RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 SHROOM2Q13796 1616 aa26.33■■□□□ 1.81
GPC1-207ENST00000466624 GOLGA3Q08378 1498 aa26.32■■□□□ 1.8
GPC1-207ENST00000466624 IQGAP2Q13576 1575 aa26.3■■□□□ 1.8
GPC1-207ENST00000466624 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.3■■□□□ 1.8
GPC1-207ENST00000466624 JPH4Q96JJ6 628 aa26.19■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 ARHGEF11O15085 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.18■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
GPC1-207ENST00000466624 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
GPC1-207ENST00000466624 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GPC1-207ENST00000466624 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.09■■□□□ 1.77
GPC1-207ENST00000466624 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.06■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 DISP1Q96F81 1524 aa26.06■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.06■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 KIAA0556O60303 1618 aa26.05■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.05■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 SAMD9Q5K651 1589 aa26.03■■□□□ 1.76
GPC1-207ENST00000466624 EFCAB5A4FU69 1503 aa26■■□□□ 1.75
GPC1-207ENST00000466624 ARAP1Q96P48 1450 aa25.99■■□□□ 1.75
GPC1-207ENST00000466624 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.91■■□□□ 1.74
GPC1-207ENST00000466624 PTPRGP23470 1445 aa25.87■■□□□ 1.73
GPC1-207ENST00000466624 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.86■■□□□ 1.73
GPC1-207ENST00000466624 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GPC1-207ENST00000466624 CLIP1P30622 1438 aa25.82■■□□□ 1.72
GPC1-207ENST00000466624 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.82■■□□□ 1.72
GPC1-207ENST00000466624 CEP162Q5TB80 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
GPC1-207ENST00000466624 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.8■■□□□ 1.72
GPC1-207ENST00000466624 P3H3Q8IVL6 736 aa25.78■■□□□ 1.72
GPC1-207ENST00000466624 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.74■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 ABCA8O94911 1581 aa25.73■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 UACAQ9BZF9 1416 aa25.73■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.73■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 ABCC2Q92887 1545 aa25.72■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 FMN1Q68DA7 1419 aa25.71■■□□□ 1.71
GPC1-207ENST00000466624 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
GPC1-207ENST00000466624 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.69■■□□□ 1.7
GPC1-207ENST00000466624 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.69■■□□□ 1.7
GPC1-207ENST00000466624 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.6■■□□□ 1.69
GPC1-207ENST00000466624 HECW1Q76N89 1606 aa25.58■■□□□ 1.69
GPC1-207ENST00000466624 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.54■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 MAPKBP1O60336 1514 aa25.53■■□□□ 1.68
GPC1-207ENST00000466624 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.5■■□□□ 1.67
GPC1-207ENST00000466624 ATP10BO94823 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
GPC1-207ENST00000466624 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.47■■□□□ 1.67
GPC1-207ENST00000466624 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
GPC1-207ENST00000466624 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.43■■□□□ 1.66
GPC1-207ENST00000466624 ASXL2Q76L83 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
GPC1-207ENST00000466624 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
GPC1-207ENST00000466624 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GPC1-207ENST00000466624 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.36■■□□□ 1.65
GPC1-207ENST00000466624 ARID3CA6NKF2 412 aa25.34■■□□□ 1.65
GPC1-207ENST00000466624 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.32■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 DIP2BQ9P265 1576 aa25.31■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.31■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.3■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 MAP3K1Q13233 1512 aa25.29■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 GLI2P10070 1586 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 TIAM1Q13009 1591 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-207ENST00000466624 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GPC1-207ENST00000466624 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.22■■□□□ 1.63
GPC1-207ENST00000466624 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.18■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 KIF14Q15058 1648 aa25.18■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.17■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.16■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 APLP2Q06481 763 aa25.14■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 KCNH8Q96L42 1107 aa25.14■■□□□ 1.62
GPC1-207ENST00000466624 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-207ENST00000466624 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-207ENST00000466624 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-207ENST00000466624 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.1■■□□□ 1.61
GPC1-207ENST00000466624 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GPC1-207ENST00000466624 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GPC1-207ENST00000466624 CD109Q6YHK3 1445 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-207ENST00000466624 TSPOAP1O95153 1857 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-207ENST00000466624 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-207ENST00000466624 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-207ENST00000466624 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 TEX14Q8IWB6 1497 aa25■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 PREX2Q70Z35 1606 aa24.98■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 NCOA2Q15596 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 PLCH2O75038 1416 aa24.97■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.97■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-207ENST00000466624 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GPC1-207ENST00000466624 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.92■■□□□ 1.58
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