RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.62■■■■□ 3.61
NBPF3-212ENST00000486229 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.58■■■■□ 3.61
NBPF3-212ENST00000486229 PRXQ9BXM0 1461 aa37.58■■■■□ 3.61
NBPF3-212ENST00000486229 NUP160Q12769 1436 aa37.47■■■■□ 3.59
NBPF3-212ENST00000486229 KIF21BO75037 1637 aa37.47■■■■□ 3.59
NBPF3-212ENST00000486229 CEP170Q5SW79 1584 aa37.39■■■■□ 3.58
NBPF3-212ENST00000486229 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.31■■■■□ 3.56
NBPF3-212ENST00000486229 GOLGA3Q08378 1498 aa37.31■■■■□ 3.56
NBPF3-212ENST00000486229 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.26■■■■□ 3.56
NBPF3-212ENST00000486229 IQGAP2Q13576 1575 aa37.2■■■■□ 3.55
NBPF3-212ENST00000486229 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
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NBPF3-212ENST00000486229 SHROOM2Q13796 1616 aa37.13■■■■□ 3.53
NBPF3-212ENST00000486229 JPH4Q96JJ6 628 aa37.12■■■■□ 3.53
NBPF3-212ENST00000486229 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.01■■■■□ 3.52
NBPF3-212ENST00000486229 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37■■■■□ 3.51
NBPF3-212ENST00000486229 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.99■■■■□ 3.51
NBPF3-212ENST00000486229 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
NBPF3-212ENST00000486229 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.92■■■■□ 3.5
NBPF3-212ENST00000486229 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.92■■■■□ 3.5
NBPF3-212ENST00000486229 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.81■■■■□ 3.48
NBPF3-212ENST00000486229 KIAA0556O60303 1618 aa36.8■■■■□ 3.48
NBPF3-212ENST00000486229 DISP1Q96F81 1524 aa36.79■■■■□ 3.48
NBPF3-212ENST00000486229 SAMD9Q5K651 1589 aa36.74■■■■□ 3.47
NBPF3-212ENST00000486229 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.74■■■■□ 3.47
NBPF3-212ENST00000486229 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
NBPF3-212ENST00000486229 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.69■■■■□ 3.46
NBPF3-212ENST00000486229 PTPRGP23470 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
NBPF3-212ENST00000486229 CLIP1P30622 1438 aa36.61■■■■□ 3.45
NBPF3-212ENST00000486229 P3H3Q8IVL6 736 aa36.56■■■■□ 3.44
NBPF3-212ENST00000486229 CEP162Q5TB80 1403 aa36.56■■■■□ 3.44
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
NBPF3-212ENST00000486229 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
NBPF3-212ENST00000486229 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.5■■■■□ 3.43
NBPF3-212ENST00000486229 FMN1Q68DA7 1419 aa36.47■■■■□ 3.43
NBPF3-212ENST00000486229 UACAQ9BZF9 1416 aa36.43■■■■□ 3.42
NBPF3-212ENST00000486229 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.38■■■■□ 3.41
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC2Q92887 1545 aa36.35■■■■□ 3.41
NBPF3-212ENST00000486229 ABCA8O94911 1581 aa36.34■■■■□ 3.41
NBPF3-212ENST00000486229 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.32■■■■□ 3.41
NBPF3-212ENST00000486229 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.32■■■■□ 3.4
NBPF3-212ENST00000486229 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.31■■■■□ 3.4
NBPF3-212ENST00000486229 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.29■■■■□ 3.4
NBPF3-212ENST00000486229 MAPKBP1O60336 1514 aa36.27■■■■□ 3.4
NBPF3-212ENST00000486229 DIP2BQ9P265 1576 aa36.23■■■■□ 3.39
NBPF3-212ENST00000486229 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.21■■■■□ 3.39
NBPF3-212ENST00000486229 HECW1Q76N89 1606 aa36.2■■■■□ 3.39
NBPF3-212ENST00000486229 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.17■■■■□ 3.38
NBPF3-212ENST00000486229 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.17■■■■□ 3.38
NBPF3-212ENST00000486229 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.14■■■■□ 3.38
NBPF3-212ENST00000486229 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.12■■■■□ 3.37
NBPF3-212ENST00000486229 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
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NBPF3-212ENST00000486229 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
NBPF3-212ENST00000486229 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.09■■■■□ 3.37
NBPF3-212ENST00000486229 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
NBPF3-212ENST00000486229 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.05■■■■□ 3.36
NBPF3-212ENST00000486229 KDM6BO15054 1643 aa36.05■■■■□ 3.36
NBPF3-212ENST00000486229 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
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NBPF3-212ENST00000486229 ATP10BO94823 1461 aa36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-212ENST00000486229 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
NBPF3-212ENST00000486229 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
NBPF3-212ENST00000486229 TSPOAP1O95153 1857 aa35.97■■■■□ 3.35
NBPF3-212ENST00000486229 ARID3CA6NKF2 412 aa35.94■■■■□ 3.34
NBPF3-212ENST00000486229 ASXL2Q76L83 1435 aa35.91■■■■□ 3.34
NBPF3-212ENST00000486229 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.91■■■■□ 3.34
NBPF3-212ENST00000486229 APLP2Q06481 763 aa35.89■■■■□ 3.34
NBPF3-212ENST00000486229 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
NBPF3-212ENST00000486229 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.87■■■■□ 3.33
NBPF3-212ENST00000486229 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.86■■■■□ 3.33
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K1Q13233 1512 aa35.8■■■■□ 3.32
NBPF3-212ENST00000486229 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.77■■■■□ 3.32
NBPF3-212ENST00000486229 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
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NBPF3-212ENST00000486229 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
NBPF3-212ENST00000486229 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
NBPF3-212ENST00000486229 GLI2P10070 1586 aa35.7■■■■□ 3.31
NBPF3-212ENST00000486229 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.69■■■■□ 3.3
NBPF3-212ENST00000486229 KCNH8Q96L42 1107 aa35.69■■■■□ 3.3
NBPF3-212ENST00000486229 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.65■■■■□ 3.3
NBPF3-212ENST00000486229 KIF14Q15058 1648 aa35.65■■■■□ 3.3
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NBPF3-212ENST00000486229 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.56■■■■□ 3.28
NBPF3-212ENST00000486229 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.55■■■■□ 3.28
NBPF3-212ENST00000486229 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.51■■■■□ 3.28
NBPF3-212ENST00000486229 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
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NBPF3-212ENST00000486229 CD109Q6YHK3 1445 aa35.49■■■■□ 3.27
NBPF3-212ENST00000486229 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.43■■■■□ 3.26
NBPF3-212ENST00000486229 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.42■■■■□ 3.26
NBPF3-212ENST00000486229 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.42■■■■□ 3.26
NBPF3-212ENST00000486229 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
NBPF3-212ENST00000486229 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.38■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.37■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 NCOA2Q15596 1464 aa35.36■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.35■■■■□ 3.25
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