RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGEF11O15085 1522 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF21BO75037 1637 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SHROOM2Q13796 1616 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQGAP2Q13576 1575 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GOLGA3Q08378 1498 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARAP1Q96P48 1450 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTPRGP23470 1445 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DISP1Q96F81 1524 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIAA0556O60303 1618 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 P3H3Q8IVL6 736 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAMD9Q5K651 1589 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UACAQ9BZF9 1416 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.14■■■□□ 2.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLIP1P30622 1438 aa31.07■■■□□ 2.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.07■■■□□ 2.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FMN1Q68DA7 1419 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC2Q92887 1545 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCA8O94911 1581 aa31■■■□□ 2.55
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CEP162Q5TB80 1403 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAPKBP1O60336 1514 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP10BO94823 1461 aa30.83■■■□□ 2.53
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ASXL2Q76L83 1435 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.78■■■□□ 2.52
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.72■■■□□ 2.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNH8Q96L42 1107 aa30.68■■■□□ 2.5
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.66■■■□□ 2.5
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GLI2P10070 1586 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIP2BQ9P265 1576 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 APLP2Q06481 763 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.5■■■□□ 2.47
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 CD109Q6YHK3 1445 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.39■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K1Q13233 1512 aa30.37■■■□□ 2.45
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.33■■■□□ 2.45
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TSPOAP1O95153 1857 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TIAM1Q13009 1591 aa30.26■■■□□ 2.43
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLCH2O75038 1416 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEO1Q92859 1461 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FANCAO15360 1455 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AKNAQ7Z591 1439 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.08■■■□□ 2.41
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