RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460020.5

PFKL-203, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 890 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-203ENST00000460020 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.43■■■■□ 3.74
PFKL-203ENST00000460020 JPH4Q96JJ6 628 aa38.4■■■■□ 3.74
PFKL-203ENST00000460020 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.74
PFKL-203ENST00000460020 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.38■■■■□ 3.73
PFKL-203ENST00000460020 IQGAP2Q13576 1575 aa38.25■■■■□ 3.71
PFKL-203ENST00000460020 PRXQ9BXM0 1461 aa38.22■■■■□ 3.71
PFKL-203ENST00000460020 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.17■■■■□ 3.7
PFKL-203ENST00000460020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.14■■■■□ 3.7
PFKL-203ENST00000460020 EEA1Q15075 1411 aa38.13■■■■□ 3.7
PFKL-203ENST00000460020 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.08■■■■□ 3.69
PFKL-203ENST00000460020 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.02■■■■□ 3.68
PFKL-203ENST00000460020 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.02■■■■□ 3.68
PFKL-203ENST00000460020 DISP1Q96F81 1524 aa37.97■■■■□ 3.67
PFKL-203ENST00000460020 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.91■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 KIAA0556O60303 1618 aa37.9■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.9■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 PTPRGP23470 1445 aa37.88■■■■□ 3.66
PFKL-203ENST00000460020 KIF21BO75037 1637 aa37.83■■■■□ 3.65
PFKL-203ENST00000460020 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
PFKL-203ENST00000460020 GOLGA3Q08378 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
PFKL-203ENST00000460020 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.62
PFKL-203ENST00000460020 MAPKBP1O60336 1514 aa37.66■■■■□ 3.62
PFKL-203ENST00000460020 UACAQ9BZF9 1416 aa37.65■■■■□ 3.62
PFKL-203ENST00000460020 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.64■■■■□ 3.62
PFKL-203ENST00000460020 ABCC2Q92887 1545 aa37.62■■■■□ 3.61
PFKL-203ENST00000460020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.61■■■■□ 3.61
PFKL-203ENST00000460020 SAMD9Q5K651 1589 aa37.6■■■■□ 3.61
PFKL-203ENST00000460020 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.49■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 ABCA8O94911 1581 aa37.48■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.48■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 DIP2BQ9P265 1576 aa37.47■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.46■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 P3H3Q8IVL6 736 aa37.46■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.46■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
PFKL-203ENST00000460020 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
PFKL-203ENST00000460020 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
PFKL-203ENST00000460020 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.38■■■■□ 3.57
PFKL-203ENST00000460020 ASXL2Q76L83 1435 aa37.37■■■■□ 3.57
PFKL-203ENST00000460020 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.36■■■■□ 3.57
PFKL-203ENST00000460020 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.32■■■■□ 3.56
PFKL-203ENST00000460020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.27■■■■□ 3.56
PFKL-203ENST00000460020 GLI2P10070 1586 aa37.21■■■■□ 3.55
PFKL-203ENST00000460020 TSPOAP1O95153 1857 aa37.21■■■■□ 3.55
PFKL-203ENST00000460020 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.18■■■■□ 3.54
PFKL-203ENST00000460020 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PFKL-203ENST00000460020 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.14■■■■□ 3.54
PFKL-203ENST00000460020 ATP10BO94823 1461 aa37.13■■■■□ 3.53
PFKL-203ENST00000460020 ARID3CA6NKF2 412 aa37.1■■■■□ 3.53
PFKL-203ENST00000460020 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PFKL-203ENST00000460020 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.07■■■■□ 3.53
PFKL-203ENST00000460020 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
PFKL-203ENST00000460020 FMN1Q68DA7 1419 aa36.98■■■■□ 3.51
PFKL-203ENST00000460020 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.95■■■■□ 3.51
PFKL-203ENST00000460020 KCNH8Q96L42 1107 aa36.94■■■■□ 3.5
PFKL-203ENST00000460020 KDM6BO15054 1643 aa36.92■■■■□ 3.5
PFKL-203ENST00000460020 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
PFKL-203ENST00000460020 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PFKL-203ENST00000460020 HECW1Q76N89 1606 aa36.89■■■■□ 3.5
PFKL-203ENST00000460020 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.85■■■■□ 3.49
PFKL-203ENST00000460020 CLIP1P30622 1438 aa36.85■■■■□ 3.49
PFKL-203ENST00000460020 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
PFKL-203ENST00000460020 CD109Q6YHK3 1445 aa36.82■■■■□ 3.48
PFKL-203ENST00000460020 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.81■■■■□ 3.48
PFKL-203ENST00000460020 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.79■■■■□ 3.48
PFKL-203ENST00000460020 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.76■■■■□ 3.48
PFKL-203ENST00000460020 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
PFKL-203ENST00000460020 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
PFKL-203ENST00000460020 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.74■■■■□ 3.47
PFKL-203ENST00000460020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.69■■■■□ 3.46
PFKL-203ENST00000460020 CEP162Q5TB80 1403 aa36.65■■■■□ 3.46
PFKL-203ENST00000460020 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PFKL-203ENST00000460020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.62■■■■□ 3.45
PFKL-203ENST00000460020 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
PFKL-203ENST00000460020 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.6■■■■□ 3.45
PFKL-203ENST00000460020 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.59■■■■□ 3.45
PFKL-203ENST00000460020 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.58■■■■□ 3.45
PFKL-203ENST00000460020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
PFKL-203ENST00000460020 KIF14Q15058 1648 aa36.5■■■■□ 3.43
PFKL-203ENST00000460020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
PFKL-203ENST00000460020 NEO1Q92859 1461 aa36.49■■■■□ 3.43
PFKL-203ENST00000460020 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.47■■■■□ 3.43
PFKL-203ENST00000460020 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.45■■■■□ 3.43
PFKL-203ENST00000460020 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.43■■■■□ 3.42
PFKL-203ENST00000460020 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.42■■■■□ 3.42
PFKL-203ENST00000460020 FANCAO15360 1455 aa36.37■■■■□ 3.41
PFKL-203ENST00000460020 PLCH2O75038 1416 aa36.34■■■■□ 3.41
PFKL-203ENST00000460020 AKNAQ7Z591 1439 aa36.32■■■■□ 3.4
PFKL-203ENST00000460020 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.28■■■■□ 3.4
PFKL-203ENST00000460020 RICTORQ6R327 1708 aa36.25■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 RAPGEF3O95398 923 aa36.23■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.22■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.22■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 PREX2Q70Z35 1606 aa36.22■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.2■■■■□ 3.39
PFKL-203ENST00000460020 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.2■■■■□ 3.38
PFKL-203ENST00000460020 ADGRL1O94910 1474 aa36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms