RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462384.6

TMX4-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMX4, Length 873 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-202ENST00000462384 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
TMX4-202ENST00000462384 JPH4Q96JJ6 628 aa35.39■■■■□ 3.26
TMX4-202ENST00000462384 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.38■■■■□ 3.25
TMX4-202ENST00000462384 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.3■■■■□ 3.24
TMX4-202ENST00000462384 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
TMX4-202ENST00000462384 IQGAP2Q13576 1575 aa35.08■■■■□ 3.21
TMX4-202ENST00000462384 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.96■■■■□ 3.19
TMX4-202ENST00000462384 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.92■■■■□ 3.18
TMX4-202ENST00000462384 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
TMX4-202ENST00000462384 PTPRGP23470 1445 aa34.89■■■■□ 3.18
TMX4-202ENST00000462384 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.87■■■■□ 3.17
TMX4-202ENST00000462384 DISP1Q96F81 1524 aa34.87■■■■□ 3.17
TMX4-202ENST00000462384 PRXQ9BXM0 1461 aa34.87■■■■□ 3.17
TMX4-202ENST00000462384 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.85■■■■□ 3.17
TMX4-202ENST00000462384 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.85■■■■□ 3.17
TMX4-202ENST00000462384 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.82■■■■□ 3.16
TMX4-202ENST00000462384 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.81■■■■□ 3.16
TMX4-202ENST00000462384 MAPKBP1O60336 1514 aa34.77■■■■□ 3.16
TMX4-202ENST00000462384 KIAA0556O60303 1618 aa34.77■■■■□ 3.16
TMX4-202ENST00000462384 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.71■■■■□ 3.15
TMX4-202ENST00000462384 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.69■■■■□ 3.14
TMX4-202ENST00000462384 DIP2BQ9P265 1576 aa34.66■■■■□ 3.14
TMX4-202ENST00000462384 ABCC2Q92887 1545 aa34.65■■■■□ 3.14
TMX4-202ENST00000462384 UACAQ9BZF9 1416 aa34.64■■■■□ 3.14
TMX4-202ENST00000462384 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.64■■■■□ 3.14
TMX4-202ENST00000462384 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.62■■■■□ 3.13
TMX4-202ENST00000462384 EEA1Q15075 1411 aa34.62■■■■□ 3.13
TMX4-202ENST00000462384 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
TMX4-202ENST00000462384 GOLGA3Q08378 1498 aa34.58■■■■□ 3.13
TMX4-202ENST00000462384 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.54■■■■□ 3.12
TMX4-202ENST00000462384 ASXL2Q76L83 1435 aa34.49■■■■□ 3.11
TMX4-202ENST00000462384 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.48■■■■□ 3.11
TMX4-202ENST00000462384 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.48■■■■□ 3.11
TMX4-202ENST00000462384 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
TMX4-202ENST00000462384 TSPOAP1O95153 1857 aa34.44■■■■□ 3.1
TMX4-202ENST00000462384 P3H3Q8IVL6 736 aa34.41■■■■□ 3.1
TMX4-202ENST00000462384 ABCA8O94911 1581 aa34.4■■■■□ 3.1
TMX4-202ENST00000462384 KIF21BO75037 1637 aa34.37■■■■□ 3.09
TMX4-202ENST00000462384 SAMD9Q5K651 1589 aa34.36■■■■□ 3.09
TMX4-202ENST00000462384 GLI2P10070 1586 aa34.32■■■■□ 3.09
TMX4-202ENST00000462384 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
TMX4-202ENST00000462384 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
TMX4-202ENST00000462384 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.25■■■■□ 3.07
TMX4-202ENST00000462384 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
TMX4-202ENST00000462384 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.23■■■■□ 3.07
TMX4-202ENST00000462384 KDM6BO15054 1643 aa34.22■■■■□ 3.07
TMX4-202ENST00000462384 ARID3CA6NKF2 412 aa34.2■■■■□ 3.07
TMX4-202ENST00000462384 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.19■■■■□ 3.06
TMX4-202ENST00000462384 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.17■■■■□ 3.06
TMX4-202ENST00000462384 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.14■■■■□ 3.06
TMX4-202ENST00000462384 ATP10BO94823 1461 aa34.11■■■■□ 3.05
TMX4-202ENST00000462384 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
TMX4-202ENST00000462384 KCNH8Q96L42 1107 aa34.09■■■■□ 3.05
TMX4-202ENST00000462384 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.08■■■■□ 3.05
TMX4-202ENST00000462384 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
TMX4-202ENST00000462384 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.01■■■■□ 3.03
TMX4-202ENST00000462384 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.99■■■■□ 3.03
TMX4-202ENST00000462384 CD109Q6YHK3 1445 aa33.96■■■■□ 3.03
TMX4-202ENST00000462384 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
TMX4-202ENST00000462384 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
TMX4-202ENST00000462384 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TMX4-202ENST00000462384 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
TMX4-202ENST00000462384 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.9■■■■□ 3.02
TMX4-202ENST00000462384 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
TMX4-202ENST00000462384 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.84■■■■□ 3.01
TMX4-202ENST00000462384 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
TMX4-202ENST00000462384 FMN1Q68DA7 1419 aa33.74■■■□□ 2.99
TMX4-202ENST00000462384 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.72■■■□□ 2.99
TMX4-202ENST00000462384 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
TMX4-202ENST00000462384 HECW1Q76N89 1606 aa33.7■■■□□ 2.99
TMX4-202ENST00000462384 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.66■■■□□ 2.98
TMX4-202ENST00000462384 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.62■■■□□ 2.97
TMX4-202ENST00000462384 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.62■■■□□ 2.97
TMX4-202ENST00000462384 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.6■■■□□ 2.97
TMX4-202ENST00000462384 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.58■■■□□ 2.97
TMX4-202ENST00000462384 NEO1Q92859 1461 aa33.57■■■□□ 2.97
TMX4-202ENST00000462384 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.54■■■□□ 2.96
TMX4-202ENST00000462384 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
TMX4-202ENST00000462384 ADGRL1O94910 1474 aa33.52■■■□□ 2.96
TMX4-202ENST00000462384 CLIP1P30622 1438 aa33.51■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 RAPGEF3O95398 923 aa33.48■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.47■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 FANCAO15360 1455 aa33.46■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.45■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 KIF14Q15058 1648 aa33.45■■■□□ 2.95
TMX4-202ENST00000462384 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.43■■■□□ 2.94
TMX4-202ENST00000462384 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
TMX4-202ENST00000462384 AKNAQ7Z591 1439 aa33.42■■■□□ 2.94
TMX4-202ENST00000462384 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
TMX4-202ENST00000462384 PLCH2O75038 1416 aa33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 RICTORQ6R327 1708 aa33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.36■■■□□ 2.93
TMX4-202ENST00000462384 CEP162Q5TB80 1403 aa33.26■■■□□ 2.91
TMX4-202ENST00000462384 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.23■■■□□ 2.91
TMX4-202ENST00000462384 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.23■■■□□ 2.91
TMX4-202ENST00000462384 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.22■■■□□ 2.91
TMX4-202ENST00000462384 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms