-202ENST00000490320 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.67■■■■■ 4.26
C3orf80-202ENST00000490320 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.66■■■■■ 4.26
C3orf80-202ENST00000490320 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.65■■■■■ 4.26
C3orf80-202ENST00000490320 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.65■■■■■ 4.26
C3orf80-202ENST00000490320 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.64■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms