RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465120.3

HOXB3-204, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB3, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-204ENST00000465120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-204ENST00000465120 CUL7Q14999 1698 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-204ENST00000465120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-204ENST00000465120 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-204ENST00000465120 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-204ENST00000465120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-204ENST00000465120 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-204ENST00000465120 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-204ENST00000465120 PTPRGP23470 1445 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-204ENST00000465120 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-204ENST00000465120 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-204ENST00000465120 IQGAP2Q13576 1575 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-204ENST00000465120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-204ENST00000465120 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-204ENST00000465120 MAPKBP1O60336 1514 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-204ENST00000465120 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-204ENST00000465120 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-204ENST00000465120 DIP2BQ9P265 1576 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-204ENST00000465120 DISP1Q96F81 1524 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-204ENST00000465120 ABCC2Q92887 1545 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-204ENST00000465120 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-204ENST00000465120 UACAQ9BZF9 1416 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-204ENST00000465120 TSPOAP1O95153 1857 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-204ENST00000465120 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-204ENST00000465120 KIAA0556O60303 1618 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-204ENST00000465120 ASXL2Q76L83 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-204ENST00000465120 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-204ENST00000465120 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-204ENST00000465120 PRXQ9BXM0 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-204ENST00000465120 GOLGA3Q08378 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB3-204ENST00000465120 KDM6BO15054 1643 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB3-204ENST00000465120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-204ENST00000465120 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-204ENST00000465120 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-204ENST00000465120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-204ENST00000465120 GLI2P10070 1586 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-204ENST00000465120 P3H3Q8IVL6 736 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-204ENST00000465120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-204ENST00000465120 KCNH8Q96L42 1107 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 ABCA8O94911 1581 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 EEA1Q15075 1411 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 ARID3CA6NKF2 412 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXB3-204ENST00000465120 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-204ENST00000465120 CD109Q6YHK3 1445 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 SAMD9Q5K651 1589 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-204ENST00000465120 ATP10BO94823 1461 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-204ENST00000465120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-204ENST00000465120 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-204ENST00000465120 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB3-204ENST00000465120 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB3-204ENST00000465120 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB3-204ENST00000465120 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB3-204ENST00000465120 KIF21BO75037 1637 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB3-204ENST00000465120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXB3-204ENST00000465120 ADGRL1O94910 1474 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXB3-204ENST00000465120 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXB3-204ENST00000465120 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-204ENST00000465120 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-204ENST00000465120 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-204ENST00000465120 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-204ENST00000465120 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-204ENST00000465120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB3-204ENST00000465120 RAPGEF3O95398 923 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-204ENST00000465120 NEO1Q92859 1461 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-204ENST00000465120 FMN1Q68DA7 1419 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB3-204ENST00000465120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-204ENST00000465120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-204ENST00000465120 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.641e-8■■□□□ 11.7
HOXB3-204ENST00000465120 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-204ENST00000465120 AKNAQ7Z591 1439 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-204ENST00000465120 HECW1Q76N89 1606 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 FANCAO15360 1455 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-204ENST00000465120 PLCH2O75038 1416 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-204ENST00000465120 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-204ENST00000465120 RICTORQ6R327 1708 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 CLIP1P30622 1438 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 KIF14Q15058 1648 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-204ENST00000465120 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 PTPRMP28827 1452 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.05■■□□□ 1.6
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