RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.72■■■□□ 2.51
DDR1-241ENST00000460944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.69■■■□□ 2.5
DDR1-241ENST00000460944 PRXQ9BXM0 1461 aa30.68■■■□□ 2.5
DDR1-241ENST00000460944 ARAP1Q96P48 1450 aa30.67■■■□□ 2.5
DDR1-241ENST00000460944 JPH4Q96JJ6 628 aa30.64■■■□□ 2.5
DDR1-241ENST00000460944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
DDR1-241ENST00000460944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.61■■■□□ 2.49
DDR1-241ENST00000460944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
DDR1-241ENST00000460944 IQGAP2Q13576 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
DDR1-241ENST00000460944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.59■■■□□ 2.49
DDR1-241ENST00000460944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.55■■■□□ 2.48
DDR1-241ENST00000460944 KIF21BO75037 1637 aa30.45■■■□□ 2.47
DDR1-241ENST00000460944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.42■■■□□ 2.46
DDR1-241ENST00000460944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.4■■■□□ 2.46
DDR1-241ENST00000460944 DISP1Q96F81 1524 aa30.32■■■□□ 2.44
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0556O60303 1618 aa30.29■■■□□ 2.44
DDR1-241ENST00000460944 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.28■■■□□ 2.44
DDR1-241ENST00000460944 GOLGA3Q08378 1498 aa30.28■■■□□ 2.44
DDR1-241ENST00000460944 PTPRGP23470 1445 aa30.25■■■□□ 2.43
DDR1-241ENST00000460944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
DDR1-241ENST00000460944 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.21■■■□□ 2.43
DDR1-241ENST00000460944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
DDR1-241ENST00000460944 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.13■■■□□ 2.41
DDR1-241ENST00000460944 SAMD9Q5K651 1589 aa30.11■■■□□ 2.41
DDR1-241ENST00000460944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
DDR1-241ENST00000460944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 UACAQ9BZF9 1416 aa30.05■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 P3H3Q8IVL6 736 aa30.04■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.03■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.02■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 ABCC2Q92887 1545 aa30.01■■■□□ 2.4
DDR1-241ENST00000460944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
DDR1-241ENST00000460944 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.94■■■□□ 2.38
DDR1-241ENST00000460944 MAPKBP1O60336 1514 aa29.93■■■□□ 2.38
DDR1-241ENST00000460944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.93■■■□□ 2.38
DDR1-241ENST00000460944 ABCA8O94911 1581 aa29.92■■■□□ 2.38
DDR1-241ENST00000460944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.86■■■□□ 2.37
DDR1-241ENST00000460944 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.84■■■□□ 2.37
DDR1-241ENST00000460944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
DDR1-241ENST00000460944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.82■■■□□ 2.36
DDR1-241ENST00000460944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.77■■■□□ 2.36
DDR1-241ENST00000460944 ASXL2Q76L83 1435 aa29.77■■■□□ 2.36
DDR1-241ENST00000460944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.76■■■□□ 2.35
DDR1-241ENST00000460944 FMN1Q68DA7 1419 aa29.74■■■□□ 2.35
DDR1-241ENST00000460944 DIP2BQ9P265 1576 aa29.73■■■□□ 2.35
DDR1-241ENST00000460944 CLIP1P30622 1438 aa29.73■■■□□ 2.35
DDR1-241ENST00000460944 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.7■■■□□ 2.35
DDR1-241ENST00000460944 ARID3CA6NKF2 412 aa29.68■■■□□ 2.34
DDR1-241ENST00000460944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
DDR1-241ENST00000460944 ATP10BO94823 1461 aa29.66■■■□□ 2.34
DDR1-241ENST00000460944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.65■■■□□ 2.34
DDR1-241ENST00000460944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.64■■■□□ 2.34
DDR1-241ENST00000460944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 CEP162Q5TB80 1403 aa29.62■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 HECW1Q76N89 1606 aa29.61■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 GLI2P10070 1586 aa29.59■■■□□ 2.33
DDR1-241ENST00000460944 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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DDR1-241ENST00000460944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 KCNH8Q96L42 1107 aa29.5■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.49■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.46■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.46■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.45■■■□□ 2.31
DDR1-241ENST00000460944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.43■■■□□ 2.3
DDR1-241ENST00000460944 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.41■■■□□ 2.3
DDR1-241ENST00000460944 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.4■■■□□ 2.3
DDR1-241ENST00000460944 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
DDR1-241ENST00000460944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
DDR1-241ENST00000460944 CD109Q6YHK3 1445 aa29.36■■■□□ 2.29
DDR1-241ENST00000460944 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.36■■■□□ 2.29
DDR1-241ENST00000460944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.35■■■□□ 2.29
DDR1-241ENST00000460944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.3■■■□□ 2.28
DDR1-241ENST00000460944 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
DDR1-241ENST00000460944 KDM6BO15054 1643 aa29.27■■■□□ 2.28
DDR1-241ENST00000460944 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.26■■■□□ 2.27
DDR1-241ENST00000460944 KIF14Q15058 1648 aa29.23■■■□□ 2.27
DDR1-241ENST00000460944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.276e-7■■■■□ 21.9
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DDR1-241ENST00000460944 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.12■■■□□ 2.25
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DDR1-241ENST00000460944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.1■■■□□ 2.25
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DDR1-241ENST00000460944 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.07■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 TIAM1Q13009 1591 aa29.06■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 FANCAO15360 1455 aa29.06■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 PLCH2O75038 1416 aa29.06■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.04■■■□□ 2.24
DDR1-241ENST00000460944 AKNAQ7Z591 1439 aa28.99■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.99■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 MAP3K1Q13233 1512 aa28.99■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 PREX2Q70Z35 1606 aa28.98■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 APLP2Q06481 763 aa28.97■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.97■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.95■■■□□ 2.23
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