RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467987.1

ESRRA-204, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-204ENST00000467987 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.15■■■■■ 5.14
ESRRA-204ENST00000467987 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
ESRRA-204ENST00000467987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.98■■■■■ 5.11
ESRRA-204ENST00000467987 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.97■■■■■ 5.11
ESRRA-204ENST00000467987 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.59■■■■■ 5.05
ESRRA-204ENST00000467987 IQGAP2Q13576 1575 aa46.57■■■■■ 5.05
ESRRA-204ENST00000467987 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.04
ESRRA-204ENST00000467987 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.54■■■■■ 5.04
ESRRA-204ENST00000467987 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.51■■■■■ 5.04
ESRRA-204ENST00000467987 PTPRGP23470 1445 aa46.47■■■■■ 5.03
ESRRA-204ENST00000467987 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.45■■■■■ 5.03
ESRRA-204ENST00000467987 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.43■■■■■ 5.02
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ESRRA-204ENST00000467987 DISP1Q96F81 1524 aa46.32■■■■■ 5.01
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ESRRA-204ENST00000467987 ASXL2Q76L83 1435 aa45.95■■■■■ 4.95
ESRRA-204ENST00000467987 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.93■■■■■ 4.94
ESRRA-204ENST00000467987 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.91■■■■■ 4.94
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ESRRA-204ENST00000467987 KDM6BO15054 1643 aa45.7■■■■■ 4.91
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ESRRA-204ENST00000467987 SAMD9Q5K651 1589 aa45.54■■■■■ 4.88
ESRRA-204ENST00000467987 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.5■■■■■ 4.87
ESRRA-204ENST00000467987 KIF21BO75037 1637 aa45.44■■■■■ 4.87
ESRRA-204ENST00000467987 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
ESRRA-204ENST00000467987 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.4■■■■■ 4.86
ESRRA-204ENST00000467987 KCNH8Q96L42 1107 aa45.39■■■■■ 4.86
ESRRA-204ENST00000467987 ARID3CA6NKF2 412 aa45.36■■■■■ 4.85
ESRRA-204ENST00000467987 ATP10BO94823 1461 aa45.34■■■■■ 4.85
ESRRA-204ENST00000467987 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.3■■■■■ 4.84
ESRRA-204ENST00000467987 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.28■■■■■ 4.84
ESRRA-204ENST00000467987 CD109Q6YHK3 1445 aa45.27■■■■■ 4.84
ESRRA-204ENST00000467987 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
ESRRA-204ENST00000467987 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.26■■■■■ 4.84
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ESRRA-204ENST00000467987 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.18■■■■■ 4.82
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ESRRA-204ENST00000467987 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
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ESRRA-204ENST00000467987 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.85■■■■■ 4.77
ESRRA-204ENST00000467987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.84■■■■■ 4.77
ESRRA-204ENST00000467987 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.82■■■■■ 4.76
ESRRA-204ENST00000467987 ADGRL1O94910 1474 aa44.8■■■■■ 4.76
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ESRRA-204ENST00000467987 NEO1Q92859 1461 aa44.74■■■■■ 4.75
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ESRRA-204ENST00000467987 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
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ESRRA-204ENST00000467987 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.49■■■■■ 4.71
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ESRRA-204ENST00000467987 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.25■■■■■ 4.67
ESRRA-204ENST00000467987 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.24■■■■■ 4.67
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ESRRA-204ENST00000467987 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.19■■■■■ 4.67
ESRRA-204ENST00000467987 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
ESRRA-204ENST00000467987 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.18■■■■■ 4.66
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