RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.87□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 JPH4Q96JJ6 628 aa13.87□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 SHROOM2Q13796 1616 aa13.86□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 CUL7Q14999 1698 aa13.84□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 IGF1RP08069 1367 aa13.83□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.83□□□□□ -0.2
CTPS1-209ENST00000480420 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.8□□□□□ -0.2
CTPS1-209ENST00000480420 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.75□□□□□ -0.21
CTPS1-209ENST00000480420 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CTPS1-209ENST00000480420 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CTPS1-209ENST00000480420 IQGAP2Q13576 1575 aa13.69□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRGP23470 1445 aa13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 DIP2BQ9P265 1576 aa13.66□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 TSPOAP1O95153 1857 aa13.65□□□□□ -0.22
CTPS1-209ENST00000480420 MAPKBP1O60336 1514 aa13.64□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 KDM6BO15054 1643 aa13.63□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.62□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.62□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.61□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTPS1-209ENST00000480420 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 DISP1Q96F81 1524 aa13.56□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 P3H3Q8IVL6 736 aa13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0556O60303 1618 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 UACAQ9BZF9 1416 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC2Q92887 1545 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.53□□□□□ -0.24
CTPS1-209ENST00000480420 ARID3CA6NKF2 412 aa13.52□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 ASXL2Q76L83 1435 aa13.52□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.51□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA3Q08378 1498 aa13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 PRXQ9BXM0 1461 aa13.48□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.48□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 KCNH8Q96L42 1107 aa13.47□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.47□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 ADGRL1O94910 1474 aa13.46□□□□□ -0.25
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.43□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.42□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 GLI2P10070 1586 aa13.4□□□□□ -0.26
CTPS1-209ENST00000480420 EEA1Q15075 1411 aa13.39□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA8O94911 1581 aa13.38□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.38□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.37□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.35□□□□□ -0.27
CTPS1-209ENST00000480420 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.33□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 SAMD9Q5K651 1589 aa13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 CD109Q6YHK3 1445 aa13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 KIF21BO75037 1637 aa13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 ATP10BO94823 1461 aa13.29□□□□□ -0.28
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-209ENST00000480420 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-209ENST00000480420 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-209ENST00000480420 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-209ENST00000480420 RAPGEF3O95398 923 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-209ENST00000480420 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO41Q8TF61 875 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 FMN1Q68DA7 1419 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 HECW1Q76N89 1606 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 NEO1Q92859 1461 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 FANCAO15360 1455 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.08□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 AKNAQ7Z591 1439 aa13.07□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRMP28827 1452 aa13.07□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.07□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.06□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 KIF14Q15058 1648 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 MLECQ14165 292 aa13.04□□□□□ -0.32
CTPS1-209ENST00000480420 RICTORQ6R327 1708 aa13.04□□□□□ -0.32
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