RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.91■■■□□ 2.7
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SNHG12-201ENST00000461448 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.8■■■□□ 2.68
SNHG12-201ENST00000461448 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.8■■■□□ 2.68
SNHG12-201ENST00000461448 IQGAP2Q13576 1575 aa31.8■■■□□ 2.68
SNHG12-201ENST00000461448 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.77■■■□□ 2.68
SNHG12-201ENST00000461448 SHROOM2Q13796 1616 aa31.71■■■□□ 2.67
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SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF11O15085 1522 aa31.63■■■□□ 2.65
SNHG12-201ENST00000461448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.6■■■□□ 2.65
SNHG12-201ENST00000461448 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
SNHG12-201ENST00000461448 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.56■■■□□ 2.64
SNHG12-201ENST00000461448 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.56■■■□□ 2.64
SNHG12-201ENST00000461448 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.56■■■□□ 2.64
SNHG12-201ENST00000461448 DISP1Q96F81 1524 aa31.54■■■□□ 2.64
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SNHG12-201ENST00000461448 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
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SNHG12-201ENST00000461448 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.41■■■□□ 2.62
SNHG12-201ENST00000461448 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.4■■■□□ 2.62
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SNHG12-201ENST00000461448 PTPRGP23470 1445 aa31.39■■■□□ 2.62
SNHG12-201ENST00000461448 CEP162Q5TB80 1403 aa31.38■■■□□ 2.61
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.37■■■□□ 2.61
SNHG12-201ENST00000461448 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.36■■■□□ 2.61
SNHG12-201ENST00000461448 UACAQ9BZF9 1416 aa31.17■■■□□ 2.58
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SNHG12-201ENST00000461448 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.07■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.07■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.05■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 ARID3CA6NKF2 412 aa31.02■■■□□ 2.56
SNHG12-201ENST00000461448 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.97■■■□□ 2.55
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SNHG12-201ENST00000461448 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.95■■■□□ 2.55
SNHG12-201ENST00000461448 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
SNHG12-201ENST00000461448 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.92■■■□□ 2.54
SNHG12-201ENST00000461448 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SNHG12-201ENST00000461448 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SNHG12-201ENST00000461448 HECW1Q76N89 1606 aa30.92■■■□□ 2.54
SNHG12-201ENST00000461448 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.9■■■□□ 2.54
SNHG12-201ENST00000461448 ATP10BO94823 1461 aa30.89■■■□□ 2.53
SNHG12-201ENST00000461448 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SNHG12-201ENST00000461448 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
SNHG12-201ENST00000461448 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.77■■■□□ 2.52
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SNHG12-201ENST00000461448 MAPKBP1O60336 1514 aa30.76■■■□□ 2.51
SNHG12-201ENST00000461448 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.75■■■□□ 2.51
SNHG12-201ENST00000461448 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.73■■■□□ 2.51
SNHG12-201ENST00000461448 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SNHG12-201ENST00000461448 APLP2Q06481 763 aa30.69■■■□□ 2.5
SNHG12-201ENST00000461448 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.68■■■□□ 2.5
SNHG12-201ENST00000461448 KCNH8Q96L42 1107 aa30.67■■■□□ 2.5
SNHG12-201ENST00000461448 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
SNHG12-201ENST00000461448 TIAM1Q13009 1591 aa30.6■■■□□ 2.49
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.58■■■□□ 2.49
SNHG12-201ENST00000461448 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.58■■■□□ 2.49
SNHG12-201ENST00000461448 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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SNHG12-201ENST00000461448 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.57■■■□□ 2.48
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K1Q13233 1512 aa30.56■■■□□ 2.48
SNHG12-201ENST00000461448 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.56■■■□□ 2.48
SNHG12-201ENST00000461448 DIP2BQ9P265 1576 aa30.52■■■□□ 2.48
SNHG12-201ENST00000461448 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.48■■■□□ 2.47
SNHG12-201ENST00000461448 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.46■■■□□ 2.47
SNHG12-201ENST00000461448 GLI2P10070 1586 aa30.45■■■□□ 2.47
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SNHG12-201ENST00000461448 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
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SNHG12-201ENST00000461448 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.37■■■□□ 2.45
SNHG12-201ENST00000461448 CD109Q6YHK3 1445 aa30.37■■■□□ 2.45
SNHG12-201ENST00000461448 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.35■■■□□ 2.45
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.33■■■□□ 2.45
SNHG12-201ENST00000461448 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
SNHG12-201ENST00000461448 NCOA2Q15596 1464 aa30.32■■■□□ 2.44
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SNHG12-201ENST00000461448 TSPOAP1O95153 1857 aa30.27■■■□□ 2.44
SNHG12-201ENST00000461448 PLCH2O75038 1416 aa30.24■■■□□ 2.43
SNHG12-201ENST00000461448 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.22■■■□□ 2.43
SNHG12-201ENST00000461448 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SNHG12-201ENST00000461448 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.19■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.18■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.18■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.17■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 PREX2Q70Z35 1606 aa30.16■■■□□ 2.42
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