RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 JPH4Q96JJ6 628 aa34.46■■■■□ 3.11
COL9A3-210ENST00000472880 IGF1RP08069 1367 aa34.42■■■■□ 3.1
COL9A3-210ENST00000472880 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.33■■■■□ 3.09
COL9A3-210ENST00000472880 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.23■■■■□ 3.07
COL9A3-210ENST00000472880 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.15■■■■□ 3.06
COL9A3-210ENST00000472880 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.13■■■■□ 3.05
COL9A3-210ENST00000472880 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.11■■■■□ 3.05
COL9A3-210ENST00000472880 MAPKBP1O60336 1514 aa34.08■■■■□ 3.05
COL9A3-210ENST00000472880 IQGAP2Q13576 1575 aa34.06■■■■□ 3.04
COL9A3-210ENST00000472880 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.02■■■■□ 3.04
COL9A3-210ENST00000472880 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.01■■■■□ 3.03
COL9A3-210ENST00000472880 PTPRGP23470 1445 aa33.98■■■■□ 3.03
COL9A3-210ENST00000472880 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.96■■■■□ 3.03
COL9A3-210ENST00000472880 DIP2BQ9P265 1576 aa33.96■■■■□ 3.03
COL9A3-210ENST00000472880 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.94■■■■□ 3.02
COL9A3-210ENST00000472880 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.94■■■■□ 3.02
COL9A3-210ENST00000472880 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
COL9A3-210ENST00000472880 DISP1Q96F81 1524 aa33.84■■■■□ 3.01
COL9A3-210ENST00000472880 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
COL9A3-210ENST00000472880 ABCC2Q92887 1545 aa33.82■■■■□ 3
COL9A3-210ENST00000472880 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.82■■■■□ 3
COL9A3-210ENST00000472880 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.76■■■□□ 2.99
COL9A3-210ENST00000472880 KIAA0556O60303 1618 aa33.75■■■□□ 2.99
COL9A3-210ENST00000472880 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.74■■■□□ 2.99
COL9A3-210ENST00000472880 UACAQ9BZF9 1416 aa33.73■■■□□ 2.99
COL9A3-210ENST00000472880 TSPOAP1O95153 1857 aa33.7■■■□□ 2.99
COL9A3-210ENST00000472880 ASXL2Q76L83 1435 aa33.68■■■□□ 2.98
COL9A3-210ENST00000472880 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.67■■■□□ 2.98
COL9A3-210ENST00000472880 KDM6BO15054 1643 aa33.66■■■□□ 2.98
COL9A3-210ENST00000472880 PRXQ9BXM0 1461 aa33.62■■■□□ 2.97
COL9A3-210ENST00000472880 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.6■■■□□ 2.97
COL9A3-210ENST00000472880 GLI2P10070 1586 aa33.59■■■□□ 2.97
COL9A3-210ENST00000472880 GOLGA3Q08378 1498 aa33.57■■■□□ 2.97
COL9A3-210ENST00000472880 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
COL9A3-210ENST00000472880 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
COL9A3-210ENST00000472880 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
COL9A3-210ENST00000472880 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.42■■■□□ 2.94
COL9A3-210ENST00000472880 ABCA8O94911 1581 aa33.4■■■□□ 2.94
COL9A3-210ENST00000472880 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.39■■■□□ 2.94
COL9A3-210ENST00000472880 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.35■■■□□ 2.93
COL9A3-210ENST00000472880 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.34■■■□□ 2.93
COL9A3-210ENST00000472880 EEA1Q15075 1411 aa33.3■■■□□ 2.92
COL9A3-210ENST00000472880 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
COL9A3-210ENST00000472880 SAMD9Q5K651 1589 aa33.23■■■□□ 2.91
COL9A3-210ENST00000472880 P3H3Q8IVL6 736 aa33.22■■■□□ 2.91
COL9A3-210ENST00000472880 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.21■■■□□ 2.91
COL9A3-210ENST00000472880 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
COL9A3-210ENST00000472880 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.16■■■□□ 2.9
COL9A3-210ENST00000472880 KCNH8Q96L42 1107 aa33.16■■■□□ 2.9
COL9A3-210ENST00000472880 CD109Q6YHK3 1445 aa33.15■■■□□ 2.9
COL9A3-210ENST00000472880 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.13■■■□□ 2.89
COL9A3-210ENST00000472880 ARID3CA6NKF2 412 aa33.11■■■□□ 2.89
COL9A3-210ENST00000472880 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.1■■■□□ 2.89
COL9A3-210ENST00000472880 ATP10BO94823 1461 aa33.09■■■□□ 2.89
COL9A3-210ENST00000472880 KIF21BO75037 1637 aa33.05■■■□□ 2.88
COL9A3-210ENST00000472880 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
COL9A3-210ENST00000472880 ADGRL1O94910 1474 aa33.01■■■□□ 2.88
COL9A3-210ENST00000472880 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.99■■■□□ 2.87
COL9A3-210ENST00000472880 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.95■■■□□ 2.87
COL9A3-210ENST00000472880 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
COL9A3-210ENST00000472880 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.94■■■□□ 2.86
COL9A3-210ENST00000472880 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
COL9A3-210ENST00000472880 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
COL9A3-210ENST00000472880 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.87■■■□□ 2.85
COL9A3-210ENST00000472880 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.81■■■□□ 2.84
COL9A3-210ENST00000472880 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.79■■■□□ 2.84
COL9A3-210ENST00000472880 NEO1Q92859 1461 aa32.77■■■□□ 2.84
COL9A3-210ENST00000472880 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
COL9A3-210ENST00000472880 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.74■■■□□ 2.83
COL9A3-210ENST00000472880 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.73■■■□□ 2.83
COL9A3-210ENST00000472880 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
COL9A3-210ENST00000472880 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.63■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 RAPGEF3O95398 923 aa32.63■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.62■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.62■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 FMN1Q68DA7 1419 aa32.62■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 HECW1Q76N89 1606 aa32.61■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.61■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.61■■■□□ 2.81
COL9A3-210ENST00000472880 FANCAO15360 1455 aa32.57■■■□□ 2.8
COL9A3-210ENST00000472880 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.54■■■□□ 2.8
COL9A3-210ENST00000472880 AKNAQ7Z591 1439 aa32.53■■■□□ 2.8
COL9A3-210ENST00000472880 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
COL9A3-210ENST00000472880 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
COL9A3-210ENST00000472880 RICTORQ6R327 1708 aa32.51■■■□□ 2.79
COL9A3-210ENST00000472880 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.49■■■□□ 2.79
COL9A3-210ENST00000472880 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.45■■■□□ 2.79
COL9A3-210ENST00000472880 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.41■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.41■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 PLCH2O75038 1416 aa32.4■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 KIF14Q15058 1648 aa32.39■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.39■■■□□ 2.78
COL9A3-210ENST00000472880 PTPRMP28827 1452 aa32.36■■■□□ 2.77
COL9A3-210ENST00000472880 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.35■■■□□ 2.77
COL9A3-210ENST00000472880 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
COL9A3-210ENST00000472880 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.34■■■□□ 2.77
COL9A3-210ENST00000472880 MADDQ8WXG6 1647 aa32.34■■■□□ 2.77
COL9A3-210ENST00000472880 CLIP1P30622 1438 aa32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms