RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 PRXQ9BXM0 1461 aa29.68■■■□□ 2.34
SMIM4-202ENST00000476842 JPH4Q96JJ6 628 aa29.67■■■□□ 2.34
SMIM4-202ENST00000476842 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.66■■■□□ 2.34
SMIM4-202ENST00000476842 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SMIM4-202ENST00000476842 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.57■■■□□ 2.32
SMIM4-202ENST00000476842 SHROOM2Q13796 1616 aa29.56■■■□□ 2.32
SMIM4-202ENST00000476842 ARAP1Q96P48 1450 aa29.53■■■□□ 2.32
SMIM4-202ENST00000476842 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SMIM4-202ENST00000476842 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.47■■■□□ 2.31
SMIM4-202ENST00000476842 IQGAP2Q13576 1575 aa29.42■■■□□ 2.3
SMIM4-202ENST00000476842 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.34■■■□□ 2.29
SMIM4-202ENST00000476842 KIF21BO75037 1637 aa29.32■■■□□ 2.28
SMIM4-202ENST00000476842 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.32■■■□□ 2.28
SMIM4-202ENST00000476842 DISP1Q96F81 1524 aa29.26■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.26■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.25■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 PTPRGP23470 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.22■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 GOLGA3Q08378 1498 aa29.22■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SMIM4-202ENST00000476842 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SMIM4-202ENST00000476842 KIAA0556O60303 1618 aa29.12■■■□□ 2.25
SMIM4-202ENST00000476842 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SMIM4-202ENST00000476842 P3H3Q8IVL6 736 aa29.06■■■□□ 2.24
SMIM4-202ENST00000476842 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
SMIM4-202ENST00000476842 UACAQ9BZF9 1416 aa29.01■■■□□ 2.23
SMIM4-202ENST00000476842 SAMD9Q5K651 1589 aa28.99■■■□□ 2.23
SMIM4-202ENST00000476842 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.97■■■□□ 2.23
SMIM4-202ENST00000476842 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.96■■■□□ 2.23
SMIM4-202ENST00000476842 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.91■■■□□ 2.22
SMIM4-202ENST00000476842 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
SMIM4-202ENST00000476842 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.9■■■□□ 2.22
SMIM4-202ENST00000476842 ABCC2Q92887 1545 aa28.89■■■□□ 2.22
SMIM4-202ENST00000476842 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.87■■■□□ 2.21
SMIM4-202ENST00000476842 ABCA8O94911 1581 aa28.84■■■□□ 2.21
SMIM4-202ENST00000476842 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.83■■■□□ 2.21
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.83■■■□□ 2.21
SMIM4-202ENST00000476842 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.82■■■□□ 2.2
SMIM4-202ENST00000476842 MAPKBP1O60336 1514 aa28.79■■■□□ 2.2
SMIM4-202ENST00000476842 CLIP1P30622 1438 aa28.72■■■□□ 2.19
SMIM4-202ENST00000476842 FMN1Q68DA7 1419 aa28.7■■■□□ 2.19
SMIM4-202ENST00000476842 ASXL2Q76L83 1435 aa28.7■■■□□ 2.19
SMIM4-202ENST00000476842 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.69■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.68■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.68■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 ATP10BO94823 1461 aa28.67■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 ARID3CA6NKF2 412 aa28.65■■■□□ 2.18
SMIM4-202ENST00000476842 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SMIM4-202ENST00000476842 CEP162Q5TB80 1403 aa28.61■■■□□ 2.17
SMIM4-202ENST00000476842 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SMIM4-202ENST00000476842 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SMIM4-202ENST00000476842 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SMIM4-202ENST00000476842 DIP2BQ9P265 1576 aa28.56■■■□□ 2.16
SMIM4-202ENST00000476842 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.56■■■□□ 2.16
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SMIM4-202ENST00000476842 KCNH8Q96L42 1107 aa28.52■■■□□ 2.16
SMIM4-202ENST00000476842 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.5■■■□□ 2.15
SMIM4-202ENST00000476842 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.5■■■□□ 2.15
SMIM4-202ENST00000476842 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.49■■■□□ 2.15
SMIM4-202ENST00000476842 GLI2P10070 1586 aa28.49■■■□□ 2.15
SMIM4-202ENST00000476842 HECW1Q76N89 1606 aa28.45■■■□□ 2.14
SMIM4-202ENST00000476842 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SMIM4-202ENST00000476842 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SMIM4-202ENST00000476842 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.39■■■□□ 2.13
SMIM4-202ENST00000476842 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SMIM4-202ENST00000476842 CD109Q6YHK3 1445 aa28.34■■■□□ 2.13
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.33■■■□□ 2.13
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.3■■■□□ 2.12
SMIM4-202ENST00000476842 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.26■■■□□ 2.12
SMIM4-202ENST00000476842 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.24■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.23■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.23■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.23■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.23■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 TSPOAP1O95153 1857 aa28.23■■■□□ 2.11
SMIM4-202ENST00000476842 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
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SMIM4-202ENST00000476842 PLCH2O75038 1416 aa28.09■■■□□ 2.09
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SMIM4-202ENST00000476842 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.07■■■□□ 2.08
SMIM4-202ENST00000476842 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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SMIM4-202ENST00000476842 NEO1Q92859 1461 aa28.05■■■□□ 2.08
SMIM4-202ENST00000476842 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.03■■■□□ 2.08
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K1Q13233 1512 aa28.02■■■□□ 2.08
SMIM4-202ENST00000476842 FANCAO15360 1455 aa28.01■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 TIAM1Q13009 1591 aa28■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 APLP2Q06481 763 aa28■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 AKNAQ7Z591 1439 aa27.99■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.97■■■□□ 2.07
SMIM4-202ENST00000476842 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.94■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.92■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 RAPGEF3O95398 923 aa27.91■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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