RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.91■■■■□ 3.18
ACTB-212ENST00000484841 IGF1RP08069 1367 aa34.87■■■■□ 3.17
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.76■■■■□ 3.15
ACTB-212ENST00000484841 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.73■■■■□ 3.15
ACTB-212ENST00000484841 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.68■■■■□ 3.14
ACTB-212ENST00000484841 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.53■■■■□ 3.12
ACTB-212ENST00000484841 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.51■■■■□ 3.12
ACTB-212ENST00000484841 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.49■■■■□ 3.11
ACTB-212ENST00000484841 IQGAP2Q13576 1575 aa34.49■■■■□ 3.11
ACTB-212ENST00000484841 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ACTB-212ENST00000484841 PTPRGP23470 1445 aa34.45■■■■□ 3.11
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.44■■■■□ 3.1
ACTB-212ENST00000484841 MAPKBP1O60336 1514 aa34.44■■■■□ 3.1
ACTB-212ENST00000484841 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.42■■■■□ 3.1
ACTB-212ENST00000484841 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.39■■■■□ 3.1
ACTB-212ENST00000484841 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.39■■■■□ 3.1
ACTB-212ENST00000484841 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
ACTB-212ENST00000484841 DIP2BQ9P265 1576 aa34.3■■■■□ 3.08
ACTB-212ENST00000484841 DISP1Q96F81 1524 aa34.22■■■■□ 3.07
ACTB-212ENST00000484841 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.22■■■■□ 3.07
ACTB-212ENST00000484841 ABCC2Q92887 1545 aa34.21■■■■□ 3.07
ACTB-212ENST00000484841 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.21■■■■□ 3.07
ACTB-212ENST00000484841 UACAQ9BZF9 1416 aa34.18■■■■□ 3.06
ACTB-212ENST00000484841 TSPOAP1O95153 1857 aa34.18■■■■□ 3.06
ACTB-212ENST00000484841 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.15■■■■□ 3.06
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0556O60303 1618 aa34.15■■■■□ 3.06
ACTB-212ENST00000484841 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.09■■■■□ 3.05
ACTB-212ENST00000484841 ASXL2Q76L83 1435 aa34.08■■■■□ 3.05
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA3Q08378 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
ACTB-212ENST00000484841 KDM6BO15054 1643 aa34.04■■■■□ 3.04
ACTB-212ENST00000484841 PRXQ9BXM0 1461 aa34.04■■■■□ 3.04
ACTB-212ENST00000484841 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.99■■■■□ 3.03
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
ACTB-212ENST00000484841 GLI2P10070 1586 aa33.97■■■■□ 3.03
ACTB-212ENST00000484841 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ACTB-212ENST00000484841 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.91■■■■□ 3.02
ACTB-212ENST00000484841 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
ACTB-212ENST00000484841 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 EEA1Q15075 1411 aa33.81■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.79■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 ABCA8O94911 1581 aa33.79■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.78■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.77■■■■□ 3
ACTB-212ENST00000484841 P3H3Q8IVL6 736 aa33.75■■■□□ 2.99
ACTB-212ENST00000484841 KCNH8Q96L42 1107 aa33.68■■■□□ 2.98
ACTB-212ENST00000484841 SAMD9Q5K651 1589 aa33.63■■■□□ 2.97
ACTB-212ENST00000484841 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.62■■■□□ 2.97
ACTB-212ENST00000484841 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
ACTB-212ENST00000484841 ARID3CA6NKF2 412 aa33.6■■■□□ 2.97
ACTB-212ENST00000484841 CD109Q6YHK3 1445 aa33.59■■■□□ 2.97
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.53■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.53■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.52■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 ATP10BO94823 1461 aa33.51■■■□□ 2.96
ACTB-212ENST00000484841 KIF21BO75037 1637 aa33.5■■■□□ 2.95
ACTB-212ENST00000484841 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.42■■■□□ 2.94
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.38■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 ADGRL1O94910 1474 aa33.36■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.35■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.35■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.34■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.28■■■□□ 2.92
ACTB-212ENST00000484841 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.26■■■□□ 2.92
ACTB-212ENST00000484841 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.25■■■□□ 2.91
ACTB-212ENST00000484841 NEO1Q92859 1461 aa33.18■■■□□ 2.9
ACTB-212ENST00000484841 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
ACTB-212ENST00000484841 FMN1Q68DA7 1419 aa33.11■■■□□ 2.89
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEF3O95398 923 aa33.07■■■□□ 2.88
ACTB-212ENST00000484841 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.05■■■□□ 2.88
ACTB-212ENST00000484841 HECW1Q76N89 1606 aa33.05■■■□□ 2.88
ACTB-212ENST00000484841 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.03■■■□□ 2.88
ACTB-212ENST00000484841 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.02■■■□□ 2.882e-34■■■■□ 20.9
ACTB-212ENST00000484841 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
ACTB-212ENST00000484841 FANCAO15360 1455 aa32.99■■■□□ 2.87
ACTB-212ENST00000484841 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.96■■■□□ 2.87
ACTB-212ENST00000484841 AKNAQ7Z591 1439 aa32.96■■■□□ 2.87
ACTB-212ENST00000484841 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
ACTB-212ENST00000484841 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.93■■■□□ 2.86
ACTB-212ENST00000484841 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
ACTB-212ENST00000484841 RICTORQ6R327 1708 aa32.89■■■□□ 2.86
ACTB-212ENST00000484841 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.85■■■□□ 2.85
ACTB-212ENST00000484841 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.85■■■□□ 2.85
ACTB-212ENST00000484841 PLCH2O75038 1416 aa32.84■■■□□ 2.85
ACTB-212ENST00000484841 KIF14Q15058 1648 aa32.82■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 CLIP1P30622 1438 aa32.82■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.81■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.8■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.79■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.78■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ACTB-212ENST00000484841 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.76■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.76■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.74■■■□□ 2.83
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