RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478424.5

ARF1-209, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 1,059 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-209ENST00000478424 IGF1RP08069 1367 aa43.18■■■■■ 4.5
ARF1-209ENST00000478424 CUL7Q14999 1698 aa43.14■■■■■ 4.5
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ARF1-209ENST00000478424 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.96■■■■■ 4.47
ARF1-209ENST00000478424 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.44
ARF1-209ENST00000478424 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
ARF1-209ENST00000478424 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.75■■■■■ 4.43
ARF1-209ENST00000478424 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.71■■■■■ 4.43
ARF1-209ENST00000478424 IQGAP2Q13576 1575 aa42.67■■■■■ 4.42
ARF1-209ENST00000478424 PTPRGP23470 1445 aa42.63■■■■■ 4.42
ARF1-209ENST00000478424 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.63■■■■■ 4.42
ARF1-209ENST00000478424 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.61■■■■■ 4.41
ARF1-209ENST00000478424 MAPKBP1O60336 1514 aa42.61■■■■■ 4.41
ARF1-209ENST00000478424 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.59■■■■■ 4.41
ARF1-209ENST00000478424 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.56■■■■■ 4.4
ARF1-209ENST00000478424 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.54■■■■■ 4.4
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ARF1-209ENST00000478424 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
ARF1-209ENST00000478424 DISP1Q96F81 1524 aa42.4■■■■■ 4.38
ARF1-209ENST00000478424 ABCC2Q92887 1545 aa42.35■■■■■ 4.37
ARF1-209ENST00000478424 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.34■■■■■ 4.37
ARF1-209ENST00000478424 TSPOAP1O95153 1857 aa42.29■■■■■ 4.36
ARF1-209ENST00000478424 UACAQ9BZF9 1416 aa42.29■■■■■ 4.36
ARF1-209ENST00000478424 KIAA0556O60303 1618 aa42.28■■■■■ 4.36
ARF1-209ENST00000478424 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.25■■■■■ 4.35
ARF1-209ENST00000478424 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
ARF1-209ENST00000478424 ASXL2Q76L83 1435 aa42.22■■■■■ 4.35
ARF1-209ENST00000478424 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.16■■■■■ 4.34
ARF1-209ENST00000478424 KDM6BO15054 1643 aa42.13■■■■■ 4.34
ARF1-209ENST00000478424 PRXQ9BXM0 1461 aa42.13■■■■■ 4.34
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ARF1-209ENST00000478424 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.05■■■■■ 4.32
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ARF1-209ENST00000478424 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.8■■■■■ 4.28
ARF1-209ENST00000478424 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
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ARF1-209ENST00000478424 EEA1Q15075 1411 aa41.73■■■■■ 4.27
ARF1-209ENST00000478424 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.72■■■■■ 4.27
ARF1-209ENST00000478424 KCNH8Q96L42 1107 aa41.71■■■■■ 4.27
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ARF1-209ENST00000478424 SAMD9Q5K651 1589 aa41.6■■■■■ 4.25
ARF1-209ENST00000478424 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
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ARF1-209ENST00000478424 CD109Q6YHK3 1445 aa41.56■■■■■ 4.24
ARF1-209ENST00000478424 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.53■■■■■ 4.24
ARF1-209ENST00000478424 ATP10BO94823 1461 aa41.49■■■■■ 4.23
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ARF1-209ENST00000478424 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.45■■■■■ 4.23
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ARF1-209ENST00000478424 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
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ARF1-209ENST00000478424 FANCAO15360 1455 aa40.83■■■■■ 4.13
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ARF1-209ENST00000478424 PTPRMP28827 1452 aa40.53■■■■■ 4.08
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