RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.11■■■■□ 3.85
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C9orf3-213ENST00000471978 IQGAP2Q13576 1575 aa38.61■■■■□ 3.77
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C9orf3-213ENST00000471978 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRGP23470 1445 aa38.58■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 MAPKBP1O60336 1514 aa38.56■■■■□ 3.76
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C9orf3-213ENST00000471978 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.51■■■■□ 3.76
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C9orf3-213ENST00000471978 DISP1Q96F81 1524 aa38.42■■■■□ 3.74
C9orf3-213ENST00000471978 DIP2BQ9P265 1576 aa38.4■■■■□ 3.74
C9orf3-213ENST00000471978 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
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C9orf3-213ENST00000471978 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.23■■■■□ 3.71
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C9orf3-213ENST00000471978 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.1■■■■□ 3.69
C9orf3-213ENST00000471978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.04■■■■□ 3.68
C9orf3-213ENST00000471978 GLI2P10070 1586 aa38.02■■■■□ 3.68
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C9orf3-213ENST00000471978 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.82■■■■□ 3.64
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C9orf3-213ENST00000471978 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.73■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 SAMD9Q5K651 1589 aa37.72■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 KCNH8Q96L42 1107 aa37.7■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 ARID3CA6NKF2 412 aa37.65■■■■□ 3.62
C9orf3-213ENST00000471978 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
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C9orf3-213ENST00000471978 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.57■■■■□ 3.61
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C9orf3-213ENST00000471978 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.53■■■■□ 3.6
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C9orf3-213ENST00000471978 ADGRL1O94910 1474 aa37.31■■■■□ 3.56
C9orf3-213ENST00000471978 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.25■■■■□ 3.55
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C9orf3-213ENST00000471978 NEO1Q92859 1461 aa37.14■■■■□ 3.54
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.1■■■■□ 3.53
C9orf3-213ENST00000471978 FMN1Q68DA7 1419 aa37.09■■■■□ 3.53
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C9orf3-213ENST00000471978 AKNAQ7Z591 1439 aa36.93■■■■□ 3.5
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C9orf3-213ENST00000471978 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 CLIP1P30622 1438 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
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