RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488024.1

RASSF1-208, Transcript of Ras association domain family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene RASSF1, Length 1,385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1-208ENST00000488024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.45■■■■■ 4.23
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RASSF1-208ENST00000488024 ARAP1Q96P48 1450 aa41.42■■■■■ 4.22
RASSF1-208ENST00000488024 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.37■■■■■ 4.21
RASSF1-208ENST00000488024 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.36■■■■■ 4.21
RASSF1-208ENST00000488024 JPH4Q96JJ6 628 aa41.33■■■■■ 4.21
RASSF1-208ENST00000488024 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
RASSF1-208ENST00000488024 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
RASSF1-208ENST00000488024 IQGAP2Q13576 1575 aa41.26■■■■■ 4.19
RASSF1-208ENST00000488024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.2■■■■■ 4.19
RASSF1-208ENST00000488024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
RASSF1-208ENST00000488024 KIF21BO75037 1637 aa41.08■■■■■ 4.17
RASSF1-208ENST00000488024 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.04■■■■■ 4.16
RASSF1-208ENST00000488024 DISP1Q96F81 1524 aa40.96■■■■■ 4.15
RASSF1-208ENST00000488024 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.95■■■■■ 4.15
RASSF1-208ENST00000488024 KIAA0556O60303 1618 aa40.87■■■■■ 4.13
RASSF1-208ENST00000488024 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.83■■■■■ 4.13
RASSF1-208ENST00000488024 GOLGA3Q08378 1498 aa40.79■■■■■ 4.12
RASSF1-208ENST00000488024 PTPRGP23470 1445 aa40.77■■■■■ 4.12
RASSF1-208ENST00000488024 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.68■■■■■ 4.1
RASSF1-208ENST00000488024 SAMD9Q5K651 1589 aa40.67■■■■■ 4.1
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RASSF1-208ENST00000488024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
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RASSF1-208ENST00000488024 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.53■■■■■ 4.08
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RASSF1-208ENST00000488024 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.48■■■■■ 4.07
RASSF1-208ENST00000488024 P3H3Q8IVL6 736 aa40.46■■■■■ 4.07
RASSF1-208ENST00000488024 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
RASSF1-208ENST00000488024 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.42■■■■■ 4.06
RASSF1-208ENST00000488024 ABCA8O94911 1581 aa40.42■■■■■ 4.06
RASSF1-208ENST00000488024 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
RASSF1-208ENST00000488024 MAPKBP1O60336 1514 aa40.4■■■■■ 4.06
RASSF1-208ENST00000488024 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.35■■■■■ 4.05
RASSF1-208ENST00000488024 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.34■■■■■ 4.05
RASSF1-208ENST00000488024 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
RASSF1-208ENST00000488024 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.29■■■■■ 4.04
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RASSF1-208ENST00000488024 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.22■■■■■ 4.03
RASSF1-208ENST00000488024 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.17■■■■■ 4.02
RASSF1-208ENST00000488024 ASXL2Q76L83 1435 aa40.15■■■■■ 4.02
RASSF1-208ENST00000488024 DIP2BQ9P265 1576 aa40.14■■■■■ 4.02
RASSF1-208ENST00000488024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
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RASSF1-208ENST00000488024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.98■■■■□ 3.99
RASSF1-208ENST00000488024 GLI2P10070 1586 aa39.95■■■■□ 3.99
RASSF1-208ENST00000488024 ARID3CA6NKF2 412 aa39.94■■■■□ 3.98
RASSF1-208ENST00000488024 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
RASSF1-208ENST00000488024 CEP162Q5TB80 1403 aa39.92■■■■□ 3.98
RASSF1-208ENST00000488024 HECW1Q76N89 1606 aa39.89■■■■□ 3.98
RASSF1-208ENST00000488024 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
RASSF1-208ENST00000488024 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.79■■■■□ 3.96
RASSF1-208ENST00000488024 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
RASSF1-208ENST00000488024 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.78■■■■□ 3.96
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RASSF1-208ENST00000488024 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.77■■■■□ 3.96
RASSF1-208ENST00000488024 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
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RASSF1-208ENST00000488024 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
RASSF1-208ENST00000488024 KCNH8Q96L42 1107 aa39.72■■■■□ 3.95
RASSF1-208ENST00000488024 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.71■■■■□ 3.95
RASSF1-208ENST00000488024 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
RASSF1-208ENST00000488024 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.7■■■■□ 3.95
RASSF1-208ENST00000488024 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.65■■■■□ 3.94
RASSF1-208ENST00000488024 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.63■■■■□ 3.93
RASSF1-208ENST00000488024 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.61■■■■□ 3.93
RASSF1-208ENST00000488024 CD109Q6YHK3 1445 aa39.57■■■■□ 3.92
RASSF1-208ENST00000488024 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.54■■■■□ 3.92
RASSF1-208ENST00000488024 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.52■■■■□ 3.92
RASSF1-208ENST00000488024 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
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RASSF1-208ENST00000488024 KDM6BO15054 1643 aa39.43■■■■□ 3.9
RASSF1-208ENST00000488024 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.42■■■■□ 3.9
RASSF1-208ENST00000488024 KIF14Q15058 1648 aa39.4■■■■□ 3.9
RASSF1-208ENST00000488024 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
RASSF1-208ENST00000488024 NEO1Q92859 1461 aa39.25■■■■□ 3.87
RASSF1-208ENST00000488024 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.25■■■■□ 3.87
RASSF1-208ENST00000488024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.22■■■■□ 3.87
RASSF1-208ENST00000488024 PLCH2O75038 1416 aa39.21■■■■□ 3.87
RASSF1-208ENST00000488024 TIAM1Q13009 1591 aa39.21■■■■□ 3.87
RASSF1-208ENST00000488024 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.2■■■■□ 3.87
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RASSF1-208ENST00000488024 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.17■■■■□ 3.86
RASSF1-208ENST00000488024 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.16■■■■□ 3.86
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RASSF1-208ENST00000488024 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.11■■■■□ 3.85
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RASSF1-208ENST00000488024 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.09■■■■□ 3.85
RASSF1-208ENST00000488024 AKNAQ7Z591 1439 aa39.09■■■■□ 3.85
RASSF1-208ENST00000488024 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.03■■■■□ 3.84
RASSF1-208ENST00000488024 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.01■■■■□ 3.84
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