RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, human

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ARHGEF3-208	ENST00000477440	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ARHGEF3-208	ENST00000477440	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ARHGEF3-208	ENST00000477440	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.63	■■■■■ 4.41
ARHGEF3-208	ENST00000477440	EEA1	Q15075	1411 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
ARHGEF3-208	ENST00000477440	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ARHGEF3-208	ENST00000477440	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.32	■■■■■ 4.37
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.32	■■■■■ 4.37
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KIF21B	O75037	1637 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PTPRG	P23470	1445 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.14	■■■■■ 4.34
ARHGEF3-208	ENST00000477440	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
ARHGEF3-208	ENST00000477440	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARHGEF3-208	ENST00000477440	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.93	■■■■■ 4.3
ARHGEF3-208	ENST00000477440	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.91	■■■■■ 4.3
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.9	■■■■■ 4.3
ARHGEF3-208	ENST00000477440	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ARHGEF3-208	ENST00000477440	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.88	■■■■■ 4.29
ARHGEF3-208	ENST00000477440	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.87	■■■■■ 4.29
ARHGEF3-208	ENST00000477440	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.81	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.8	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.79	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ABCA8	O94911	1581 aa		41.76	■■■■■ 4.28
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ARHGEF3-208	ENST00000477440	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.7	■■■■■ 4.27
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.7	■■■■■ 4.27
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.67	■■■■■ 4.26
ARHGEF3-208	ENST00000477440	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.67	■■■■■ 4.26
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.66	■■■■■ 4.26
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.6	■■■■■ 4.25
ARHGEF3-208	ENST00000477440	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.55	■■■■■ 4.24
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.52	■■■■■ 4.24
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.5	■■■■■ 4.23
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.39	■■■■■ 4.22
ARHGEF3-208	ENST00000477440	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.39	■■■■■ 4.22
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ATP10B	O94823	1461 aa		41.38	■■■■■ 4.21
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.38	■■■■■ 4.21
ARHGEF3-208	ENST00000477440	GLI2	P10070	1586 aa		41.37	■■■■■ 4.21
ARHGEF3-208	ENST00000477440	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.37	■■■■■ 4.21
ARHGEF3-208	ENST00000477440	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.37	■■■■■ 4.21
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.27	■■■■■ 4.2
ARHGEF3-208	ENST00000477440	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.24	■■■■■ 4.19
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CLIP1	P30622	1438 aa		41.19	■■■■■ 4.18
ARHGEF3-208	ENST00000477440	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.16	■■■■■ 4.18
ARHGEF3-208	ENST00000477440	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.14	■■■■■ 4.18
ARHGEF3-208	ENST00000477440	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.13	■■■■■ 4.17
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.11	■■■■■ 4.17
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.11	■■■■■ 4.17
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
ARHGEF3-208	ENST00000477440	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.06	■■■■■ 4.16
ARHGEF3-208	ENST00000477440	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.03	■■■■■ 4.16
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.01	■■■■■ 4.16
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KDM6B	O15054	1643 aa		41	■■■■■ 4.15
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.99	■■■■■ 4.15
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.97	■■■■■ 4.15
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.96	■■■■■ 4.15
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.95	■■■■■ 4.15
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.93	■■■■■ 4.14
ARHGEF3-208	ENST00000477440	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.92	■■■■■ 4.14
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.89	■■■■■ 4.14
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.81	■■■■■ 4.12
ARHGEF3-208	ENST00000477440	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.8	■■■■■ 4.12	2e-6	■■■■■ 51.7
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.78	■■■■■ 4.12
ARHGEF3-208	ENST00000477440	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
ARHGEF3-208	ENST00000477440	KIF14	Q15058	1648 aa		40.71	■■■■■ 4.11
ARHGEF3-208	ENST00000477440	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
ARHGEF3-208	ENST00000477440	NEO1	Q92859	1461 aa		40.59	■■■■■ 4.09
ARHGEF3-208	ENST00000477440	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.59	■■■■■ 4.09
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.57	■■■■■ 4.08
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FANCA	O15360	1455 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ARHGEF3-208	ENST00000477440	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.51	■■■■■ 4.08
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PLCH2	O75038	1416 aa		40.49	■■■■■ 4.07
ARHGEF3-208	ENST00000477440	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.43	■■■■■ 4.06
ARHGEF3-208	ENST00000477440	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.4	■■■■■ 4.06
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.4	■■■■■ 4.06
ARHGEF3-208	ENST00000477440	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.38	■■■■■ 4.06
ARHGEF3-208	ENST00000477440	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.37	■■■■■ 4.05
ARHGEF3-208	ENST00000477440	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.36	■■■■■ 4.05
ARHGEF3-208	ENST00000477440	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.36	■■■■■ 4.05
ARHGEF3-208	ENST00000477440	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ARHGEF3-208	ENST00000477440	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ARHGEF3-208	ENST00000477440	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.34	■■■■■ 4.05

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