RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-214ENST00000465399 KIF27Q86VH2 1401 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-214ENST00000465399 IGF1RP08069 1367 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-214ENST00000465399 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-214ENST00000465399 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-214ENST00000465399 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-214ENST00000465399 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-214ENST00000465399 MAPKBP1O60336 1514 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-214ENST00000465399 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-214ENST00000465399 DIP2BQ9P265 1576 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-214ENST00000465399 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-214ENST00000465399 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-214ENST00000465399 IQGAP2Q13576 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-214ENST00000465399 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.64■■□□□ 1.54
ATG4B-214ENST00000465399 PTPRGP23470 1445 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-214ENST00000465399 TSPOAP1O95153 1857 aa24.62■■□□□ 1.53
ATG4B-214ENST00000465399 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.59■■□□□ 1.53
ATG4B-214ENST00000465399 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-214ENST00000465399 KDM6BO15054 1643 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-214ENST00000465399 ABCC2Q92887 1545 aa24.54■■□□□ 1.52
ATG4B-214ENST00000465399 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-214ENST00000465399 DISP1Q96F81 1524 aa24.51■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.46■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.45■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 UACAQ9BZF9 1416 aa24.45■■□□□ 1.51
ATG4B-214ENST00000465399 KIAA0556O60303 1618 aa24.45■■□□□ 1.5
ATG4B-214ENST00000465399 ASXL2Q76L83 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
ATG4B-214ENST00000465399 GLI2P10070 1586 aa24.42■■□□□ 1.5
ATG4B-214ENST00000465399 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ATG4B-214ENST00000465399 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-214ENST00000465399 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-214ENST00000465399 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-214ENST00000465399 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-214ENST00000465399 GOLGA3Q08378 1498 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4B-214ENST00000465399 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4B-214ENST00000465399 PRXQ9BXM0 1461 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-214ENST00000465399 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4B-214ENST00000465399 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-214ENST00000465399 ABCA8O94911 1581 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG4B-214ENST00000465399 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.16■■□□□ 1.46
ATG4B-214ENST00000465399 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-214ENST00000465399 ADGRL1O94910 1474 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-214ENST00000465399 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-214ENST00000465399 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4B-214ENST00000465399 CD109Q6YHK3 1445 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4B-214ENST00000465399 KCNH8Q96L42 1107 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-214ENST00000465399 SAMD9Q5K651 1589 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4B-214ENST00000465399 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-214ENST00000465399 P3H3Q8IVL6 736 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-214ENST00000465399 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.96■■□□□ 1.43
ATG4B-214ENST00000465399 ATP10BO94823 1461 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-214ENST00000465399 EEA1Q15075 1411 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-214ENST00000465399 ARID3CA6NKF2 412 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG4B-214ENST00000465399 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG4B-214ENST00000465399 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-214ENST00000465399 KIF21BO75037 1637 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-214ENST00000465399 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-214ENST00000465399 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-214ENST00000465399 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.8■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 NEO1Q92859 1461 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-214ENST00000465399 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.69■■□□□ 1.38
ATG4B-214ENST00000465399 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.69■■□□□ 1.38
ATG4B-214ENST00000465399 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-214ENST00000465399 RAPGEF3O95398 923 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-214ENST00000465399 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-214ENST00000465399 RICTORQ6R327 1708 aa23.64■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 FANCAO15360 1455 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 AKNAQ7Z591 1439 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-214ENST00000465399 PTPRMP28827 1452 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 HECW1Q76N89 1606 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 MADDQ8WXG6 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 FMN1Q68DA7 1419 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-214ENST00000465399 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-214ENST00000465399 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 PLCH2O75038 1416 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 KIF14Q15058 1648 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.44■■□□□ 1.34
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