RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-215ENST00000468018 JPH4Q96JJ6 628 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-215ENST00000468018 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ATG4B-215ENST00000468018 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-215ENST00000468018 IQGAP2Q13576 1575 aa25.76■■□□□ 1.71
ATG4B-215ENST00000468018 PRXQ9BXM0 1461 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-215ENST00000468018 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.69■■□□□ 1.7
ATG4B-215ENST00000468018 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.64■■□□□ 1.7
ATG4B-215ENST00000468018 EEA1Q15075 1411 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-215ENST00000468018 DISP1Q96F81 1524 aa25.61■■□□□ 1.69
ATG4B-215ENST00000468018 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.58■■□□□ 1.69
ATG4B-215ENST00000468018 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
ATG4B-215ENST00000468018 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.57■■□□□ 1.68
ATG4B-215ENST00000468018 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.56■■□□□ 1.68
ATG4B-215ENST00000468018 KIAA0556O60303 1618 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4B-215ENST00000468018 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG4B-215ENST00000468018 PTPRGP23470 1445 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-215ENST00000468018 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-215ENST00000468018 MAPKBP1O60336 1514 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-215ENST00000468018 KIF21BO75037 1637 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-215ENST00000468018 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-215ENST00000468018 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
ATG4B-215ENST00000468018 GOLGA3Q08378 1498 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC2Q92887 1545 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-215ENST00000468018 UACAQ9BZF9 1416 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-215ENST00000468018 SAMD9Q5K651 1589 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-215ENST00000468018 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 DIP2BQ9P265 1576 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 ABCA8O94911 1581 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-215ENST00000468018 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-215ENST00000468018 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-215ENST00000468018 ASXL2Q76L83 1435 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-215ENST00000468018 GLI2P10070 1586 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-215ENST00000468018 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-215ENST00000468018 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-215ENST00000468018 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-215ENST00000468018 P3H3Q8IVL6 736 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-215ENST00000468018 TSPOAP1O95153 1857 aa25.08■■□□□ 1.61
ATG4B-215ENST00000468018 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 ATP10BO94823 1461 aa25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-215ENST00000468018 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-215ENST00000468018 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-215ENST00000468018 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-215ENST00000468018 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-215ENST00000468018 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-215ENST00000468018 KDM6BO15054 1643 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-215ENST00000468018 FMN1Q68DA7 1419 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-215ENST00000468018 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-215ENST00000468018 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4B-215ENST00000468018 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-215ENST00000468018 ARID3CA6NKF2 412 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-215ENST00000468018 HECW1Q76N89 1606 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-215ENST00000468018 CD109Q6YHK3 1445 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-215ENST00000468018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-215ENST00000468018 KCNH8Q96L42 1107 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-215ENST00000468018 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-215ENST00000468018 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-215ENST00000468018 CLIP1P30622 1438 aa24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-215ENST00000468018 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-215ENST00000468018 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.68■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.64■■□□□ 1.54
ATG4B-215ENST00000468018 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.62■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 NEO1Q92859 1461 aa24.61■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.6■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.6■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 CEP162Q5TB80 1403 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-215ENST00000468018 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 KIF14Q15058 1648 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-215ENST00000468018 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 PLCH2O75038 1416 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 FANCAO15360 1455 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 RICTORQ6R327 1708 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 AKNAQ7Z591 1439 aa24.45■■□□□ 1.51
ATG4B-215ENST00000468018 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.44■■□□□ 1.5
ATG4B-215ENST00000468018 PREX2Q70Z35 1606 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG4B-215ENST00000468018 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.39■■□□□ 1.5
ATG4B-215ENST00000468018 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-215ENST00000468018 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-215ENST00000468018 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-215ENST00000468018 RAPGEF3O95398 923 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-215ENST00000468018 ADGRL1O94910 1474 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms