RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474513.6

ATXN7-205, Transcript of ataxin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN7, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7-205ENST00000474513 JPH4Q96JJ6 628 aa44.2■■■■■ 4.67
ATXN7-205ENST00000474513 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
ATXN7-205ENST00000474513 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.17■■■■■ 4.66
ATXN7-205ENST00000474513 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
ATXN7-205ENST00000474513 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.94■■■■■ 4.62
ATXN7-205ENST00000474513 IQGAP2Q13576 1575 aa43.87■■■■■ 4.61
ATXN7-205ENST00000474513 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.72■■■■■ 4.59
ATXN7-205ENST00000474513 PRXQ9BXM0 1461 aa43.65■■■■■ 4.58
ATXN7-205ENST00000474513 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.62■■■■■ 4.57
ATXN7-205ENST00000474513 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.61■■■■■ 4.57
ATXN7-205ENST00000474513 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.61■■■■■ 4.57
ATXN7-205ENST00000474513 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.6■■■■■ 4.57
ATXN7-205ENST00000474513 PTPRGP23470 1445 aa43.59■■■■■ 4.57
ATXN7-205ENST00000474513 DISP1Q96F81 1524 aa43.57■■■■■ 4.56
ATXN7-205ENST00000474513 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.53■■■■■ 4.56
ATXN7-205ENST00000474513 MAPKBP1O60336 1514 aa43.49■■■■■ 4.55
ATXN7-205ENST00000474513 EEA1Q15075 1411 aa43.48■■■■■ 4.55
ATXN7-205ENST00000474513 KIAA0556O60303 1618 aa43.46■■■■■ 4.55
ATXN7-205ENST00000474513 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.43■■■■■ 4.54
ATXN7-205ENST00000474513 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.42■■■■■ 4.54
ATXN7-205ENST00000474513 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
ATXN7-205ENST00000474513 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.34■■■■■ 4.53
ATXN7-205ENST00000474513 GOLGA3Q08378 1498 aa43.33■■■■■ 4.53
ATXN7-205ENST00000474513 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.32■■■■■ 4.53
ATXN7-205ENST00000474513 ABCC2Q92887 1545 aa43.32■■■■■ 4.52
ATXN7-205ENST00000474513 UACAQ9BZF9 1416 aa43.31■■■■■ 4.52
ATXN7-205ENST00000474513 DIP2BQ9P265 1576 aa43.26■■■■■ 4.52
ATXN7-205ENST00000474513 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.19■■■■■ 4.5
ATXN7-205ENST00000474513 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.18■■■■■ 4.5
ATXN7-205ENST00000474513 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.12■■■■■ 4.49
ATXN7-205ENST00000474513 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.08■■■■■ 4.49
ATXN7-205ENST00000474513 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
ATXN7-205ENST00000474513 KIF21BO75037 1637 aa43.08■■■■■ 4.49
ATXN7-205ENST00000474513 ASXL2Q76L83 1435 aa43.06■■■■■ 4.48
ATXN7-205ENST00000474513 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
ATXN7-205ENST00000474513 ABCA8O94911 1581 aa43.01■■■■■ 4.48
ATXN7-205ENST00000474513 SAMD9Q5K651 1589 aa43■■■■■ 4.47
ATXN7-205ENST00000474513 GLI2P10070 1586 aa42.94■■■■■ 4.46
ATXN7-205ENST00000474513 TSPOAP1O95153 1857 aa42.87■■■■■ 4.45
ATXN7-205ENST00000474513 P3H3Q8IVL6 736 aa42.84■■■■■ 4.45
ATXN7-205ENST00000474513 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
ATXN7-205ENST00000474513 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.79■■■■■ 4.44
ATXN7-205ENST00000474513 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.73■■■■■ 4.43
ATXN7-205ENST00000474513 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.71■■■■■ 4.43
ATXN7-205ENST00000474513 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
ATXN7-205ENST00000474513 KDM6BO15054 1643 aa42.71■■■■■ 4.43
ATXN7-205ENST00000474513 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.69■■■■■ 4.42
ATXN7-205ENST00000474513 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
ATXN7-205ENST00000474513 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.65■■■■■ 4.42
ATXN7-205ENST00000474513 ATP10BO94823 1461 aa42.61■■■■■ 4.41
ATXN7-205ENST00000474513 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
ATXN7-205ENST00000474513 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.56■■■■■ 4.4
ATXN7-205ENST00000474513 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.54■■■■■ 4.4
ATXN7-205ENST00000474513 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.52■■■■■ 4.4
ATXN7-205ENST00000474513 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
ATXN7-205ENST00000474513 ARID3CA6NKF2 412 aa42.49■■■■■ 4.39
ATXN7-205ENST00000474513 KCNH8Q96L42 1107 aa42.47■■■■■ 4.39
ATXN7-205ENST00000474513 CD109Q6YHK3 1445 aa42.42■■■■■ 4.38
ATXN7-205ENST00000474513 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.41■■■■■ 4.38
ATXN7-205ENST00000474513 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.36■■■■■ 4.37
ATXN7-205ENST00000474513 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
ATXN7-205ENST00000474513 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
ATXN7-205ENST00000474513 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.31■■■■■ 4.36
ATXN7-205ENST00000474513 FMN1Q68DA7 1419 aa42.31■■■■■ 4.36
ATXN7-205ENST00000474513 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
ATXN7-205ENST00000474513 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
ATXN7-205ENST00000474513 HECW1Q76N89 1606 aa42.2■■■■■ 4.35
ATXN7-205ENST00000474513 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.18■■■■■ 4.34
ATXN7-205ENST00000474513 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
ATXN7-205ENST00000474513 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.07■■■■■ 4.33
ATXN7-205ENST00000474513 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.06■■■■■ 4.32
ATXN7-205ENST00000474513 NEO1Q92859 1461 aa42.03■■■■■ 4.32
ATXN7-205ENST00000474513 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
ATXN7-205ENST00000474513 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
ATXN7-205ENST00000474513 CLIP1P30622 1438 aa41.94■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.93■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.91■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.9■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.88■■■■■ 4.3
ATXN7-205ENST00000474513 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.87■■■■■ 4.29
ATXN7-205ENST00000474513 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.84■■■■■ 4.29
ATXN7-205ENST00000474513 FANCAO15360 1455 aa41.81■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.8■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 KIF14Q15058 1648 aa41.79■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 ADGRL1O94910 1474 aa41.78■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 AKNAQ7Z591 1439 aa41.76■■■■■ 4.28
ATXN7-205ENST00000474513 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.74■■■■■ 4.27
ATXN7-205ENST00000474513 PLCH2O75038 1416 aa41.73■■■■■ 4.27
ATXN7-205ENST00000474513 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.72■■■■■ 4.27
ATXN7-205ENST00000474513 RAPGEF3O95398 923 aa41.71■■■■■ 4.27
ATXN7-205ENST00000474513 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
ATXN7-205ENST00000474513 RICTORQ6R327 1708 aa41.66■■■■■ 4.26
ATXN7-205ENST00000474513 CEP162Q5TB80 1403 aa41.62■■■■■ 4.25
ATXN7-205ENST00000474513 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.55■■■■■ 4.24
ATXN7-205ENST00000474513 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.54■■■■■ 4.24
ATXN7-205ENST00000474513 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.52■■■■■ 4.24
ATXN7-205ENST00000474513 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.51■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms