RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474895.6

USP20-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 825 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-205ENST00000474895 KIF27Q86VH2 1401 aa22.58■■□□□ 1.21
USP20-205ENST00000474895 IGF1RP08069 1367 aa22.56■■□□□ 1.2
USP20-205ENST00000474895 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-205ENST00000474895 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.47■■□□□ 1.19
USP20-205ENST00000474895 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.42■■□□□ 1.18
USP20-205ENST00000474895 MAPKBP1O60336 1514 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-205ENST00000474895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.4■■□□□ 1.18
USP20-205ENST00000474895 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-205ENST00000474895 DIP2BQ9P265 1576 aa22.33■■□□□ 1.16
USP20-205ENST00000474895 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
USP20-205ENST00000474895 IQGAP2Q13576 1575 aa22.31■■□□□ 1.16
USP20-205ENST00000474895 PTPRGP23470 1445 aa22.27■■□□□ 1.16
USP20-205ENST00000474895 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.27■■□□□ 1.16
USP20-205ENST00000474895 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.26■■□□□ 1.15
USP20-205ENST00000474895 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.25■■□□□ 1.15
USP20-205ENST00000474895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
USP20-205ENST00000474895 DISP1Q96F81 1524 aa22.21■■□□□ 1.15
USP20-205ENST00000474895 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP20-205ENST00000474895 ABCC2Q92887 1545 aa22.2■■□□□ 1.14
USP20-205ENST00000474895 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.19■■□□□ 1.14
USP20-205ENST00000474895 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
USP20-205ENST00000474895 UACAQ9BZF9 1416 aa22.13■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 KIAA0556O60303 1618 aa22.12■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 KDM6BO15054 1643 aa22.11■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 TSPOAP1O95153 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 GLI2P10070 1586 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 ASXL2Q76L83 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.08■■□□□ 1.13
USP20-205ENST00000474895 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.07■■□□□ 1.12
USP20-205ENST00000474895 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP20-205ENST00000474895 PRXQ9BXM0 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-205ENST00000474895 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
USP20-205ENST00000474895 GOLGA3Q08378 1498 aa21.98■■□□□ 1.11
USP20-205ENST00000474895 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP20-205ENST00000474895 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.96■■□□□ 1.11
USP20-205ENST00000474895 ABCA8O94911 1581 aa21.92■■□□□ 1.1
USP20-205ENST00000474895 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-205ENST00000474895 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.89■■□□□ 1.09
USP20-205ENST00000474895 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP20-205ENST00000474895 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.83■■□□□ 1.09
USP20-205ENST00000474895 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.8■■□□□ 1.08
USP20-205ENST00000474895 SAMD9Q5K651 1589 aa21.78■■□□□ 1.08
USP20-205ENST00000474895 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.78■■□□□ 1.08
USP20-205ENST00000474895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.77■■□□□ 1.08
USP20-205ENST00000474895 EEA1Q15075 1411 aa21.76■■□□□ 1.07
USP20-205ENST00000474895 CD109Q6YHK3 1445 aa21.73■■□□□ 1.07
USP20-205ENST00000474895 ADGRL1O94910 1474 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-205ENST00000474895 ATP10BO94823 1461 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-205ENST00000474895 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.67■■□□□ 1.06
USP20-205ENST00000474895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP20-205ENST00000474895 P3H3Q8IVL6 736 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-205ENST00000474895 KCNH8Q96L42 1107 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-205ENST00000474895 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-205ENST00000474895 KIF21BO75037 1637 aa21.61■■□□□ 1.05
USP20-205ENST00000474895 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-205ENST00000474895 ARID3CA6NKF2 412 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-205ENST00000474895 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-205ENST00000474895 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-205ENST00000474895 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-205ENST00000474895 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-205ENST00000474895 NEO1Q92859 1461 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-205ENST00000474895 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP20-205ENST00000474895 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP20-205ENST00000474895 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP20-205ENST00000474895 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.44■■□□□ 1.02
USP20-205ENST00000474895 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.42■■□□□ 1.02
USP20-205ENST00000474895 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.39■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 27.1
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USP20-205ENST00000474895 RAPGEF3O95398 923 aa21.37■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.36■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 RICTORQ6R327 1708 aa21.35■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.35■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 FANCAO15360 1455 aa21.34■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.34■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.34■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 FMN1Q68DA7 1419 aa21.33■■□□□ 1.01
USP20-205ENST00000474895 HECW1Q76N89 1606 aa21.33■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.32■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 AKNAQ7Z591 1439 aa21.32■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.3■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.29■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 PTPRMP28827 1452 aa21.27■■□□□ 1
USP20-205ENST00000474895 PLCH2O75038 1416 aa21.24■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 MADDQ8WXG6 1647 aa21.24■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.22■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.22■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.21■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.21■□□□□ 0.99
USP20-205ENST00000474895 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.2■□□□□ 0.98
USP20-205ENST00000474895 KIF14Q15058 1648 aa21.19■□□□□ 0.98
USP20-205ENST00000474895 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.18■□□□□ 0.98
USP20-205ENST00000474895 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP20-205ENST00000474895 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP20-205ENST00000474895 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
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