RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 CEP162Q5TB80 1403 aa39■■■■□ 3.83
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NME4-209ENST00000460297 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 CLIP1P30622 1438 aa38.85■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.83■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 IQGAP2Q13576 1575 aa38.82■■■■□ 3.81
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NME4-209ENST00000460297 SHROOM2Q13796 1616 aa38.47■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.47■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 OSCARQ8IYS5 282 aa38.46■■■■□ 3.75
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NME4-209ENST00000460297 NCOA2Q15596 1464 aa37.35■■■■□ 3.57
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NME4-209ENST00000460297 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.25■■■■□ 3.55
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NME4-209ENST00000460297 PREX2Q70Z35 1606 aa36.95■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.94■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.94■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.52e-10■■■■■ 37.2
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