RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463965.1

SURF1-203, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SURF1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-203ENST00000463965 ARAP1Q96P48 1450 aa43.76■■■■■ 4.6
SURF1-203ENST00000463965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.75■■■■■ 4.59
SURF1-203ENST00000463965 EEA1Q15075 1411 aa43.73■■■■■ 4.59
SURF1-203ENST00000463965 SHROOM2Q13796 1616 aa43.72■■■■■ 4.59
SURF1-203ENST00000463965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.69■■■■■ 4.58
SURF1-203ENST00000463965 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
SURF1-203ENST00000463965 PRXQ9BXM0 1461 aa43.61■■■■■ 4.57
SURF1-203ENST00000463965 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.57■■■■■ 4.57
SURF1-203ENST00000463965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
SURF1-203ENST00000463965 IQGAP2Q13576 1575 aa43.47■■■■■ 4.55
SURF1-203ENST00000463965 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.35■■■■■ 4.53
SURF1-203ENST00000463965 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.28■■■■■ 4.52
SURF1-203ENST00000463965 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.24■■■■■ 4.51
SURF1-203ENST00000463965 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.18■■■■■ 4.5
SURF1-203ENST00000463965 KIF21BO75037 1637 aa43.16■■■■■ 4.5
SURF1-203ENST00000463965 PTPRGP23470 1445 aa43.15■■■■■ 4.5
SURF1-203ENST00000463965 DISP1Q96F81 1524 aa43.14■■■■■ 4.5
SURF1-203ENST00000463965 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
SURF1-203ENST00000463965 GOLGA3Q08378 1498 aa43.09■■■■■ 4.49
SURF1-203ENST00000463965 KIAA0556O60303 1618 aa43.03■■■■■ 4.48
SURF1-203ENST00000463965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.99■■■■■ 4.47
SURF1-203ENST00000463965 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
SURF1-203ENST00000463965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SURF1-203ENST00000463965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.97■■■■■ 4.47
SURF1-203ENST00000463965 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.87■■■■■ 4.45
SURF1-203ENST00000463965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
SURF1-203ENST00000463965 UACAQ9BZF9 1416 aa42.84■■■■■ 4.45
SURF1-203ENST00000463965 P3H3Q8IVL6 736 aa42.81■■■■■ 4.44
SURF1-203ENST00000463965 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.77■■■■■ 4.44
SURF1-203ENST00000463965 SAMD9Q5K651 1589 aa42.73■■■■■ 4.43
SURF1-203ENST00000463965 ABCC2Q92887 1545 aa42.71■■■■■ 4.43
SURF1-203ENST00000463965 MAPKBP1O60336 1514 aa42.64■■■■■ 4.42
SURF1-203ENST00000463965 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.63■■■■■ 4.42
SURF1-203ENST00000463965 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.62■■■■■ 4.41
SURF1-203ENST00000463965 ABCA8O94911 1581 aa42.56■■■■■ 4.4
SURF1-203ENST00000463965 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.55■■■■■ 4.4
SURF1-203ENST00000463965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.55■■■■■ 4.4
SURF1-203ENST00000463965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.47■■■■■ 4.39
SURF1-203ENST00000463965 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.46■■■■■ 4.39
SURF1-203ENST00000463965 ASXL2Q76L83 1435 aa42.45■■■■■ 4.39
SURF1-203ENST00000463965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
SURF1-203ENST00000463965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.39■■■■■ 4.38
SURF1-203ENST00000463965 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.36■■■■■ 4.37
SURF1-203ENST00000463965 DIP2BQ9P265 1576 aa42.34■■■■■ 4.37
SURF1-203ENST00000463965 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.34■■■■■ 4.37
SURF1-203ENST00000463965 ARID3CA6NKF2 412 aa42.31■■■■■ 4.36
SURF1-203ENST00000463965 FMN1Q68DA7 1419 aa42.29■■■■■ 4.36
SURF1-203ENST00000463965 ATP10BO94823 1461 aa42.25■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.23■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 CLIP1P30622 1438 aa42.21■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
SURF1-203ENST00000463965 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
SURF1-203ENST00000463965 GLI2P10070 1586 aa42.15■■■■■ 4.34
SURF1-203ENST00000463965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
SURF1-203ENST00000463965 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.13■■■■■ 4.33
SURF1-203ENST00000463965 KCNH8Q96L42 1107 aa42.13■■■■■ 4.33
SURF1-203ENST00000463965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.03■■■■■ 4.32
SURF1-203ENST00000463965 HECW1Q76N89 1606 aa42.02■■■■■ 4.32
SURF1-203ENST00000463965 CEP162Q5TB80 1403 aa42.01■■■■■ 4.32
SURF1-203ENST00000463965 TSPOAP1O95153 1857 aa42■■■■■ 4.31
SURF1-203ENST00000463965 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.93■■■■■ 4.3
SURF1-203ENST00000463965 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.92■■■■■ 4.3
SURF1-203ENST00000463965 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
SURF1-203ENST00000463965 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SURF1-203ENST00000463965 CD109Q6YHK3 1445 aa41.88■■■■■ 4.3
SURF1-203ENST00000463965 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.85■■■■■ 4.29
SURF1-203ENST00000463965 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.84■■■■■ 4.29
SURF1-203ENST00000463965 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
SURF1-203ENST00000463965 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.81■■■■■ 4.28
SURF1-203ENST00000463965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
SURF1-203ENST00000463965 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.78■■■■■ 4.28
SURF1-203ENST00000463965 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.75■■■■■ 4.27
SURF1-203ENST00000463965 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.74■■■■■ 4.27
SURF1-203ENST00000463965 KDM6BO15054 1643 aa41.7■■■■■ 4.27
SURF1-203ENST00000463965 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.65■■■■■ 4.26
SURF1-203ENST00000463965 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
SURF1-203ENST00000463965 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.253e-8■□□□□ 10.1
SURF1-203ENST00000463965 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.54■■■■■ 4.24
SURF1-203ENST00000463965 KIF14Q15058 1648 aa41.51■■■■■ 4.24
SURF1-203ENST00000463965 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.51■■■■■ 4.24
SURF1-203ENST00000463965 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.5■■■■■ 4.23
SURF1-203ENST00000463965 NEO1Q92859 1461 aa41.47■■■■■ 4.23
SURF1-203ENST00000463965 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
SURF1-203ENST00000463965 PLCH2O75038 1416 aa41.41■■■■■ 4.22
SURF1-203ENST00000463965 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.4■■■■■ 4.22
SURF1-203ENST00000463965 FANCAO15360 1455 aa41.39■■■■■ 4.22
SURF1-203ENST00000463965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.39■■■■■ 4.22
SURF1-203ENST00000463965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.36■■■■■ 4.21
SURF1-203ENST00000463965 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.33■■■■■ 4.21
SURF1-203ENST00000463965 AKNAQ7Z591 1439 aa41.33■■■■■ 4.21
SURF1-203ENST00000463965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.32■■■■■ 4.2
SURF1-203ENST00000463965 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.23■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.23■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 RAPGEF3O95398 923 aa41.22■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 APLP2Q06481 763 aa41.21■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 TIAM1Q13009 1591 aa41.2■■■■■ 4.19
SURF1-203ENST00000463965 ADGRL1O94910 1474 aa41.17■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms