RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 NUP160Q12769 1436 aa15.81■□□□□ 0.12
PKP4-208ENST00000462335 CEP170Q5SW79 1584 aa15.8■□□□□ 0.12
PKP4-208ENST00000462335 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.8■□□□□ 0.12
PKP4-208ENST00000462335 EEA1Q15075 1411 aa15.79■□□□□ 0.12
PKP4-208ENST00000462335 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.74■□□□□ 0.11
PKP4-208ENST00000462335 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PKP4-208ENST00000462335 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PKP4-208ENST00000462335 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.71■□□□□ 0.11
PKP4-208ENST00000462335 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.69■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 ARAP1Q96P48 1450 aa15.68■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 PRXQ9BXM0 1461 aa15.66■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 IQGAP2Q13576 1575 aa15.66■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 SHROOM2Q13796 1616 aa15.65■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PKP4-208ENST00000462335 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PKP4-208ENST00000462335 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.61■□□□□ 0.09
PKP4-208ENST00000462335 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.6■□□□□ 0.09
PKP4-208ENST00000462335 PTPRGP23470 1445 aa15.6■□□□□ 0.09
PKP4-208ENST00000462335 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.58■□□□□ 0.08
PKP4-208ENST00000462335 GOLGA3Q08378 1498 aa15.58■□□□□ 0.08
PKP4-208ENST00000462335 P3H3Q8IVL6 736 aa15.56■□□□□ 0.08
PKP4-208ENST00000462335 KIF21BO75037 1637 aa15.54■□□□□ 0.08
PKP4-208ENST00000462335 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.53■□□□□ 0.08
PKP4-208ENST00000462335 DISP1Q96F81 1524 aa15.48■□□□□ 0.07
PKP4-208ENST00000462335 KIAA0556O60303 1618 aa15.46■□□□□ 0.07
PKP4-208ENST00000462335 UACAQ9BZF9 1416 aa15.44■□□□□ 0.06
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PKP4-208ENST00000462335 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PKP4-208ENST00000462335 ARID3CA6NKF2 412 aa15.38■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.38■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.37■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.37■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 ABCC2Q92887 1545 aa15.36■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.35■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.35■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.34■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 SAMD9Q5K651 1589 aa15.33■□□□□ 0.05
PKP4-208ENST00000462335 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.32■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 KCNH8Q96L42 1107 aa15.31■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 FMN1Q68DA7 1419 aa15.29■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 MAPKBP1O60336 1514 aa15.28■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 ASXL2Q76L83 1435 aa15.28■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 ABCA8O94911 1581 aa15.28■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 CLIP1P30622 1438 aa15.27■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.27■□□□□ 0.04
PKP4-208ENST00000462335 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.27■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.26■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.25■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.25■□□□□ 0.03
PKP4-208ENST00000462335 ATP10BO94823 1461 aa15.2■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.2■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 TSPOAP1O95153 1857 aa15.18■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 CEP162Q5TB80 1403 aa15.18■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.18■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 DIP2BQ9P265 1576 aa15.18■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 HECW1Q76N89 1606 aa15.16■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PKP4-208ENST00000462335 GLI2P10070 1586 aa15.12■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 CD109Q6YHK3 1445 aa15.12■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 APLP2Q06481 763 aa15.12■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.11■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.11■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.08■□□□□ 0.01
PKP4-208ENST00000462335 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.08■□□□□ 0
PKP4-208ENST00000462335 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PKP4-208ENST00000462335 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.06■□□□□ 0
PKP4-208ENST00000462335 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.03■□□□□ -0
PKP4-208ENST00000462335 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.02■□□□□ -0
PKP4-208ENST00000462335 KDM6BO15054 1643 aa15.02□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 KIF14Q15058 1648 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP4-208ENST00000462335 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 FANCAO15360 1455 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 NEO1Q92859 1461 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.92□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.92□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.92□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 PLCH2O75038 1416 aa14.92□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 AKNAQ7Z591 1439 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 RAPGEF3O95398 923 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-208ENST00000462335 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms