RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-208ENST00000488989 CEP170Q5SW79 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
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CLDN11-208ENST00000488989 IQGAP2Q13576 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN11-208ENST00000488989 CEP162Q5TB80 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN11-208ENST00000488989 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.78■■□□□ 1.72
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CLDN11-208ENST00000488989 CLIP1P30622 1438 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN11-208ENST00000488989 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.71■■□□□ 1.71
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CLDN11-208ENST00000488989 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.51■■□□□ 1.67
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CLDN11-208ENST00000488989 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.24■■□□□ 1.63
CLDN11-208ENST00000488989 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
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CLDN11-208ENST00000488989 MAP3K1Q13233 1512 aa25.2■■□□□ 1.62
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CLDN11-208ENST00000488989 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLDN11-208ENST00000488989 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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CLDN11-208ENST00000488989 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.14■■□□□ 1.61
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CLDN11-208ENST00000488989 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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CLDN11-208ENST00000488989 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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CLDN11-208ENST00000488989 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN11-208ENST00000488989 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN11-208ENST00000488989 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN11-208ENST00000488989 DIP2BQ9P265 1576 aa24.57■■□□□ 1.52
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CLDN11-208ENST00000488989 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN11-208ENST00000488989 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CLDN11-208ENST00000488989 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
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