RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 OSCARQ8IYS5 282 aa46.96■■■■■ 5.11
SOD1-203ENST00000470944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.89■■■■■ 5.1
SOD1-203ENST00000470944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.88■■■■■ 5.09
SOD1-203ENST00000470944 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.84■■■■■ 5.09
SOD1-203ENST00000470944 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.84■■■■■ 5.09
SOD1-203ENST00000470944 IQGAP2Q13576 1575 aa46.78■■■■■ 5.08
SOD1-203ENST00000470944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
SOD1-203ENST00000470944 JPH4Q96JJ6 628 aa46.66■■■■■ 5.06
SOD1-203ENST00000470944 SHROOM2Q13796 1616 aa46.57■■■■■ 5.05
SOD1-203ENST00000470944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.56■■■■■ 5.04
SOD1-203ENST00000470944 CEP162Q5TB80 1403 aa46.51■■■■■ 5.04
SOD1-203ENST00000470944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
SOD1-203ENST00000470944 DISP1Q96F81 1524 aa46.45■■■■■ 5.03
SOD1-203ENST00000470944 CLIP1P30622 1438 aa46.45■■■■■ 5.03
SOD1-203ENST00000470944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.41■■■■■ 5.02
SOD1-203ENST00000470944 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.39■■■■■ 5.02
SOD1-203ENST00000470944 SAMD9Q5K651 1589 aa46.39■■■■■ 5.02
SOD1-203ENST00000470944 P3H3Q8IVL6 736 aa46.39■■■■■ 5.02
SOD1-203ENST00000470944 KIAA0556O60303 1618 aa46.34■■■■■ 5.01
SOD1-203ENST00000470944 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.33■■■■■ 5.01
SOD1-203ENST00000470944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.32■■■■■ 5.01
SOD1-203ENST00000470944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.25■■■■■ 4.99
SOD1-203ENST00000470944 ARHGEF11O15085 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
SOD1-203ENST00000470944 ARAP1Q96P48 1450 aa46.21■■■■■ 4.99
SOD1-203ENST00000470944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
SOD1-203ENST00000470944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
SOD1-203ENST00000470944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
SOD1-203ENST00000470944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
SOD1-203ENST00000470944 PTPRGP23470 1445 aa46.04■■■■■ 4.96
SOD1-203ENST00000470944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.03■■■■■ 4.96
SOD1-203ENST00000470944 FMN1Q68DA7 1419 aa45.91■■■■■ 4.94
SOD1-203ENST00000470944 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.87■■■■■ 4.93
SOD1-203ENST00000470944 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.84■■■■■ 4.93
SOD1-203ENST00000470944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.8■■■■■ 4.92
SOD1-203ENST00000470944 ABCA8O94911 1581 aa45.77■■■■■ 4.92
SOD1-203ENST00000470944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
SOD1-203ENST00000470944 UACAQ9BZF9 1416 aa45.75■■■■■ 4.91
SOD1-203ENST00000470944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.72■■■■■ 4.91
SOD1-203ENST00000470944 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.71■■■■■ 4.91
SOD1-203ENST00000470944 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
SOD1-203ENST00000470944 ABCC2Q92887 1545 aa45.64■■■■■ 4.9
SOD1-203ENST00000470944 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.64■■■■■ 4.9
SOD1-203ENST00000470944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
SOD1-203ENST00000470944 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.62■■■■■ 4.89
SOD1-203ENST00000470944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.61■■■■■ 4.89
SOD1-203ENST00000470944 ARID3CA6NKF2 412 aa45.6■■■■■ 4.89
SOD1-203ENST00000470944 HECW1Q76N89 1606 aa45.57■■■■■ 4.88
SOD1-203ENST00000470944 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.49■■■■■ 4.87
SOD1-203ENST00000470944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
SOD1-203ENST00000470944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
SOD1-203ENST00000470944 ATP10BO94823 1461 aa45.45■■■■■ 4.87
SOD1-203ENST00000470944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.42■■■■■ 4.86
SOD1-203ENST00000470944 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.36■■■■■ 4.85
SOD1-203ENST00000470944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
SOD1-203ENST00000470944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
SOD1-203ENST00000470944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
SOD1-203ENST00000470944 TIAM1Q13009 1591 aa45.28■■■■■ 4.84
SOD1-203ENST00000470944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.28■■■■■ 4.84
SOD1-203ENST00000470944 APLP2Q06481 763 aa45.27■■■■■ 4.84
SOD1-203ENST00000470944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.24■■■■■ 4.83
SOD1-203ENST00000470944 MAP3K1Q13233 1512 aa45.23■■■■■ 4.83
SOD1-203ENST00000470944 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
SOD1-203ENST00000470944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.18■■■■■ 4.82
SOD1-203ENST00000470944 ASXL2Q76L83 1435 aa45.11■■■■■ 4.81
SOD1-203ENST00000470944 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
SOD1-203ENST00000470944 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
SOD1-203ENST00000470944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.1■■■■■ 4.81
SOD1-203ENST00000470944 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.09■■■■■ 4.81
SOD1-203ENST00000470944 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.06■■■■■ 4.8
SOD1-203ENST00000470944 MAPKBP1O60336 1514 aa45.06■■■■■ 4.8
SOD1-203ENST00000470944 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
SOD1-203ENST00000470944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.02■■■■■ 4.8
SOD1-203ENST00000470944 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.98■■■■■ 4.79
SOD1-203ENST00000470944 KCNH8Q96L42 1107 aa44.95■■■■■ 4.79
SOD1-203ENST00000470944 KIF14Q15058 1648 aa44.89■■■■■ 4.78
SOD1-203ENST00000470944 NCOA2Q15596 1464 aa44.79■■■■■ 4.76
SOD1-203ENST00000470944 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
SOD1-203ENST00000470944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.75■■■■■ 4.754e-8■■■□□ 14.7
SOD1-203ENST00000470944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.74■■■■■ 4.75
SOD1-203ENST00000470944 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.71■■■■■ 4.75
SOD1-203ENST00000470944 DIP2BQ9P265 1576 aa44.71■■■■■ 4.75
SOD1-203ENST00000470944 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.67■■■■■ 4.74
SOD1-203ENST00000470944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.65■■■■■ 4.74
SOD1-203ENST00000470944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.64■■■■■ 4.74
SOD1-203ENST00000470944 GLI2P10070 1586 aa44.61■■■■■ 4.73
SOD1-203ENST00000470944 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.6■■■■■ 4.73
SOD1-203ENST00000470944 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
SOD1-203ENST00000470944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.55■■■■■ 4.72
SOD1-203ENST00000470944 CD109Q6YHK3 1445 aa44.51■■■■■ 4.72
SOD1-203ENST00000470944 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.5■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.5■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.49■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 PLCH2O75038 1416 aa44.47■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.46■■■■■ 4.71
SOD1-203ENST00000470944 PREX2Q70Z35 1606 aa44.44■■■■■ 4.7
SOD1-203ENST00000470944 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
SOD1-203ENST00000470944 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.41■■■■■ 4.7
SOD1-203ENST00000470944 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.4■■■■■ 4.7
SOD1-203ENST00000470944 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.38■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms