RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.09■■■□□ 2.73
PTPRN-216ENST00000486480 ARAP1Q96P48 1450 aa32.09■■■□□ 2.73
PTPRN-216ENST00000486480 PRXQ9BXM0 1461 aa32.08■■■□□ 2.73
PTPRN-216ENST00000486480 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.04■■■□□ 2.72
PTPRN-216ENST00000486480 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32■■■□□ 2.71
PTPRN-216ENST00000486480 IQGAP2Q13576 1575 aa31.98■■■□□ 2.71
PTPRN-216ENST00000486480 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRN-216ENST00000486480 JPH4Q96JJ6 628 aa31.96■■■□□ 2.71
PTPRN-216ENST00000486480 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
PTPRN-216ENST00000486480 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.92■■■□□ 2.7
PTPRN-216ENST00000486480 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
PTPRN-216ENST00000486480 KIF21BO75037 1637 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRN-216ENST00000486480 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.79■■■□□ 2.68
PTPRN-216ENST00000486480 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRN-216ENST00000486480 DISP1Q96F81 1524 aa31.71■■■□□ 2.67
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA0556O60303 1618 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRN-216ENST00000486480 GOLGA3Q08378 1498 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRN-216ENST00000486480 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.61■■■□□ 2.65
PTPRN-216ENST00000486480 PTPRGP23470 1445 aa31.57■■■□□ 2.64
PTPRN-216ENST00000486480 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.53■■■□□ 2.64
PTPRN-216ENST00000486480 SAMD9Q5K651 1589 aa31.51■■■□□ 2.64
PTPRN-216ENST00000486480 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRN-216ENST00000486480 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
PTPRN-216ENST00000486480 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
PTPRN-216ENST00000486480 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.39■■■□□ 2.61
PTPRN-216ENST00000486480 UACAQ9BZF9 1416 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRN-216ENST00000486480 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRN-216ENST00000486480 ABCC2Q92887 1545 aa31.37■■■□□ 2.61
PTPRN-216ENST00000486480 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
PTPRN-216ENST00000486480 P3H3Q8IVL6 736 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 ABCA8O94911 1581 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 MAPKBP1O60336 1514 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
PTPRN-216ENST00000486480 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-216ENST00000486480 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-216ENST00000486480 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRN-216ENST00000486480 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRN-216ENST00000486480 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRN-216ENST00000486480 DIP2BQ9P265 1576 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRN-216ENST00000486480 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRN-216ENST00000486480 ASXL2Q76L83 1435 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRN-216ENST00000486480 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-216ENST00000486480 CLIP1P30622 1438 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-216ENST00000486480 FMN1Q68DA7 1419 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-216ENST00000486480 ATP10BO94823 1461 aa31■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 ARID3CA6NKF2 412 aa30.96■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 HECW1Q76N89 1606 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRN-216ENST00000486480 CEP162Q5TB80 1403 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRN-216ENST00000486480 GLI2P10070 1586 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRN-216ENST00000486480 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PTPRN-216ENST00000486480 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PTPRN-216ENST00000486480 TSPOAP1O95153 1857 aa30.86■■■□□ 2.53
PTPRN-216ENST00000486480 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PTPRN-216ENST00000486480 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRN-216ENST00000486480 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRN-216ENST00000486480 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
PTPRN-216ENST00000486480 KCNH8Q96L42 1107 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRN-216ENST00000486480 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRN-216ENST00000486480 CD109Q6YHK3 1445 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 KDM6BO15054 1643 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.49
PTPRN-216ENST00000486480 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PTPRN-216ENST00000486480 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.56■■■□□ 2.48
PTPRN-216ENST00000486480 KIF14Q15058 1648 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRN-216ENST00000486480 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRN-216ENST00000486480 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.41■■■□□ 2.46
PTPRN-216ENST00000486480 NEO1Q92859 1461 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRN-216ENST00000486480 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PTPRN-216ENST00000486480 TIAM1Q13009 1591 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRN-216ENST00000486480 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.37■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 FANCAO15360 1455 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 PLCH2O75038 1416 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 PREX2Q70Z35 1606 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRN-216ENST00000486480 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRN-216ENST00000486480 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K1Q13233 1512 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRN-216ENST00000486480 AKNAQ7Z591 1439 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRN-216ENST00000486480 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms