RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477001.1

SEMA5B-210, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-210ENST00000477001 PRXQ9BXM0 1461 aa35.92■■■■□ 3.34
SEMA5B-210ENST00000477001 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA5B-210ENST00000477001 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.84■■■■□ 3.33
SEMA5B-210ENST00000477001 ARAP1Q96P48 1450 aa35.83■■■■□ 3.33
SEMA5B-210ENST00000477001 JPH4Q96JJ6 628 aa35.77■■■■□ 3.32
SEMA5B-210ENST00000477001 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.75■■■■□ 3.31
SEMA5B-210ENST00000477001 IQGAP2Q13576 1575 aa35.73■■■■□ 3.31
SEMA5B-210ENST00000477001 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
SEMA5B-210ENST00000477001 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA5B-210ENST00000477001 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.65■■■■□ 3.3
SEMA5B-210ENST00000477001 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SEMA5B-210ENST00000477001 KIF21BO75037 1637 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA5B-210ENST00000477001 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.57■■■■□ 3.28
SEMA5B-210ENST00000477001 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.49■■■■□ 3.27
SEMA5B-210ENST00000477001 DISP1Q96F81 1524 aa35.46■■■■□ 3.27
SEMA5B-210ENST00000477001 KIAA0556O60303 1618 aa35.4■■■■□ 3.26
SEMA5B-210ENST00000477001 GOLGA3Q08378 1498 aa35.38■■■■□ 3.25
SEMA5B-210ENST00000477001 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.38■■■■□ 3.25
SEMA5B-210ENST00000477001 PTPRGP23470 1445 aa35.31■■■■□ 3.24
SEMA5B-210ENST00000477001 SAMD9Q5K651 1589 aa35.24■■■■□ 3.23
SEMA5B-210ENST00000477001 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA5B-210ENST00000477001 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
SEMA5B-210ENST00000477001 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.12■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.11■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 UACAQ9BZF9 1416 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.09■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCC2Q92887 1545 aa35.07■■■■□ 3.21
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCA8O94911 1581 aa35.01■■■■□ 3.2
SEMA5B-210ENST00000477001 MAPKBP1O60336 1514 aa35■■■■□ 3.19
SEMA5B-210ENST00000477001 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.99■■■■□ 3.19
SEMA5B-210ENST00000477001 P3H3Q8IVL6 736 aa34.98■■■■□ 3.19
SEMA5B-210ENST00000477001 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.97■■■■□ 3.19
SEMA5B-210ENST00000477001 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
SEMA5B-210ENST00000477001 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.94■■■■□ 3.18
SEMA5B-210ENST00000477001 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.94■■■■□ 3.18
SEMA5B-210ENST00000477001 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.9■■■■□ 3.18
SEMA5B-210ENST00000477001 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
SEMA5B-210ENST00000477001 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
SEMA5B-210ENST00000477001 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.84■■■■□ 3.17
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.78■■■■□ 3.16
SEMA5B-210ENST00000477001 ASXL2Q76L83 1435 aa34.75■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.75■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 FMN1Q68DA7 1419 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 DIP2BQ9P265 1576 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 CLIP1P30622 1438 aa34.72■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
SEMA5B-210ENST00000477001 ATP10BO94823 1461 aa34.67■■■■□ 3.14
SEMA5B-210ENST00000477001 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.63■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 CEP162Q5TB80 1403 aa34.61■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 GLI2P10070 1586 aa34.61■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.6■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.6■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 HECW1Q76N89 1606 aa34.59■■■■□ 3.13
SEMA5B-210ENST00000477001 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
SEMA5B-210ENST00000477001 ARID3CA6NKF2 412 aa34.52■■■■□ 3.12
SEMA5B-210ENST00000477001 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
SEMA5B-210ENST00000477001 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.48■■■■□ 3.11
SEMA5B-210ENST00000477001 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.44■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.39■■■■□ 3.1
SEMA5B-210ENST00000477001 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.37■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.36■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 TSPOAP1O95153 1857 aa34.35■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.34■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 KCNH8Q96L42 1107 aa34.33■■■■□ 3.09
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.32■■■■□ 3.08
SEMA5B-210ENST00000477001 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
SEMA5B-210ENST00000477001 CD109Q6YHK3 1445 aa34.26■■■■□ 3.07
SEMA5B-210ENST00000477001 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA5B-210ENST00000477001 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA5B-210ENST00000477001 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
SEMA5B-210ENST00000477001 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.21■■■■□ 3.07
SEMA5B-210ENST00000477001 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
SEMA5B-210ENST00000477001 KIF14Q15058 1648 aa34.13■■■■□ 3.05
SEMA5B-210ENST00000477001 KDM6BO15054 1643 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA5B-210ENST00000477001 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA5B-210ENST00000477001 NEO1Q92859 1461 aa34.01■■■■□ 3.04
SEMA5B-210ENST00000477001 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 TIAM1Q13009 1591 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.97■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 PLCH2O75038 1416 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 MAP3K1Q13233 1512 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA5B-210ENST00000477001 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.95■■■■□ 3.02
SEMA5B-210ENST00000477001 FANCAO15360 1455 aa33.93■■■■□ 3.02
SEMA5B-210ENST00000477001 PREX2Q70Z35 1606 aa33.87■■■■□ 3.01
SEMA5B-210ENST00000477001 AKNAQ7Z591 1439 aa33.85■■■■□ 3.01
SEMA5B-210ENST00000477001 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.83■■■■□ 3.01
SEMA5B-210ENST00000477001 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.82■■■■□ 3
SEMA5B-210ENST00000477001 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.81■■■■□ 3
SEMA5B-210ENST00000477001 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms