RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476310.5

HDAC10-211, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-211ENST00000476310 PRXQ9BXM0 1461 aa27.8■■■□□ 2.04
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HDAC10-211ENST00000476310 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.99■■□□□ 1.91
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HDAC10-211ENST00000476310 CEP162Q5TB80 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
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HDAC10-211ENST00000476310 HECW1Q76N89 1606 aa26.67■■□□□ 1.86
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HDAC10-211ENST00000476310 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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HDAC10-211ENST00000476310 CD109Q6YHK3 1445 aa26.55■■□□□ 1.84
HDAC10-211ENST00000476310 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.53■■□□□ 1.84
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HDAC10-211ENST00000476310 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.48■■□□□ 1.83
HDAC10-211ENST00000476310 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.47■■□□□ 1.83
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HDAC10-211ENST00000476310 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.45■■□□□ 1.82
HDAC10-211ENST00000476310 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
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HDAC10-211ENST00000476310 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HDAC10-211ENST00000476310 KIF14Q15058 1648 aa26.34■■□□□ 1.81
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HDAC10-211ENST00000476310 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.31■■□□□ 1.8
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HDAC10-211ENST00000476310 NEO1Q92859 1461 aa26.29■■□□□ 1.8
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HDAC10-211ENST00000476310 TIAM1Q13009 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
HDAC10-211ENST00000476310 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.24■■□□□ 1.79
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HDAC10-211ENST00000476310 AKNAQ7Z591 1439 aa26.22■■□□□ 1.79
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HDAC10-211ENST00000476310 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HDAC10-211ENST00000476310 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.18■■□□□ 1.78
HDAC10-211ENST00000476310 APLP2Q06481 763 aa26.17■■□□□ 1.78
HDAC10-211ENST00000476310 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.17■■□□□ 1.78
HDAC10-211ENST00000476310 RAPGEF3O95398 923 aa26.16■■□□□ 1.78
HDAC10-211ENST00000476310 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
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