RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489578.2

FBXW4-205, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene FBXW4, Length 483 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4-205ENST00000489578 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.98■□□□□ 0.95
FBXW4-205ENST00000489578 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.97■□□□□ 0.95
FBXW4-205ENST00000489578 CEP170Q5SW79 1584 aa20.97■□□□□ 0.95
FBXW4-205ENST00000489578 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.94
FBXW4-205ENST00000489578 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
FBXW4-205ENST00000489578 JPH4Q96JJ6 628 aa20.88■□□□□ 0.93
FBXW4-205ENST00000489578 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXW4-205ENST00000489578 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXW4-205ENST00000489578 CEP162Q5TB80 1403 aa20.83■□□□□ 0.93
FBXW4-205ENST00000489578 IQGAP2Q13576 1575 aa20.8■□□□□ 0.92
FBXW4-205ENST00000489578 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
FBXW4-205ENST00000489578 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
FBXW4-205ENST00000489578 P3H3Q8IVL6 736 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXW4-205ENST00000489578 CLIP1P30622 1438 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXW4-205ENST00000489578 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.72■□□□□ 0.91
FBXW4-205ENST00000489578 SHROOM2Q13796 1616 aa20.71■□□□□ 0.91
FBXW4-205ENST00000489578 ARHGEF11O15085 1522 aa20.7■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.69■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.68■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.68■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.66■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 SAMD9Q5K651 1589 aa20.66■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.65■□□□□ 0.9
FBXW4-205ENST00000489578 DISP1Q96F81 1524 aa20.63■□□□□ 0.89
FBXW4-205ENST00000489578 ARAP1Q96P48 1450 aa20.61■□□□□ 0.89
FBXW4-205ENST00000489578 KIAA0556O60303 1618 aa20.59■□□□□ 0.89
FBXW4-205ENST00000489578 PTPRGP23470 1445 aa20.58■□□□□ 0.88
FBXW4-205ENST00000489578 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.56■□□□□ 0.88
FBXW4-205ENST00000489578 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.54■□□□□ 0.88
FBXW4-205ENST00000489578 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FBXW4-205ENST00000489578 FMN1Q68DA7 1419 aa20.46■□□□□ 0.87
FBXW4-205ENST00000489578 ARID3CA6NKF2 412 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXW4-205ENST00000489578 UACAQ9BZF9 1416 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXW4-205ENST00000489578 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXW4-205ENST00000489578 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXW4-205ENST00000489578 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
FBXW4-205ENST00000489578 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 ABCA8O94911 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 HECW1Q76N89 1606 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXW4-205ENST00000489578 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.33■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.32■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 ABCC2Q92887 1545 aa20.32■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 APLP2Q06481 763 aa20.3■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 MAP3K1Q13233 1512 aa20.3■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.3■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 TIAM1Q13009 1591 aa20.28■□□□□ 0.84
FBXW4-205ENST00000489578 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FBXW4-205ENST00000489578 ATP10BO94823 1461 aa20.24■□□□□ 0.83
FBXW4-205ENST00000489578 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.24■□□□□ 0.83
FBXW4-205ENST00000489578 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
FBXW4-205ENST00000489578 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.21■□□□□ 0.83
FBXW4-205ENST00000489578 KCNH8Q96L42 1107 aa20.2■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.18■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 ASXL2Q76L83 1435 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.15■□□□□ 0.82
FBXW4-205ENST00000489578 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FBXW4-205ENST00000489578 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FBXW4-205ENST00000489578 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXW4-205ENST00000489578 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXW4-205ENST00000489578 MAPKBP1O60336 1514 aa20.08■□□□□ 0.81
FBXW4-205ENST00000489578 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FBXW4-205ENST00000489578 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXW4-205ENST00000489578 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXW4-205ENST00000489578 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXW4-205ENST00000489578 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
FBXW4-205ENST00000489578 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
FBXW4-205ENST00000489578 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20■□□□□ 0.79
FBXW4-205ENST00000489578 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
FBXW4-205ENST00000489578 DIP2BQ9P265 1576 aa19.95■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 NCOA2Q15596 1464 aa19.95■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 KIF14Q15058 1648 aa19.94■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.93■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 TSPOAP1O95153 1857 aa19.91■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 CD109Q6YHK3 1445 aa19.91■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.9■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 GLI2P10070 1586 aa19.9■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.9■□□□□ 0.78
FBXW4-205ENST00000489578 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.87■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.87■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.87■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.86■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.85■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.83■□□□□ 0.77
FBXW4-205ENST00000489578 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.83■□□□□ 0.76
FBXW4-205ENST00000489578 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms