RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481564.1

MALSU1-205, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-205ENST00000481564 IGF1RP08069 1367 aa35.77■■■■□ 3.32
MALSU1-205ENST00000481564 CUL7Q14999 1698 aa35.77■■■■□ 3.32
MALSU1-205ENST00000481564 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.74■■■■□ 3.31
MALSU1-205ENST00000481564 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.72■■■■□ 3.31
MALSU1-205ENST00000481564 MAPKBP1O60336 1514 aa35.63■■■■□ 3.29
MALSU1-205ENST00000481564 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.59■■■■□ 3.29
MALSU1-205ENST00000481564 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.57■■■■□ 3.29
MALSU1-205ENST00000481564 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.28
MALSU1-205ENST00000481564 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
MALSU1-205ENST00000481564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.51■■■■□ 3.28
MALSU1-205ENST00000481564 DIP2BQ9P265 1576 aa35.47■■■■□ 3.27
MALSU1-205ENST00000481564 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.45■■■■□ 3.27
MALSU1-205ENST00000481564 PTPRGP23470 1445 aa35.38■■■■□ 3.25
MALSU1-205ENST00000481564 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.37■■■■□ 3.25
MALSU1-205ENST00000481564 IQGAP2Q13576 1575 aa35.34■■■■□ 3.25
MALSU1-205ENST00000481564 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.34■■■■□ 3.25
MALSU1-205ENST00000481564 ABCC2Q92887 1545 aa35.26■■■■□ 3.23
MALSU1-205ENST00000481564 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.22■■■■□ 3.23
MALSU1-205ENST00000481564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.21■■■■□ 3.23
MALSU1-205ENST00000481564 DISP1Q96F81 1524 aa35.19■■■■□ 3.22
MALSU1-205ENST00000481564 KDM6BO15054 1643 aa35.17■■■■□ 3.22
MALSU1-205ENST00000481564 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
MALSU1-205ENST00000481564 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.15■■■■□ 3.22
MALSU1-205ENST00000481564 UACAQ9BZF9 1416 aa35.13■■■■□ 3.21
MALSU1-205ENST00000481564 GLI2P10070 1586 aa35.12■■■■□ 3.21
MALSU1-205ENST00000481564 TSPOAP1O95153 1857 aa35.11■■■■□ 3.21
MALSU1-205ENST00000481564 ASXL2Q76L83 1435 aa35.1■■■■□ 3.21
MALSU1-205ENST00000481564 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
MALSU1-205ENST00000481564 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.05■■■■□ 3.2
MALSU1-205ENST00000481564 KIAA0556O60303 1618 aa35.03■■■■□ 3.2
MALSU1-205ENST00000481564 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
MALSU1-205ENST00000481564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.92■■■■□ 3.18
MALSU1-205ENST00000481564 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
MALSU1-205ENST00000481564 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
MALSU1-205ENST00000481564 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.88■■■■□ 3.17
MALSU1-205ENST00000481564 GOLGA3Q08378 1498 aa34.86■■■■□ 3.17
MALSU1-205ENST00000481564 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.84■■■■□ 3.17
MALSU1-205ENST00000481564 PRXQ9BXM0 1461 aa34.84■■■■□ 3.17
MALSU1-205ENST00000481564 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.8■■■■□ 3.16
MALSU1-205ENST00000481564 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.77■■■■□ 3.16
MALSU1-205ENST00000481564 ABCA8O94911 1581 aa34.74■■■■□ 3.15
MALSU1-205ENST00000481564 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
MALSU1-205ENST00000481564 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.61■■■■□ 3.13
MALSU1-205ENST00000481564 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.6■■■■□ 3.13
MALSU1-205ENST00000481564 ADGRL1O94910 1474 aa34.55■■■■□ 3.12
MALSU1-205ENST00000481564 CD109Q6YHK3 1445 aa34.54■■■■□ 3.12
MALSU1-205ENST00000481564 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
MALSU1-205ENST00000481564 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.47■■■■□ 3.11
MALSU1-205ENST00000481564 SAMD9Q5K651 1589 aa34.45■■■■□ 3.11
MALSU1-205ENST00000481564 KCNH8Q96L42 1107 aa34.44■■■■□ 3.1
MALSU1-205ENST00000481564 ATP10BO94823 1461 aa34.41■■■■□ 3.1
MALSU1-205ENST00000481564 EEA1Q15075 1411 aa34.4■■■■□ 3.1
MALSU1-205ENST00000481564 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.35■■■■□ 3.09
MALSU1-205ENST00000481564 P3H3Q8IVL6 736 aa34.32■■■■□ 3.08
MALSU1-205ENST00000481564 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.31■■■■□ 3.08
MALSU1-205ENST00000481564 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.3■■■■□ 3.08
MALSU1-205ENST00000481564 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.3■■■■□ 3.08
MALSU1-205ENST00000481564 ARID3CA6NKF2 412 aa34.2■■■■□ 3.07
MALSU1-205ENST00000481564 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
MALSU1-205ENST00000481564 NEO1Q92859 1461 aa34.17■■■■□ 3.06
MALSU1-205ENST00000481564 KIF21BO75037 1637 aa34.13■■■■□ 3.05
MALSU1-205ENST00000481564 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.11■■■■□ 3.05
MALSU1-205ENST00000481564 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.1■■■■□ 3.05
MALSU1-205ENST00000481564 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.1■■■■□ 3.05
MALSU1-205ENST00000481564 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
MALSU1-205ENST00000481564 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
MALSU1-205ENST00000481564 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.99■■■■□ 3.03
MALSU1-205ENST00000481564 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.98■■■■□ 3.03
MALSU1-205ENST00000481564 RAPGEF3O95398 923 aa33.97■■■■□ 3.03
MALSU1-205ENST00000481564 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
MALSU1-205ENST00000481564 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.95■■■■□ 3.03
MALSU1-205ENST00000481564 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.91■■■■□ 3.02
MALSU1-205ENST00000481564 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.021e-10■■□□□ 13.6
MALSU1-205ENST00000481564 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 AKNAQ7Z591 1439 aa33.87■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 RICTORQ6R327 1708 aa33.86■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 FANCAO15360 1455 aa33.86■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 PTPRMP28827 1452 aa33.86■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.85■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.84■■■■□ 3.01
MALSU1-205ENST00000481564 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.82■■■■□ 3
MALSU1-205ENST00000481564 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.82■■■■□ 3
MALSU1-205ENST00000481564 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.79■■■■□ 3
MALSU1-205ENST00000481564 FMN1Q68DA7 1419 aa33.79■■■■□ 3
MALSU1-205ENST00000481564 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
MALSU1-205ENST00000481564 HECW1Q76N89 1606 aa33.73■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.73■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 MADDQ8WXG6 1647 aa33.72■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 PLCH2O75038 1416 aa33.71■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.7■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
MALSU1-205ENST00000481564 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.66■■■□□ 2.98
MALSU1-205ENST00000481564 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.66■■■□□ 2.98
MALSU1-205ENST00000481564 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.63■■■□□ 2.97
MALSU1-205ENST00000481564 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
MALSU1-205ENST00000481564 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.6■■■□□ 2.97
MALSU1-205ENST00000481564 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
MALSU1-205ENST00000481564 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.59■■■□□ 2.97
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