RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 GRIN2AQ12879 1464 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPN3-209ENST00000466222 P3H3Q8IVL6 736 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPN3-209ENST00000466222 CEP170Q5SW79 1584 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPN3-209ENST00000466222 ARAP1Q96P48 1450 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPN3-209ENST00000466222 NUP160Q12769 1436 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPN3-209ENST00000466222 HRCP23327 699 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPN3-209ENST00000466222 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPN3-209ENST00000466222 IQGAP2Q13576 1575 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPN3-209ENST00000466222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPN3-209ENST00000466222 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPN3-209ENST00000466222 JPH4Q96JJ6 628 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPN3-209ENST00000466222 CHD1O14646 1710 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPN3-209ENST00000466222 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPN3-209ENST00000466222 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPN3-209ENST00000466222 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPN3-209ENST00000466222 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPN3-209ENST00000466222 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPN3-209ENST00000466222 SAMD9Q5K651 1589 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPN3-209ENST00000466222 DISP1Q96F81 1524 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPN3-209ENST00000466222 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CAPN3-209ENST00000466222 OSCARQ8IYS5 282 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPN3-209ENST00000466222 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA0556O60303 1618 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPN3-209ENST00000466222 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPN3-209ENST00000466222 FMN1Q68DA7 1419 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPN3-209ENST00000466222 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPN3-209ENST00000466222 APLP2Q06481 763 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPN3-209ENST00000466222 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 ARID3CA6NKF2 412 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPN3-209ENST00000466222 SHROOM2Q13796 1616 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPN3-209ENST00000466222 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRGP23470 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPN3-209ENST00000466222 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPN3-209ENST00000466222 TIAM1Q13009 1591 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPN3-209ENST00000466222 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPN3-209ENST00000466222 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K1Q13233 1512 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPN3-209ENST00000466222 HECW1Q76N89 1606 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPN3-209ENST00000466222 ABCA8O94911 1581 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPN3-209ENST00000466222 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPN3-209ENST00000466222 UACAQ9BZF9 1416 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPN3-209ENST00000466222 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPN3-209ENST00000466222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPN3-209ENST00000466222 ATP10BO94823 1461 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF11O15085 1522 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPN3-209ENST00000466222 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC2Q92887 1545 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPN3-209ENST00000466222 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPN3-209ENST00000466222 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPN3-209ENST00000466222 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPN3-209ENST00000466222 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPN3-209ENST00000466222 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPN3-209ENST00000466222 NCOA2Q15596 1464 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPN3-209ENST00000466222 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPN3-209ENST00000466222 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPN3-209ENST00000466222 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 KCNH8Q96L42 1107 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPN3-209ENST00000466222 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 ITGAEP38570 1179 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 KIF14Q15058 1648 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 ASXL2Q76L83 1435 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPN3-209ENST00000466222 MIA2Q96PC5 1412 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPN3-209ENST00000466222 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
CAPN3-209ENST00000466222 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPN3-209ENST00000466222 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
CAPN3-209ENST00000466222 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRKQ15262 1439 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPN3-209ENST00000466222 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CAPN3-209ENST00000466222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.85■■■□□ 2.05
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