RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-209	ENST00000487621	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
SEMA3C-209	ENST00000487621	CUL7	Q14999	1698 aa		43.07	■■■■■ 4.49
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SEMA3C-209	ENST00000487621	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SEMA3C-209	ENST00000487621	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.59	■■■■■ 4.41
SEMA3C-209	ENST00000487621	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SEMA3C-209	ENST00000487621	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	PTPRG	P23470	1445 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.47	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SEMA3C-209	ENST00000487621	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SEMA3C-209	ENST00000487621	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SEMA3C-209	ENST00000487621	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SEMA3C-209	ENST00000487621	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
SEMA3C-209	ENST00000487621	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SEMA3C-209	ENST00000487621	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.28	■■■■■ 4.36
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SEMA3C-209	ENST00000487621	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SEMA3C-209	ENST00000487621	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SEMA3C-209	ENST00000487621	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SEMA3C-209	ENST00000487621	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SEMA3C-209	ENST00000487621	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SEMA3C-209	ENST00000487621	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.01	■■■■■ 4.32
SEMA3C-209	ENST00000487621	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SEMA3C-209	ENST00000487621	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SEMA3C-209	ENST00000487621	GLI2	P10070	1586 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
SEMA3C-209	ENST00000487621	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SEMA3C-209	ENST00000487621	EEA1	Q15075	1411 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABCA8	O94911	1581 aa		41.82	■■■■■ 4.29
SEMA3C-209	ENST00000487621	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.81	■■■■■ 4.28
SEMA3C-209	ENST00000487621	KDM6B	O15054	1643 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SEMA3C-209	ENST00000487621	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.77	■■■■■ 4.28
SEMA3C-209	ENST00000487621	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
SEMA3C-209	ENST00000487621	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.67	■■■■■ 4.26
SEMA3C-209	ENST00000487621	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.65	■■■■■ 4.26
SEMA3C-209	ENST00000487621	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SEMA3C-209	ENST00000487621	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.59	■■■■■ 4.25
SEMA3C-209	ENST00000487621	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.51	■■■■■ 4.24
SEMA3C-209	ENST00000487621	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SEMA3C-209	ENST00000487621	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIF21B	O75037	1637 aa		41.49	■■■■■ 4.23
SEMA3C-209	ENST00000487621	ATP10B	O94823	1461 aa		41.48	■■■■■ 4.23
SEMA3C-209	ENST00000487621	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SEMA3C-209	ENST00000487621	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.39	■■■■■ 4.22
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.39	■■■■■ 4.22
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.39	■■■■■ 4.22
SEMA3C-209	ENST00000487621	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.37	■■■■■ 4.21
SEMA3C-209	ENST00000487621	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.37	■■■■■ 4.21
SEMA3C-209	ENST00000487621	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.36	■■■■■ 4.21
SEMA3C-209	ENST00000487621	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
SEMA3C-209	ENST00000487621	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.33	■■■■■ 4.21
SEMA3C-209	ENST00000487621	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
SEMA3C-209	ENST00000487621	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.26	■■■■■ 4.2
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.16	■■■■■ 4.18
SEMA3C-209	ENST00000487621	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3C-209	ENST00000487621	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3C-209	ENST00000487621	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3C-209	ENST00000487621	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.05	■■■■■ 4.16
SEMA3C-209	ENST00000487621	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.02	■■■■■ 4.16
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.99	■■■■■ 4.15
SEMA3C-209	ENST00000487621	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.99	■■■■■ 4.15
SEMA3C-209	ENST00000487621	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.96	■■■■■ 4.15
SEMA3C-209	ENST00000487621	NEO1	Q92859	1461 aa		40.93	■■■■■ 4.14
SEMA3C-209	ENST00000487621	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SEMA3C-209	ENST00000487621	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
SEMA3C-209	ENST00000487621	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.83	■■■■■ 4.13
SEMA3C-209	ENST00000487621	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SEMA3C-209	ENST00000487621	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SEMA3C-209	ENST00000487621	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.75	■■■■■ 4.11
SEMA3C-209	ENST00000487621	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.74	■■■■■ 4.11
SEMA3C-209	ENST00000487621	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.68	■■■■■ 4.1
SEMA3C-209	ENST00000487621	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
SEMA3C-209	ENST00000487621	FANCA	O15360	1455 aa		40.68	■■■■■ 4.1
SEMA3C-209	ENST00000487621	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
SEMA3C-209	ENST00000487621	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SEMA3C-209	ENST00000487621	PLCH2	O75038	1416 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SEMA3C-209	ENST00000487621	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
SEMA3C-209	ENST00000487621	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SEMA3C-209	ENST00000487621	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SEMA3C-209	ENST00000487621	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
SEMA3C-209	ENST00000487621	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIF14	Q15058	1648 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SEMA3C-209	ENST00000487621	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SEMA3C-209	ENST00000487621	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	CLIP1	P30622	1438 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.39	■■■■■ 4.06
SEMA3C-209	ENST00000487621	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.38	■■■■■ 4.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms