RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-207ENST00000475060 TIAM1Q13009 1591 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-207ENST00000475060 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-207ENST00000475060 SAMD9Q5K651 1589 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-207ENST00000475060 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-207ENST00000475060 WDR62O43379 1518 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 PBRM1Q86U86 1689 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 APLP2Q06481 763 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 ADAMTS12P58397 1594 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.9□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 IFT140Q96RY7 1462 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 FMN1Q68DA7 1419 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 GRIN2BQ13224 1484 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-207ENST00000475060 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 IQGAP2Q13576 1575 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGEF11O15085 1522 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 HECW1Q76N89 1606 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.77□□□□□ -0.84
CTPS1-207ENST00000475060 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 KIAA0556O60303 1618 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 GRIN2AQ12879 1464 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-207ENST00000475060 AKNAQ7Z591 1439 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 SYNJ2O15056 1496 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 MAPKBP1O60336 1514 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 DISP1Q96F81 1524 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 NUP160Q12769 1436 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 NCOA2Q15596 1464 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 HFM1A2PYH4 1435 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 MIA2Q96PC5 1412 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 CEP170Q5SW79 1584 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 ERCC6Q03468 1493 aa9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-207ENST00000475060 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 P3H3Q8IVL6 736 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 NAIPQ13075 1403 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 PTPRKQ15262 1439 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 UACAQ9BZF9 1416 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 ABCA8O94911 1581 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 KCNA4P22459 653 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-207ENST00000475060 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 SHROOM2Q13796 1616 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 ROCK1Q13464 1354 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 ADGRL2O95490 1459 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-207ENST00000475060 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-207ENST00000475060 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-207ENST00000475060 DAPK1P53355 1430 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-207ENST00000475060 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-207ENST00000475060 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-207ENST00000475060 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.5□□□□□ -0.89
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