RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 CUL7Q14999 1698 aa42.35■■■■■ 4.37
SOBP-202ENST00000477448 PRXQ9BXM0 1461 aa42.34■■■■■ 4.37
SOBP-202ENST00000477448 ARAP1Q96P48 1450 aa42.31■■■■■ 4.36
SOBP-202ENST00000477448 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.25■■■■■ 4.35
SOBP-202ENST00000477448 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.24■■■■■ 4.35
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA3Q08378 1498 aa42.2■■■■■ 4.35
SOBP-202ENST00000477448 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.19■■■■■ 4.34
SOBP-202ENST00000477448 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.15■■■■■ 4.34
SOBP-202ENST00000477448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
SOBP-202ENST00000477448 JPH4Q96JJ6 628 aa42.04■■■■■ 4.32
SOBP-202ENST00000477448 SHROOM2Q13796 1616 aa42.02■■■■■ 4.32
SOBP-202ENST00000477448 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
SOBP-202ENST00000477448 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
SOBP-202ENST00000477448 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.9■■■■■ 4.3
SOBP-202ENST00000477448 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.89■■■■■ 4.3
SOBP-202ENST00000477448 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.81■■■■■ 4.28
SOBP-202ENST00000477448 CEP162Q5TB80 1403 aa41.61■■■■■ 4.25
SOBP-202ENST00000477448 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
SOBP-202ENST00000477448 IQGAP2Q13576 1575 aa41.6■■■■■ 4.25
SOBP-202ENST00000477448 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.23
SOBP-202ENST00000477448 CLIP1P30622 1438 aa41.46■■■■■ 4.23
SOBP-202ENST00000477448 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.43■■■■■ 4.22
SOBP-202ENST00000477448 DISP1Q96F81 1524 aa41.4■■■■■ 4.22
SOBP-202ENST00000477448 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
SOBP-202ENST00000477448 PTPRGP23470 1445 aa41.39■■■■■ 4.22
SOBP-202ENST00000477448 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.37■■■■■ 4.21
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.32■■■■■ 4.2
SOBP-202ENST00000477448 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.3■■■■■ 4.2
SOBP-202ENST00000477448 SAMD9Q5K651 1589 aa41.29■■■■■ 4.2
SOBP-202ENST00000477448 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.28■■■■■ 4.2
SOBP-202ENST00000477448 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
SOBP-202ENST00000477448 KIAA0556O60303 1618 aa41.22■■■■■ 4.19
SOBP-202ENST00000477448 P3H3Q8IVL6 736 aa41.08■■■■■ 4.17
SOBP-202ENST00000477448 UACAQ9BZF9 1416 aa41.08■■■■■ 4.17
SOBP-202ENST00000477448 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.06■■■■■ 4.16
SOBP-202ENST00000477448 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.01■■■■■ 4.16
SOBP-202ENST00000477448 MAPKBP1O60336 1514 aa41■■■■■ 4.15
SOBP-202ENST00000477448 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.99■■■■■ 4.15
SOBP-202ENST00000477448 ABCC2Q92887 1545 aa40.99■■■■■ 4.15
SOBP-202ENST00000477448 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.94■■■■■ 4.14
SOBP-202ENST00000477448 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.94■■■■■ 4.14
SOBP-202ENST00000477448 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.92■■■■■ 4.14
SOBP-202ENST00000477448 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.9■■■■■ 4.14
SOBP-202ENST00000477448 FMN1Q68DA7 1419 aa40.86■■■■■ 4.13
SOBP-202ENST00000477448 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.83■■■■■ 4.13
SOBP-202ENST00000477448 ASXL2Q76L83 1435 aa40.81■■■■■ 4.12
SOBP-202ENST00000477448 DIP2BQ9P265 1576 aa40.81■■■■■ 4.12
SOBP-202ENST00000477448 ABCA8O94911 1581 aa40.8■■■■■ 4.12
SOBP-202ENST00000477448 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
SOBP-202ENST00000477448 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SOBP-202ENST00000477448 ARID3CA6NKF2 412 aa40.71■■■■■ 4.11
SOBP-202ENST00000477448 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.7■■■■■ 4.11
SOBP-202ENST00000477448 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.7■■■■■ 4.11
SOBP-202ENST00000477448 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.62■■■■■ 4.09
SOBP-202ENST00000477448 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.59■■■■■ 4.09
SOBP-202ENST00000477448 HECW1Q76N89 1606 aa40.59■■■■■ 4.09
SOBP-202ENST00000477448 TSPOAP1O95153 1857 aa40.56■■■■■ 4.08
SOBP-202ENST00000477448 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
SOBP-202ENST00000477448 ATP10BO94823 1461 aa40.54■■■■■ 4.08
SOBP-202ENST00000477448 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.51■■■■■ 4.08
SOBP-202ENST00000477448 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.5■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 GLI2P10070 1586 aa40.5■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 KCNH8Q96L42 1107 aa40.5■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 TIAM1Q13009 1591 aa40.47■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 MAP3K1Q13233 1512 aa40.47■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 APLP2Q06481 763 aa40.47■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SOBP-202ENST00000477448 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
SOBP-202ENST00000477448 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
SOBP-202ENST00000477448 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.41■■■■■ 4.06
SOBP-202ENST00000477448 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SOBP-202ENST00000477448 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
SOBP-202ENST00000477448 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.32■■■■■ 4.05
SOBP-202ENST00000477448 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
SOBP-202ENST00000477448 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.25■■■■■ 4.03
SOBP-202ENST00000477448 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SOBP-202ENST00000477448 CD109Q6YHK3 1445 aa40.22■■■■■ 4.03
SOBP-202ENST00000477448 KDM6BO15054 1643 aa40.21■■■■■ 4.03
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.16■■■■■ 4.02
SOBP-202ENST00000477448 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.16■■■■■ 4.02
SOBP-202ENST00000477448 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.12■■■■■ 4.01
SOBP-202ENST00000477448 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.12■■■■■ 4.01
SOBP-202ENST00000477448 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
SOBP-202ENST00000477448 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.09■■■■■ 4.01
SOBP-202ENST00000477448 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.04■■■■■ 4
SOBP-202ENST00000477448 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
SOBP-202ENST00000477448 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
SOBP-202ENST00000477448 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
SOBP-202ENST00000477448 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
SOBP-202ENST00000477448 NCOA2Q15596 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
SOBP-202ENST00000477448 KIF14Q15058 1648 aa39.86■■■■□ 3.97
SOBP-202ENST00000477448 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.82■■■■□ 3.97
SOBP-202ENST00000477448 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.8■■■■□ 3.96
SOBP-202ENST00000477448 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
SOBP-202ENST00000477448 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.75■■■■□ 3.95
SOBP-202ENST00000477448 NEO1Q92859 1461 aa39.73■■■■□ 3.95
SOBP-202ENST00000477448 RAPGEF3O95398 923 aa39.71■■■■□ 3.95
SOBP-202ENST00000477448 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.67■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 FANCAO15360 1455 aa39.67■■■■□ 3.94
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