RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 JPH4Q96JJ6 628 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-204ENST00000475241 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.41■■■□□ 2.14
PKDCC-204ENST00000475241 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PKDCC-204ENST00000475241 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.35■■■□□ 2.13
PKDCC-204ENST00000475241 EEA1Q15075 1411 aa28.35■■■□□ 2.13
PKDCC-204ENST00000475241 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.33■■■□□ 2.12
PKDCC-204ENST00000475241 PRXQ9BXM0 1461 aa28.31■■■□□ 2.12
PKDCC-204ENST00000475241 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.28■■■□□ 2.12
PKDCC-204ENST00000475241 IQGAP2Q13576 1575 aa28.23■■■□□ 2.11
PKDCC-204ENST00000475241 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-204ENST00000475241 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-204ENST00000475241 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-204ENST00000475241 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.05■■■□□ 2.08
PKDCC-204ENST00000475241 DISP1Q96F81 1524 aa28.03■■■□□ 2.08
PKDCC-204ENST00000475241 PTPRGP23470 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
PKDCC-204ENST00000475241 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PKDCC-204ENST00000475241 GOLGA3Q08378 1498 aa27.98■■■□□ 2.07
PKDCC-204ENST00000475241 KIF21BO75037 1637 aa27.98■■■□□ 2.07
PKDCC-204ENST00000475241 KIAA0556O60303 1618 aa27.95■■■□□ 2.06
PKDCC-204ENST00000475241 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
PKDCC-204ENST00000475241 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PKDCC-204ENST00000475241 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.89■■■□□ 2.06
PKDCC-204ENST00000475241 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.85■■■□□ 2.05
PKDCC-204ENST00000475241 UACAQ9BZF9 1416 aa27.84■■■□□ 2.05
PKDCC-204ENST00000475241 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PKDCC-204ENST00000475241 MAPKBP1O60336 1514 aa27.8■■■□□ 2.04
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC2Q92887 1545 aa27.78■■■□□ 2.04
PKDCC-204ENST00000475241 SAMD9Q5K651 1589 aa27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-204ENST00000475241 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-204ENST00000475241 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.7■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 ABCA8O94911 1581 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.66■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 P3H3Q8IVL6 736 aa27.66■■■□□ 2.02
PKDCC-204ENST00000475241 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.6■■■□□ 2.01
PKDCC-204ENST00000475241 ASXL2Q76L83 1435 aa27.59■■■□□ 2.01
PKDCC-204ENST00000475241 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PKDCC-204ENST00000475241 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.59■■■□□ 2.01
PKDCC-204ENST00000475241 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.59■■■□□ 2.01
PKDCC-204ENST00000475241 DIP2BQ9P265 1576 aa27.57■■■□□ 2
PKDCC-204ENST00000475241 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PKDCC-204ENST00000475241 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.55■■■□□ 2
PKDCC-204ENST00000475241 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.49■■□□□ 1.99
PKDCC-204ENST00000475241 GLI2P10070 1586 aa27.48■■□□□ 1.99
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.46■■□□□ 1.99
PKDCC-204ENST00000475241 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.45■■□□□ 1.99
PKDCC-204ENST00000475241 ATP10BO94823 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
PKDCC-204ENST00000475241 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PKDCC-204ENST00000475241 FMN1Q68DA7 1419 aa27.42■■□□□ 1.98
PKDCC-204ENST00000475241 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PKDCC-204ENST00000475241 ARID3CA6NKF2 412 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 CLIP1P30622 1438 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 KCNH8Q96L42 1107 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 TSPOAP1O95153 1857 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-204ENST00000475241 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.25■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 HECW1Q76N89 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.24■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.24■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 CD109Q6YHK3 1445 aa27.22■■□□□ 1.95
PKDCC-204ENST00000475241 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.2■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.19■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.16■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 CEP162Q5TB80 1403 aa27.15■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 KDM6BO15054 1643 aa27.14■■□□□ 1.94
PKDCC-204ENST00000475241 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.13■■□□□ 1.93
PKDCC-204ENST00000475241 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.11■■□□□ 1.93
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.09■■□□□ 1.93
PKDCC-204ENST00000475241 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PKDCC-204ENST00000475241 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.07■■□□□ 1.92
PKDCC-204ENST00000475241 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-204ENST00000475241 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-204ENST00000475241 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-204ENST00000475241 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-204ENST00000475241 NEO1Q92859 1461 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-204ENST00000475241 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-204ENST00000475241 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.93■■□□□ 1.9
PKDCC-204ENST00000475241 KIF14Q15058 1648 aa26.92■■□□□ 1.9
PKDCC-204ENST00000475241 PLCH2O75038 1416 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-204ENST00000475241 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-204ENST00000475241 FANCAO15360 1455 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-204ENST00000475241 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-204ENST00000475241 AKNAQ7Z591 1439 aa26.84■■□□□ 1.89
PKDCC-204ENST00000475241 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.82■■□□□ 1.88
PKDCC-204ENST00000475241 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.82■■□□□ 1.88
PKDCC-204ENST00000475241 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.78■■□□□ 1.88
PKDCC-204ENST00000475241 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PKDCC-204ENST00000475241 RAPGEF3O95398 923 aa26.75■■□□□ 1.87
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.72■■□□□ 1.87
PKDCC-204ENST00000475241 ADGRL1O94910 1474 aa26.72■■□□□ 1.87
PKDCC-204ENST00000475241 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.71■■□□□ 1.87
PKDCC-204ENST00000475241 MAP3K1Q13233 1512 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-204ENST00000475241 PREX2Q70Z35 1606 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms