RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486447.1

CRIPT-202, Transcript of CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain, humanhuman

TSL 5

Gene CRIPT, Length 1,724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPT-202ENST00000486447 JPH4Q96JJ6 628 aa32.91■■■□□ 2.86
CRIPT-202ENST00000486447 ARHGEF11O15085 1522 aa32.87■■■□□ 2.85
CRIPT-202ENST00000486447 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.81■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.81■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.81■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 KIF21BO75037 1637 aa32.8■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 SHROOM2Q13796 1616 aa32.78■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.77■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CRIPT-202ENST00000486447 IQGAP2Q13576 1575 aa32.75■■■□□ 2.83
CRIPT-202ENST00000486447 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
CRIPT-202ENST00000486447 GOLGA3Q08378 1498 aa32.69■■■□□ 2.82
CRIPT-202ENST00000486447 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.68■■■□□ 2.82
CRIPT-202ENST00000486447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.67■■■□□ 2.82
CRIPT-202ENST00000486447 ARAP1Q96P48 1450 aa32.66■■■□□ 2.82
CRIPT-202ENST00000486447 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CRIPT-202ENST00000486447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.59■■■□□ 2.81
CRIPT-202ENST00000486447 DISP1Q96F81 1524 aa32.57■■■□□ 2.8
CRIPT-202ENST00000486447 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
CRIPT-202ENST00000486447 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.53■■■□□ 2.8
CRIPT-202ENST00000486447 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.53■■■□□ 2.8
CRIPT-202ENST00000486447 P3H3Q8IVL6 736 aa32.49■■■□□ 2.79
CRIPT-202ENST00000486447 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.45■■■□□ 2.78
CRIPT-202ENST00000486447 KIAA0556O60303 1618 aa32.44■■■□□ 2.78
CRIPT-202ENST00000486447 PTPRGP23470 1445 aa32.42■■■□□ 2.78
CRIPT-202ENST00000486447 SAMD9Q5K651 1589 aa32.33■■■□□ 2.77
CRIPT-202ENST00000486447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.28■■■□□ 2.76
CRIPT-202ENST00000486447 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.25■■■□□ 2.75
CRIPT-202ENST00000486447 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.21■■■□□ 2.75
CRIPT-202ENST00000486447 UACAQ9BZF9 1416 aa32.19■■■□□ 2.74
CRIPT-202ENST00000486447 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
CRIPT-202ENST00000486447 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.17■■■□□ 2.74
CRIPT-202ENST00000486447 CLIP1P30622 1438 aa32.16■■■□□ 2.74
CRIPT-202ENST00000486447 CEP162Q5TB80 1403 aa32.11■■■□□ 2.73
CRIPT-202ENST00000486447 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.08■■■□□ 2.73
CRIPT-202ENST00000486447 ABCC2Q92887 1545 aa32.08■■■□□ 2.73
CRIPT-202ENST00000486447 ABCA8O94911 1581 aa32.08■■■□□ 2.73
CRIPT-202ENST00000486447 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.72
CRIPT-202ENST00000486447 ARID3CA6NKF2 412 aa32.04■■■□□ 2.72
CRIPT-202ENST00000486447 FMN1Q68DA7 1419 aa31.98■■■□□ 2.71
CRIPT-202ENST00000486447 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.96■■■□□ 2.71
CRIPT-202ENST00000486447 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.95■■■□□ 2.71
CRIPT-202ENST00000486447 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CRIPT-202ENST00000486447 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
CRIPT-202ENST00000486447 ATP10BO94823 1461 aa31.89■■■□□ 2.7
CRIPT-202ENST00000486447 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 MAPKBP1O60336 1514 aa31.84■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 ASXL2Q76L83 1435 aa31.84■■■□□ 2.69
CRIPT-202ENST00000486447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.79■■■□□ 2.68
CRIPT-202ENST00000486447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CRIPT-202ENST00000486447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 HECW1Q76N89 1606 aa31.73■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.73■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 KCNH8Q96L42 1107 aa31.72■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.71■■■□□ 2.67
CRIPT-202ENST00000486447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.69■■■□□ 2.66
CRIPT-202ENST00000486447 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.69■■■□□ 2.66
CRIPT-202ENST00000486447 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.68■■■□□ 2.66
CRIPT-202ENST00000486447 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIPT-202ENST00000486447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIPT-202ENST00000486447 DIP2BQ9P265 1576 aa31.63■■■□□ 2.65
CRIPT-202ENST00000486447 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.59■■■□□ 2.65
CRIPT-202ENST00000486447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.56■■■□□ 2.64
CRIPT-202ENST00000486447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CRIPT-202ENST00000486447 GLI2P10070 1586 aa31.5■■■□□ 2.63
CRIPT-202ENST00000486447 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.49■■■□□ 2.63
CRIPT-202ENST00000486447 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CRIPT-202ENST00000486447 CD109Q6YHK3 1445 aa31.41■■■□□ 2.62
CRIPT-202ENST00000486447 TSPOAP1O95153 1857 aa31.38■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.38■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.38■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.611e-5■■■■□ 25.8
CRIPT-202ENST00000486447 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 TIAM1Q13009 1591 aa31.35■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 KIF14Q15058 1648 aa31.35■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.35■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 APLP2Q06481 763 aa31.33■■■□□ 2.61
CRIPT-202ENST00000486447 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.31■■■□□ 2.6
CRIPT-202ENST00000486447 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
CRIPT-202ENST00000486447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.3■■■□□ 2.6
CRIPT-202ENST00000486447 MAP3K1Q13233 1512 aa31.28■■■□□ 2.6
CRIPT-202ENST00000486447 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.26■■■□□ 2.6
CRIPT-202ENST00000486447 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.23■■■□□ 2.59
CRIPT-202ENST00000486447 PLCH2O75038 1416 aa31.2■■■□□ 2.59
CRIPT-202ENST00000486447 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.2■■■□□ 2.58
CRIPT-202ENST00000486447 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CRIPT-202ENST00000486447 NCOA2Q15596 1464 aa31.13■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 FANCAO15360 1455 aa31.12■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.12■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.1■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.09■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.57
CRIPT-202ENST00000486447 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.06■■■□□ 2.56
CRIPT-202ENST00000486447 NEO1Q92859 1461 aa31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms