RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487164.5

TCEA2-216, Transcript of transcription elongation factor A2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCEA2, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2-216ENST00000487164 IGF1RP08069 1367 aa42.13■■■■■ 4.33
TCEA2-216ENST00000487164 CUL7Q14999 1698 aa42.04■■■■■ 4.32
TCEA2-216ENST00000487164 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.98■■■■■ 4.31
TCEA2-216ENST00000487164 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.92■■■■■ 4.3
TCEA2-216ENST00000487164 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.85■■■■■ 4.29
TCEA2-216ENST00000487164 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.82■■■■■ 4.29
TCEA2-216ENST00000487164 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
TCEA2-216ENST00000487164 MAPKBP1O60336 1514 aa41.74■■■■■ 4.27
TCEA2-216ENST00000487164 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.72■■■■■ 4.27
TCEA2-216ENST00000487164 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.69■■■■■ 4.26
TCEA2-216ENST00000487164 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
TCEA2-216ENST00000487164 DIP2BQ9P265 1576 aa41.63■■■■■ 4.25
TCEA2-216ENST00000487164 PTPRGP23470 1445 aa41.61■■■■■ 4.25
TCEA2-216ENST00000487164 IQGAP2Q13576 1575 aa41.59■■■■■ 4.25
TCEA2-216ENST00000487164 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
TCEA2-216ENST00000487164 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.56■■■■■ 4.24
TCEA2-216ENST00000487164 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.53■■■■■ 4.24
TCEA2-216ENST00000487164 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.47■■■■■ 4.23
TCEA2-216ENST00000487164 DISP1Q96F81 1524 aa41.4■■■■■ 4.22
TCEA2-216ENST00000487164 ABCC2Q92887 1545 aa41.39■■■■■ 4.22
TCEA2-216ENST00000487164 TSPOAP1O95153 1857 aa41.36■■■■■ 4.21
TCEA2-216ENST00000487164 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.32■■■■■ 4.2
TCEA2-216ENST00000487164 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
TCEA2-216ENST00000487164 UACAQ9BZF9 1416 aa41.29■■■■■ 4.2
TCEA2-216ENST00000487164 ASXL2Q76L83 1435 aa41.27■■■■■ 4.2
TCEA2-216ENST00000487164 KDM6BO15054 1643 aa41.26■■■■■ 4.2
TCEA2-216ENST00000487164 KIAA0556O60303 1618 aa41.22■■■■■ 4.19
TCEA2-216ENST00000487164 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.21■■■■■ 4.19
TCEA2-216ENST00000487164 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.14■■■■■ 4.18
TCEA2-216ENST00000487164 GLI2P10070 1586 aa41.14■■■■■ 4.18
TCEA2-216ENST00000487164 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.13■■■■■ 4.17
TCEA2-216ENST00000487164 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
TCEA2-216ENST00000487164 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
TCEA2-216ENST00000487164 PRXQ9BXM0 1461 aa41.03■■■■■ 4.16
TCEA2-216ENST00000487164 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
TCEA2-216ENST00000487164 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
TCEA2-216ENST00000487164 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.93■■■■■ 4.14
TCEA2-216ENST00000487164 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.88■■■■■ 4.13
TCEA2-216ENST00000487164 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.85■■■■■ 4.13
TCEA2-216ENST00000487164 ABCA8O94911 1581 aa40.85■■■■■ 4.13
TCEA2-216ENST00000487164 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.8■■■■■ 4.12
TCEA2-216ENST00000487164 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
TCEA2-216ENST00000487164 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.7■■■■■ 4.11
TCEA2-216ENST00000487164 P3H3Q8IVL6 736 aa40.66■■■■■ 4.1
TCEA2-216ENST00000487164 KCNH8Q96L42 1107 aa40.65■■■■■ 4.1
TCEA2-216ENST00000487164 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.61■■■■■ 4.09
TCEA2-216ENST00000487164 CD109Q6YHK3 1445 aa40.6■■■■■ 4.09
TCEA2-216ENST00000487164 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.57■■■■■ 4.08
TCEA2-216ENST00000487164 ARID3CA6NKF2 412 aa40.56■■■■■ 4.08
TCEA2-216ENST00000487164 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
TCEA2-216ENST00000487164 ADGRL1O94910 1474 aa40.55■■■■■ 4.08
TCEA2-216ENST00000487164 SAMD9Q5K651 1589 aa40.55■■■■■ 4.08
TCEA2-216ENST00000487164 ATP10BO94823 1461 aa40.51■■■■■ 4.07
TCEA2-216ENST00000487164 EEA1Q15075 1411 aa40.5■■■■■ 4.07
TCEA2-216ENST00000487164 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.41■■■■■ 4.06
TCEA2-216ENST00000487164 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
TCEA2-216ENST00000487164 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.3■■■■■ 4.04
TCEA2-216ENST00000487164 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.3■■■■■ 4.04
TCEA2-216ENST00000487164 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TCEA2-216ENST00000487164 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
TCEA2-216ENST00000487164 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TCEA2-216ENST00000487164 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
TCEA2-216ENST00000487164 KIF21BO75037 1637 aa40.22■■■■■ 4.03
TCEA2-216ENST00000487164 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.13■■■■■ 4.02
TCEA2-216ENST00000487164 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.12■■■■■ 4.01
TCEA2-216ENST00000487164 NEO1Q92859 1461 aa40.08■■■■■ 4.01
TCEA2-216ENST00000487164 RAPGEF3O95398 923 aa40.04■■■■■ 4
TCEA2-216ENST00000487164 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.02■■■■■ 4
TCEA2-216ENST00000487164 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.01■■■■□ 3.99
TCEA2-216ENST00000487164 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.99■■■■□ 3.99
TCEA2-216ENST00000487164 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.96■■■■□ 3.99
TCEA2-216ENST00000487164 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
TCEA2-216ENST00000487164 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.92■■■■□ 3.98
TCEA2-216ENST00000487164 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.983e-6■■■■□ 19.4
TCEA2-216ENST00000487164 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
TCEA2-216ENST00000487164 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.85■■■■□ 3.97
TCEA2-216ENST00000487164 FANCAO15360 1455 aa39.83■■■■□ 3.97
TCEA2-216ENST00000487164 AKNAQ7Z591 1439 aa39.82■■■■□ 3.97
TCEA2-216ENST00000487164 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.81■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.8■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 RICTORQ6R327 1708 aa39.79■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.78■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 FMN1Q68DA7 1419 aa39.76■■■■□ 3.96
TCEA2-216ENST00000487164 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.74■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.73■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 PTPRMP28827 1452 aa39.73■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 HECW1Q76N89 1606 aa39.73■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
TCEA2-216ENST00000487164 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
TCEA2-216ENST00000487164 MADDQ8WXG6 1647 aa39.65■■■■□ 3.94
TCEA2-216ENST00000487164 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.63■■■■□ 3.93
TCEA2-216ENST00000487164 PLCH2O75038 1416 aa39.63■■■■□ 3.93
TCEA2-216ENST00000487164 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.57■■■■□ 3.93
TCEA2-216ENST00000487164 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.57■■■■□ 3.92
TCEA2-216ENST00000487164 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
TCEA2-216ENST00000487164 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.55■■■■□ 3.92
TCEA2-216ENST00000487164 KIF14Q15058 1648 aa39.54■■■■□ 3.92
TCEA2-216ENST00000487164 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.54■■■■□ 3.92
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