RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478021.1

TRAF4-211, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 718 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-211ENST00000478021 JPH4Q96JJ6 628 aa38.56■■■■□ 3.76
TRAF4-211ENST00000478021 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
TRAF4-211ENST00000478021 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.53■■■■□ 3.76
TRAF4-211ENST00000478021 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.47■■■■□ 3.75
TRAF4-211ENST00000478021 IQGAP2Q13576 1575 aa38.33■■■■□ 3.73
TRAF4-211ENST00000478021 PRXQ9BXM0 1461 aa38.26■■■■□ 3.72
TRAF4-211ENST00000478021 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.23■■■■□ 3.71
TRAF4-211ENST00000478021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
TRAF4-211ENST00000478021 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.2■■■■□ 3.71
TRAF4-211ENST00000478021 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.17■■■■□ 3.7
TRAF4-211ENST00000478021 EEA1Q15075 1411 aa38.13■■■■□ 3.7
TRAF4-211ENST00000478021 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.12■■■■□ 3.69
TRAF4-211ENST00000478021 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
TRAF4-211ENST00000478021 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
TRAF4-211ENST00000478021 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.08■■■■□ 3.69
TRAF4-211ENST00000478021 DISP1Q96F81 1524 aa38.07■■■■□ 3.69
TRAF4-211ENST00000478021 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.04■■■■□ 3.68
TRAF4-211ENST00000478021 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.03■■■■□ 3.68
TRAF4-211ENST00000478021 PTPRGP23470 1445 aa38.03■■■■□ 3.68
TRAF4-211ENST00000478021 KIAA0556O60303 1618 aa37.99■■■■□ 3.67
TRAF4-211ENST00000478021 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
TRAF4-211ENST00000478021 GOLGA3Q08378 1498 aa37.84■■■■□ 3.65
TRAF4-211ENST00000478021 KIF21BO75037 1637 aa37.83■■■■□ 3.65
TRAF4-211ENST00000478021 UACAQ9BZF9 1416 aa37.78■■■■□ 3.64
TRAF4-211ENST00000478021 MAPKBP1O60336 1514 aa37.77■■■■□ 3.64
TRAF4-211ENST00000478021 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.75■■■■□ 3.63
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC2Q92887 1545 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAF4-211ENST00000478021 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAF4-211ENST00000478021 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.71■■■■□ 3.63
TRAF4-211ENST00000478021 P3H3Q8IVL6 736 aa37.67■■■■□ 3.62
TRAF4-211ENST00000478021 SAMD9Q5K651 1589 aa37.64■■■■□ 3.62
TRAF4-211ENST00000478021 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.63■■■■□ 3.61
TRAF4-211ENST00000478021 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.63■■■■□ 3.61
TRAF4-211ENST00000478021 DIP2BQ9P265 1576 aa37.61■■■■□ 3.61
TRAF4-211ENST00000478021 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.58■■■■□ 3.61
TRAF4-211ENST00000478021 ABCA8O94911 1581 aa37.57■■■■□ 3.6
TRAF4-211ENST00000478021 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
TRAF4-211ENST00000478021 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.56■■■■□ 3.6
TRAF4-211ENST00000478021 ASXL2Q76L83 1435 aa37.53■■■■□ 3.6
TRAF4-211ENST00000478021 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
TRAF4-211ENST00000478021 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.44■■■■□ 3.58
TRAF4-211ENST00000478021 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.4■■■■□ 3.58
TRAF4-211ENST00000478021 TSPOAP1O95153 1857 aa37.39■■■■□ 3.58
TRAF4-211ENST00000478021 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.36■■■■□ 3.57
TRAF4-211ENST00000478021 ARID3CA6NKF2 412 aa37.34■■■■□ 3.57
TRAF4-211ENST00000478021 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
TRAF4-211ENST00000478021 GLI2P10070 1586 aa37.3■■■■□ 3.56
TRAF4-211ENST00000478021 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.3■■■■□ 3.56
TRAF4-211ENST00000478021 ATP10BO94823 1461 aa37.24■■■■□ 3.55
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.21■■■■□ 3.55
TRAF4-211ENST00000478021 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
TRAF4-211ENST00000478021 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
TRAF4-211ENST00000478021 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.18■■■■□ 3.54
TRAF4-211ENST00000478021 KCNH8Q96L42 1107 aa37.14■■■■□ 3.54
TRAF4-211ENST00000478021 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
TRAF4-211ENST00000478021 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TRAF4-211ENST00000478021 KDM6BO15054 1643 aa37.09■■■■□ 3.53
TRAF4-211ENST00000478021 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.04■■■■□ 3.52
TRAF4-211ENST00000478021 FMN1Q68DA7 1419 aa37.03■■■■□ 3.52
TRAF4-211ENST00000478021 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.97■■■■□ 3.51
TRAF4-211ENST00000478021 CD109Q6YHK3 1445 aa36.97■■■■□ 3.51
TRAF4-211ENST00000478021 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
TRAF4-211ENST00000478021 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
TRAF4-211ENST00000478021 HECW1Q76N89 1606 aa36.96■■■■□ 3.51
TRAF4-211ENST00000478021 CLIP1P30622 1438 aa36.91■■■■□ 3.5
TRAF4-211ENST00000478021 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.9■■■■□ 3.5
TRAF4-211ENST00000478021 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.89■■■■□ 3.5
TRAF4-211ENST00000478021 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.87■■■■□ 3.49
TRAF4-211ENST00000478021 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
TRAF4-211ENST00000478021 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
TRAF4-211ENST00000478021 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.82■■■■□ 3.49
TRAF4-211ENST00000478021 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
TRAF4-211ENST00000478021 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.74■■■■□ 3.47
TRAF4-211ENST00000478021 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.472e-6■■■□□ 19
TRAF4-211ENST00000478021 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.71■■■■□ 3.47
TRAF4-211ENST00000478021 CEP162Q5TB80 1403 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAF4-211ENST00000478021 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAF4-211ENST00000478021 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.65■■■■□ 3.46
TRAF4-211ENST00000478021 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
TRAF4-211ENST00000478021 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.62■■■■□ 3.45
TRAF4-211ENST00000478021 KIF14Q15058 1648 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAF4-211ENST00000478021 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
TRAF4-211ENST00000478021 NEO1Q92859 1461 aa36.57■■■■□ 3.45
TRAF4-211ENST00000478021 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.57■■■■□ 3.44
TRAF4-211ENST00000478021 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.52■■■■□ 3.44
TRAF4-211ENST00000478021 FANCAO15360 1455 aa36.5■■■■□ 3.43
TRAF4-211ENST00000478021 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.49■■■■□ 3.43
TRAF4-211ENST00000478021 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.48■■■■□ 3.43
TRAF4-211ENST00000478021 AKNAQ7Z591 1439 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAF4-211ENST00000478021 PLCH2O75038 1416 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAF4-211ENST00000478021 RAPGEF3O95398 923 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAF4-211ENST00000478021 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAF4-211ENST00000478021 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TRAF4-211ENST00000478021 RICTORQ6R327 1708 aa36.34■■■■□ 3.41
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAF4-211ENST00000478021 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAF4-211ENST00000478021 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAF4-211ENST00000478021 ADGRL1O94910 1474 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAF4-211ENST00000478021 PREX2Q70Z35 1606 aa36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms