RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 EEA1Q15075 1411 aa34.58■■■■□ 3.13
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.58■■■■□ 3.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ARAP1Q96P48 1450 aa34.55■■■■□ 3.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.54■■■■□ 3.12
RPUSD3-210ENST00000460909 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.52■■■■□ 3.12
RPUSD3-210ENST00000460909 JPH4Q96JJ6 628 aa34.51■■■■□ 3.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.45■■■■□ 3.11
RPUSD3-210ENST00000460909 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
RPUSD3-210ENST00000460909 IQGAP2Q13576 1575 aa34.39■■■■□ 3.1
RPUSD3-210ENST00000460909 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.31■■■■□ 3.08
RPUSD3-210ENST00000460909 KIF21BO75037 1637 aa34.25■■■■□ 3.07
RPUSD3-210ENST00000460909 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.24■■■■□ 3.07
RPUSD3-210ENST00000460909 DISP1Q96F81 1524 aa34.18■■■■□ 3.06
RPUSD3-210ENST00000460909 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.15■■■■□ 3.06
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA0556O60303 1618 aa34.07■■■■□ 3.04
RPUSD3-210ENST00000460909 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.06■■■■□ 3.04
RPUSD3-210ENST00000460909 GOLGA3Q08378 1498 aa34.02■■■■□ 3.04
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPRGP23470 1445 aa34.02■■■■□ 3.04
RPUSD3-210ENST00000460909 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.93■■■■□ 3.02
RPUSD3-210ENST00000460909 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.93■■■■□ 3.02
RPUSD3-210ENST00000460909 SAMD9Q5K651 1589 aa33.91■■■■□ 3.02
RPUSD3-210ENST00000460909 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
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RPUSD3-210ENST00000460909 UACAQ9BZF9 1416 aa33.81■■■■□ 3
RPUSD3-210ENST00000460909 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.81■■■■□ 3
RPUSD3-210ENST00000460909 P3H3Q8IVL6 736 aa33.79■■■■□ 3
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RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC2Q92887 1545 aa33.76■■■■□ 3
RPUSD3-210ENST00000460909 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.74■■■□□ 2.99
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RPUSD3-210ENST00000460909 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCA8O94911 1581 aa33.71■■■□□ 2.99
RPUSD3-210ENST00000460909 MAPKBP1O60336 1514 aa33.68■■■□□ 2.98
RPUSD3-210ENST00000460909 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.67■■■□□ 2.98
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RPUSD3-210ENST00000460909 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.65■■■□□ 2.98
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.63■■■□□ 2.97
RPUSD3-210ENST00000460909 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
RPUSD3-210ENST00000460909 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.53■■■□□ 2.96
RPUSD3-210ENST00000460909 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.52■■■□□ 2.96
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.5■■■□□ 2.95
RPUSD3-210ENST00000460909 ASXL2Q76L83 1435 aa33.49■■■□□ 2.95
RPUSD3-210ENST00000460909 DIP2BQ9P265 1576 aa33.47■■■□□ 2.95
RPUSD3-210ENST00000460909 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.44■■■□□ 2.94
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP10BO94823 1461 aa33.44■■■□□ 2.94
RPUSD3-210ENST00000460909 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
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RPUSD3-210ENST00000460909 FMN1Q68DA7 1419 aa33.4■■■□□ 2.94
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.39■■■□□ 2.94
RPUSD3-210ENST00000460909 ARID3CA6NKF2 412 aa33.35■■■□□ 2.93
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.34■■■□□ 2.93
RPUSD3-210ENST00000460909 GLI2P10070 1586 aa33.31■■■□□ 2.92
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RPUSD3-210ENST00000460909 HECW1Q76N89 1606 aa33.24■■■□□ 2.91
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RPUSD3-210ENST00000460909 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
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RPUSD3-210ENST00000460909 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.16■■■□□ 2.9
RPUSD3-210ENST00000460909 KCNH8Q96L42 1107 aa33.16■■■□□ 2.9
RPUSD3-210ENST00000460909 TSPOAP1O95153 1857 aa33.15■■■□□ 2.9
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
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RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.02■■■□□ 2.88
RPUSD3-210ENST00000460909 CD109Q6YHK3 1445 aa33.02■■■□□ 2.88
RPUSD3-210ENST00000460909 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.97■■■□□ 2.87
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RPUSD3-210ENST00000460909 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.87■■■□□ 2.85
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RPUSD3-210ENST00000460909 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
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RPUSD3-210ENST00000460909 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.7■■■□□ 2.83
RPUSD3-210ENST00000460909 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.7■■■□□ 2.83
RPUSD3-210ENST00000460909 TIAM1Q13009 1591 aa32.69■■■□□ 2.82
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RPUSD3-210ENST00000460909 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.64■■■□□ 2.82
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RPUSD3-210ENST00000460909 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.6■■■□□ 2.81
RPUSD3-210ENST00000460909 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.59■■■□□ 2.81
RPUSD3-210ENST00000460909 PREX2Q70Z35 1606 aa32.59■■■□□ 2.81
RPUSD3-210ENST00000460909 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.56■■■□□ 2.8
RPUSD3-210ENST00000460909 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.55■■■□□ 2.8
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