RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474945.1

SPCS1-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS1, Length 981 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-204ENST00000474945 IGF1RP08069 1367 aa23.41■■□□□ 1.34
SPCS1-204ENST00000474945 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SPCS1-204ENST00000474945 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-204ENST00000474945 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-204ENST00000474945 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPCS1-204ENST00000474945 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.27■■□□□ 1.32
SPCS1-204ENST00000474945 JPH4Q96JJ6 628 aa23.26■■□□□ 1.31
SPCS1-204ENST00000474945 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-204ENST00000474945 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
SPCS1-204ENST00000474945 IQGAP2Q13576 1575 aa23.15■■□□□ 1.3
SPCS1-204ENST00000474945 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-204ENST00000474945 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.02■■□□□ 1.28
SPCS1-204ENST00000474945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 PRXQ9BXM0 1461 aa23■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 PTPRGP23470 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.98■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.98■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 DISP1Q96F81 1524 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS1-204ENST00000474945 KIAA0556O60303 1618 aa22.95■■□□□ 1.26
SPCS1-204ENST00000474945 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
SPCS1-204ENST00000474945 MAPKBP1O60336 1514 aa22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-204ENST00000474945 EEA1Q15075 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
SPCS1-204ENST00000474945 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.87■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 ABCC2Q92887 1545 aa22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 GOLGA3Q08378 1498 aa22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 UACAQ9BZF9 1416 aa22.83■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.83■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 DIP2BQ9P265 1576 aa22.83■■□□□ 1.25
SPCS1-204ENST00000474945 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
SPCS1-204ENST00000474945 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-204ENST00000474945 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.78■■□□□ 1.24
SPCS1-204ENST00000474945 ASXL2Q76L83 1435 aa22.73■■□□□ 1.23
SPCS1-204ENST00000474945 KIF21BO75037 1637 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-204ENST00000474945 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-204ENST00000474945 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
SPCS1-204ENST00000474945 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SPCS1-204ENST00000474945 SAMD9Q5K651 1589 aa22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-204ENST00000474945 ABCA8O94911 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
SPCS1-204ENST00000474945 P3H3Q8IVL6 736 aa22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 TSPOAP1O95153 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 GLI2P10070 1586 aa22.6■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-204ENST00000474945 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.57■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.56■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 KDM6BO15054 1643 aa22.55■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.55■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.53■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 ARID3CA6NKF2 412 aa22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-204ENST00000474945 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPCS1-204ENST00000474945 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPCS1-204ENST00000474945 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.45■■□□□ 1.18
SPCS1-204ENST00000474945 ATP10BO94823 1461 aa22.44■■□□□ 1.18
SPCS1-204ENST00000474945 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPCS1-204ENST00000474945 KCNH8Q96L42 1107 aa22.41■■□□□ 1.18
SPCS1-204ENST00000474945 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.41■■□□□ 1.18
SPCS1-204ENST00000474945 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SPCS1-204ENST00000474945 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPCS1-204ENST00000474945 CD109Q6YHK3 1445 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS1-204ENST00000474945 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS1-204ENST00000474945 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS1-204ENST00000474945 FMN1Q68DA7 1419 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-204ENST00000474945 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.3■■□□□ 1.16
SPCS1-204ENST00000474945 HECW1Q76N89 1606 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-204ENST00000474945 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SPCS1-204ENST00000474945 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-204ENST00000474945 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPCS1-204ENST00000474945 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.21■■□□□ 1.15
SPCS1-204ENST00000474945 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-204ENST00000474945 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-204ENST00000474945 CLIP1P30622 1438 aa22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-204ENST00000474945 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.142e-6■□□□□ 11.3
SPCS1-204ENST00000474945 NEO1Q92859 1461 aa22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-204ENST00000474945 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.11■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 KIF14Q15058 1648 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-204ENST00000474945 FANCAO15360 1455 aa22.08■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 ADGRL1O94910 1474 aa22.08■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.08■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.05■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.04■■□□□ 1.12
SPCS1-204ENST00000474945 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.01■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 AKNAQ7Z591 1439 aa22.01■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 RAPGEF3O95398 923 aa22.01■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 CEP162Q5TB80 1403 aa21.99■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 PLCH2O75038 1416 aa21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 RICTORQ6R327 1708 aa21.96■■□□□ 1.11
SPCS1-204ENST00000474945 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.95■■□□□ 1.1
SPCS1-204ENST00000474945 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms