RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-208ENST00000486234 JPH4Q96JJ6 628 aa21.51■■□□□ 1.03
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AUP1-208ENST00000486234 GOLGA3Q08378 1498 aa21.39■■□□□ 1.02
AUP1-208ENST00000486234 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
AUP1-208ENST00000486234 SHROOM2Q13796 1616 aa21.37■■□□□ 1.01
AUP1-208ENST00000486234 IQGAP2Q13576 1575 aa21.37■■□□□ 1.01
AUP1-208ENST00000486234 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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AUP1-208ENST00000486234 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.3■■□□□ 1
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AUP1-208ENST00000486234 ARAP1Q96P48 1450 aa21.24■□□□□ 0.99
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AUP1-208ENST00000486234 DISP1Q96F81 1524 aa21.22■□□□□ 0.99
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AUP1-208ENST00000486234 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.01■□□□□ 0.95
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AUP1-208ENST00000486234 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.34■□□□□ 0.85
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AUP1-208ENST00000486234 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-208ENST00000486234 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-208ENST00000486234 NCOA2Q15596 1464 aa20.31■□□□□ 0.84
AUP1-208ENST00000486234 AKNAQ7Z591 1439 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-208ENST00000486234 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
AUP1-208ENST00000486234 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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