RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489485.5

CLDN11-209, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 1,854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-209ENST00000489485 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.17■■□□□ 1.3
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CLDN11-209ENST00000489485 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
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CLDN11-209ENST00000489485 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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CLDN11-209ENST00000489485 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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CLDN11-209ENST00000489485 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-209ENST00000489485 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
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CLDN11-209ENST00000489485 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.43■■□□□ 1.18
CLDN11-209ENST00000489485 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.43■■□□□ 1.18
CLDN11-209ENST00000489485 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-209ENST00000489485 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
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CLDN11-209ENST00000489485 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.38■■□□□ 1.17
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CLDN11-209ENST00000489485 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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CLDN11-209ENST00000489485 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.07■■□□□ 1.12
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CLDN11-209ENST00000489485 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22■■□□□ 1.11
CLDN11-209ENST00000489485 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-209ENST00000489485 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-209ENST00000489485 PLCH2O75038 1416 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 PREX2Q70Z35 1606 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-209ENST00000489485 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.93■■□□□ 1.1
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