RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.79■■■□□ 2.84
ACTB-210ENST00000477812 SHROOM2Q13796 1616 aa32.79■■■□□ 2.84
ACTB-210ENST00000477812 IQGAP2Q13576 1575 aa32.77■■■□□ 2.84
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.72■■■□□ 2.83
ACTB-210ENST00000477812 JPH4Q96JJ6 628 aa32.66■■■□□ 2.82
ACTB-210ENST00000477812 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.66■■■□□ 2.82
ACTB-210ENST00000477812 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.65■■■□□ 2.82
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF11O15085 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
ACTB-210ENST00000477812 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
ACTB-210ENST00000477812 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.59■■■□□ 2.81
ACTB-210ENST00000477812 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
ACTB-210ENST00000477812 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.55■■■□□ 2.8
ACTB-210ENST00000477812 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.55■■■□□ 2.8
ACTB-210ENST00000477812 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.55■■■□□ 2.8
ACTB-210ENST00000477812 DISP1Q96F81 1524 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-210ENST00000477812 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-210ENST00000477812 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.5■■■□□ 2.79
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0556O60303 1618 aa32.47■■■□□ 2.79
ACTB-210ENST00000477812 SAMD9Q5K651 1589 aa32.46■■■□□ 2.79
ACTB-210ENST00000477812 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.44■■■□□ 2.78
ACTB-210ENST00000477812 ARAP1Q96P48 1450 aa32.42■■■□□ 2.78
ACTB-210ENST00000477812 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.39■■■□□ 2.78
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.33■■■□□ 2.77
ACTB-210ENST00000477812 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
ACTB-210ENST00000477812 CEP162Q5TB80 1403 aa32.27■■■□□ 2.76
ACTB-210ENST00000477812 CLIP1P30622 1438 aa32.26■■■□□ 2.75
ACTB-210ENST00000477812 PTPRGP23470 1445 aa32.25■■■□□ 2.75
ACTB-210ENST00000477812 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.25■■■□□ 2.75
ACTB-210ENST00000477812 P3H3Q8IVL6 736 aa32.22■■■□□ 2.75
ACTB-210ENST00000477812 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.18■■■□□ 2.74
ACTB-210ENST00000477812 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
ACTB-210ENST00000477812 ABCA8O94911 1581 aa32.1■■■□□ 2.73
ACTB-210ENST00000477812 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.09■■■□□ 2.73
ACTB-210ENST00000477812 UACAQ9BZF9 1416 aa32.08■■■□□ 2.73
ACTB-210ENST00000477812 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.08■■■□□ 2.73
ACTB-210ENST00000477812 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.06■■■□□ 2.72
ACTB-210ENST00000477812 FMN1Q68DA7 1419 aa32.04■■■□□ 2.72
ACTB-210ENST00000477812 ABCC2Q92887 1545 aa32.04■■■□□ 2.72
ACTB-210ENST00000477812 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.99■■■□□ 2.71
ACTB-210ENST00000477812 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
ACTB-210ENST00000477812 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
ACTB-210ENST00000477812 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.9■■■□□ 2.7
ACTB-210ENST00000477812 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.89■■■□□ 2.7
ACTB-210ENST00000477812 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.85■■■□□ 2.69
ACTB-210ENST00000477812 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-210ENST00000477812 HECW1Q76N89 1606 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-210ENST00000477812 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
ACTB-210ENST00000477812 ATP10BO94823 1461 aa31.8■■■□□ 2.68
ACTB-210ENST00000477812 MAPKBP1O60336 1514 aa31.76■■■□□ 2.68
ACTB-210ENST00000477812 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
ACTB-210ENST00000477812 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.76■■■□□ 2.67
ACTB-210ENST00000477812 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
ACTB-210ENST00000477812 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
ACTB-210ENST00000477812 ARID3CA6NKF2 412 aa31.71■■■□□ 2.67
ACTB-210ENST00000477812 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.68■■■□□ 2.66
ACTB-210ENST00000477812 ASXL2Q76L83 1435 aa31.66■■■□□ 2.66
ACTB-210ENST00000477812 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
ACTB-210ENST00000477812 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-210ENST00000477812 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.56■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.54■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K1Q13233 1512 aa31.53■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 TIAM1Q13009 1591 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 DIP2BQ9P265 1576 aa31.51■■■□□ 2.64
ACTB-210ENST00000477812 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.47■■■□□ 2.63
ACTB-210ENST00000477812 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
ACTB-210ENST00000477812 GLI2P10070 1586 aa31.44■■■□□ 2.62
ACTB-210ENST00000477812 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.43■■■□□ 2.62
ACTB-210ENST00000477812 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.39■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 KIF14Q15058 1648 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.36■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 KCNH8Q96L42 1107 aa31.36■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.34■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.612e-34■■■■□ 20.9
ACTB-210ENST00000477812 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.32■■■□□ 2.6
ACTB-210ENST00000477812 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.3■■■□□ 2.6
ACTB-210ENST00000477812 APLP2Q06481 763 aa31.29■■■□□ 2.6
ACTB-210ENST00000477812 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
ACTB-210ENST00000477812 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ACTB-210ENST00000477812 CD109Q6YHK3 1445 aa31.21■■■□□ 2.59
ACTB-210ENST00000477812 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ACTB-210ENST00000477812 NCOA2Q15596 1464 aa31.2■■■□□ 2.58
ACTB-210ENST00000477812 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.14■■■□□ 2.58
ACTB-210ENST00000477812 PLCH2O75038 1416 aa31.14■■■□□ 2.58
ACTB-210ENST00000477812 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.14■■■□□ 2.57
ACTB-210ENST00000477812 TSPOAP1O95153 1857 aa31.12■■■□□ 2.57
ACTB-210ENST00000477812 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ACTB-210ENST00000477812 PREX2Q70Z35 1606 aa31.12■■■□□ 2.57
ACTB-210ENST00000477812 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.12■■■□□ 2.57
ACTB-210ENST00000477812 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.07■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.07■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.07■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 FANCAO15360 1455 aa31.03■■■□□ 2.56
ACTB-210ENST00000477812 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.03■■■□□ 2.56
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