RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475790.5

MEGF6-204, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 3

Gene MEGF6, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-204ENST00000475790 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
MEGF6-204ENST00000475790 JPH4Q96JJ6 628 aa37.13■■■■□ 3.53
MEGF6-204ENST00000475790 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.06■■■■□ 3.52
MEGF6-204ENST00000475790 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.05■■■■□ 3.52
MEGF6-204ENST00000475790 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.8■■■■□ 3.48
MEGF6-204ENST00000475790 IQGAP2Q13576 1575 aa36.79■■■■□ 3.48
MEGF6-204ENST00000475790 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.73■■■■□ 3.47
MEGF6-204ENST00000475790 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.65■■■■□ 3.46
MEGF6-204ENST00000475790 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.64■■■■□ 3.46
MEGF6-204ENST00000475790 PTPRGP23470 1445 aa36.61■■■■□ 3.45
MEGF6-204ENST00000475790 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.59■■■■□ 3.45
MEGF6-204ENST00000475790 DISP1Q96F81 1524 aa36.58■■■■□ 3.45
MEGF6-204ENST00000475790 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.58■■■■□ 3.45
MEGF6-204ENST00000475790 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
MEGF6-204ENST00000475790 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
MEGF6-204ENST00000475790 MAPKBP1O60336 1514 aa36.56■■■■□ 3.44
MEGF6-204ENST00000475790 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.56■■■■□ 3.44
MEGF6-204ENST00000475790 PRXQ9BXM0 1461 aa36.53■■■■□ 3.44
MEGF6-204ENST00000475790 KIAA0556O60303 1618 aa36.48■■■■□ 3.43
MEGF6-204ENST00000475790 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.46■■■■□ 3.43
MEGF6-204ENST00000475790 DIP2BQ9P265 1576 aa36.43■■■■□ 3.42
MEGF6-204ENST00000475790 ABCC2Q92887 1545 aa36.39■■■■□ 3.42
MEGF6-204ENST00000475790 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.38■■■■□ 3.41
MEGF6-204ENST00000475790 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.36■■■■□ 3.41
MEGF6-204ENST00000475790 UACAQ9BZF9 1416 aa36.35■■■■□ 3.41
MEGF6-204ENST00000475790 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.31■■■■□ 3.4
MEGF6-204ENST00000475790 GOLGA3Q08378 1498 aa36.27■■■■□ 3.4
MEGF6-204ENST00000475790 EEA1Q15075 1411 aa36.25■■■■□ 3.39
MEGF6-204ENST00000475790 TSPOAP1O95153 1857 aa36.22■■■■□ 3.39
MEGF6-204ENST00000475790 ASXL2Q76L83 1435 aa36.21■■■■□ 3.39
MEGF6-204ENST00000475790 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.2■■■■□ 3.39
MEGF6-204ENST00000475790 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
MEGF6-204ENST00000475790 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.18■■■■□ 3.38
MEGF6-204ENST00000475790 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
MEGF6-204ENST00000475790 ABCA8O94911 1581 aa36.1■■■■□ 3.37
MEGF6-204ENST00000475790 GLI2P10070 1586 aa36.08■■■■□ 3.37
MEGF6-204ENST00000475790 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.04■■■■□ 3.36
MEGF6-204ENST00000475790 SAMD9Q5K651 1589 aa36.03■■■■□ 3.36
MEGF6-204ENST00000475790 P3H3Q8IVL6 736 aa36.01■■■■□ 3.36
MEGF6-204ENST00000475790 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
MEGF6-204ENST00000475790 KIF21BO75037 1637 aa36.01■■■■□ 3.35
MEGF6-204ENST00000475790 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
MEGF6-204ENST00000475790 KDM6BO15054 1643 aa35.99■■■■□ 3.35
MEGF6-204ENST00000475790 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.94■■■■□ 3.34
MEGF6-204ENST00000475790 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.94■■■■□ 3.34
MEGF6-204ENST00000475790 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
MEGF6-204ENST00000475790 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.81■■■■□ 3.32
MEGF6-204ENST00000475790 ARID3CA6NKF2 412 aa35.79■■■■□ 3.32
MEGF6-204ENST00000475790 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.78■■■■□ 3.32
MEGF6-204ENST00000475790 ATP10BO94823 1461 aa35.77■■■■□ 3.32
MEGF6-204ENST00000475790 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.74■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.73■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.73■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 KCNH8Q96L42 1107 aa35.73■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.73■■■■□ 3.31
MEGF6-204ENST00000475790 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
MEGF6-204ENST00000475790 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
MEGF6-204ENST00000475790 CD109Q6YHK3 1445 aa35.65■■■■□ 3.3
MEGF6-204ENST00000475790 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
MEGF6-204ENST00000475790 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.62■■■■□ 3.29
MEGF6-204ENST00000475790 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
MEGF6-204ENST00000475790 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
MEGF6-204ENST00000475790 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.54■■■■□ 3.28
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.48■■■■□ 3.27
MEGF6-204ENST00000475790 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.4■■■■□ 3.26
MEGF6-204ENST00000475790 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
MEGF6-204ENST00000475790 FMN1Q68DA7 1419 aa35.37■■■■□ 3.25
MEGF6-204ENST00000475790 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.35■■■■□ 3.25
MEGF6-204ENST00000475790 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.33■■■■□ 3.25
MEGF6-204ENST00000475790 HECW1Q76N89 1606 aa35.33■■■■□ 3.25
MEGF6-204ENST00000475790 ADGRL1O94910 1474 aa35.26■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 NEO1Q92859 1461 aa35.26■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.24■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.24■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.2■■■■□ 3.23
MEGF6-204ENST00000475790 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.13■■■■□ 3.21
MEGF6-204ENST00000475790 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.13■■■■□ 3.21
MEGF6-204ENST00000475790 RAPGEF3O95398 923 aa35.12■■■■□ 3.21
MEGF6-204ENST00000475790 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
MEGF6-204ENST00000475790 FANCAO15360 1455 aa35.11■■■■□ 3.21
MEGF6-204ENST00000475790 AKNAQ7Z591 1439 aa35.06■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 KIF14Q15058 1648 aa35.06■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 RICTORQ6R327 1708 aa35.05■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 CLIP1P30622 1438 aa35.05■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.05■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.02■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
MEGF6-204ENST00000475790 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
MEGF6-204ENST00000475790 PLCH2O75038 1416 aa35■■■■□ 3.19
MEGF6-204ENST00000475790 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.97■■■■□ 3.19
MEGF6-204ENST00000475790 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.95■■■■□ 3.19
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.9■■■■□ 3.18
MEGF6-204ENST00000475790 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.88■■■■□ 3.17
MEGF6-204ENST00000475790 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.85■■■■□ 3.17
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.83■■■■□ 3.17
MEGF6-204ENST00000475790 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms