RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 JPH4Q96JJ6 628 aa41.15■■■■■ 4.18
PTPRD-210ENST00000481079 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.08■■■■■ 4.17
PTPRD-210ENST00000481079 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
PTPRD-210ENST00000481079 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.86■■■■■ 4.13
PTPRD-210ENST00000481079 IQGAP2Q13576 1575 aa40.78■■■■■ 4.12
PTPRD-210ENST00000481079 PRXQ9BXM0 1461 aa40.65■■■■■ 4.1
PTPRD-210ENST00000481079 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.63■■■■■ 4.09
PTPRD-210ENST00000481079 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.59■■■■■ 4.09
PTPRD-210ENST00000481079 DISP1Q96F81 1524 aa40.58■■■■■ 4.09
PTPRD-210ENST00000481079 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.57■■■■■ 4.09
PTPRD-210ENST00000481079 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.55■■■■■ 4.08
PTPRD-210ENST00000481079 PTPRGP23470 1445 aa40.55■■■■■ 4.08
PTPRD-210ENST00000481079 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.52■■■■■ 4.08
PTPRD-210ENST00000481079 MAPKBP1O60336 1514 aa40.45■■■■■ 4.07
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA0556O60303 1618 aa40.42■■■■■ 4.06
PTPRD-210ENST00000481079 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.42■■■■■ 4.06
PTPRD-210ENST00000481079 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.41■■■■■ 4.06
PTPRD-210ENST00000481079 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
PTPRD-210ENST00000481079 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PTPRD-210ENST00000481079 EEA1Q15075 1411 aa40.36■■■■■ 4.05
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.32■■■■■ 4.05
PTPRD-210ENST00000481079 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.31■■■■■ 4.04
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC2Q92887 1545 aa40.3■■■■■ 4.04
PTPRD-210ENST00000481079 UACAQ9BZF9 1416 aa40.28■■■■■ 4.04
PTPRD-210ENST00000481079 DIP2BQ9P265 1576 aa40.26■■■■■ 4.04
PTPRD-210ENST00000481079 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.25■■■■■ 4.03
PTPRD-210ENST00000481079 GOLGA3Q08378 1498 aa40.23■■■■■ 4.03
PTPRD-210ENST00000481079 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.19■■■■■ 4.02
PTPRD-210ENST00000481079 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.13■■■■■ 4.01
PTPRD-210ENST00000481079 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PTPRD-210ENST00000481079 ASXL2Q76L83 1435 aa40.08■■■■■ 4.01
PTPRD-210ENST00000481079 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.07■■■■■ 4.01
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PTPRD-210ENST00000481079 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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PTPRD-210ENST00000481079 P3H3Q8IVL6 736 aa39.91■■■■□ 3.98
PTPRD-210ENST00000481079 TSPOAP1O95153 1857 aa39.88■■■■□ 3.97
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PTPRD-210ENST00000481079 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.79■■■■□ 3.96
PTPRD-210ENST00000481079 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.74■■■■□ 3.95
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PTPRD-210ENST00000481079 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.71■■■■□ 3.95
PTPRD-210ENST00000481079 KDM6BO15054 1643 aa39.69■■■■□ 3.94
PTPRD-210ENST00000481079 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.69■■■■□ 3.94
PTPRD-210ENST00000481079 ATP10BO94823 1461 aa39.68■■■■□ 3.94
PTPRD-210ENST00000481079 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.68■■■■□ 3.94
PTPRD-210ENST00000481079 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.64■■■■□ 3.94
PTPRD-210ENST00000481079 ARID3CA6NKF2 412 aa39.6■■■■□ 3.93
PTPRD-210ENST00000481079 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
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PTPRD-210ENST00000481079 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.52■■■■□ 3.92
PTPRD-210ENST00000481079 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.51■■■■□ 3.92
PTPRD-210ENST00000481079 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
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PTPRD-210ENST00000481079 CD109Q6YHK3 1445 aa39.46■■■■□ 3.91
PTPRD-210ENST00000481079 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.45■■■■□ 3.91
PTPRD-210ENST00000481079 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.36■■■■□ 3.89
PTPRD-210ENST00000481079 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
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PTPRD-210ENST00000481079 FMN1Q68DA7 1419 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPRD-210ENST00000481079 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
PTPRD-210ENST00000481079 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
PTPRD-210ENST00000481079 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.19■■■■□ 3.86
PTPRD-210ENST00000481079 HECW1Q76N89 1606 aa39.18■■■■□ 3.86
PTPRD-210ENST00000481079 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.13■■■■□ 3.85
PTPRD-210ENST00000481079 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.09■■■■□ 3.85
PTPRD-210ENST00000481079 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.06■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.06■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.06■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 NEO1Q92859 1461 aa39.05■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.04■■■■□ 3.84
PTPRD-210ENST00000481079 CLIP1P30622 1438 aa38.99■■■■□ 3.83
PTPRD-210ENST00000481079 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
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PTPRD-210ENST00000481079 FANCAO15360 1455 aa38.88■■■■□ 3.81
PTPRD-210ENST00000481079 ADGRL1O94910 1474 aa38.88■■■■□ 3.81
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PTPRD-210ENST00000481079 RAPGEF3O95398 923 aa38.87■■■■□ 3.81
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PTPRD-210ENST00000481079 RICTORQ6R327 1708 aa38.77■■■■□ 3.8
PTPRD-210ENST00000481079 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
PTPRD-210ENST00000481079 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.76■■■■□ 3.8
PTPRD-210ENST00000481079 CEP162Q5TB80 1403 aa38.72■■■■□ 3.79
PTPRD-210ENST00000481079 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.63■■■■□ 3.78
PTPRD-210ENST00000481079 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.62■■■■□ 3.77
PTPRD-210ENST00000481079 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.62■■■■□ 3.77
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.6■■■■□ 3.77
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