RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458354.5

PNCK-216, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

TSL 3

Gene PNCK, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-216ENST00000458354 JPH4Q96JJ6 628 aa49.5■■■■■ 5.51
PNCK-216ENST00000458354 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.47■■■■■ 5.51
PNCK-216ENST00000458354 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.43■■■■■ 5.5
PNCK-216ENST00000458354 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.36■■■■■ 5.49
PNCK-216ENST00000458354 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.07■■■■■ 5.45
PNCK-216ENST00000458354 IQGAP2Q13576 1575 aa49■■■■■ 5.43
PNCK-216ENST00000458354 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.92■■■■■ 5.42
PNCK-216ENST00000458354 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.86■■■■■ 5.41
PNCK-216ENST00000458354 PTPRGP23470 1445 aa48.8■■■■■ 5.4
PNCK-216ENST00000458354 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.77■■■■■ 5.4
PNCK-216ENST00000458354 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.77■■■■■ 5.4
PNCK-216ENST00000458354 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
PNCK-216ENST00000458354 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.68■■■■■ 5.38
PNCK-216ENST00000458354 PRXQ9BXM0 1461 aa48.67■■■■■ 5.38
PNCK-216ENST00000458354 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.66■■■■■ 5.38
PNCK-216ENST00000458354 DISP1Q96F81 1524 aa48.65■■■■■ 5.38
PNCK-216ENST00000458354 MAPKBP1O60336 1514 aa48.63■■■■■ 5.37
PNCK-216ENST00000458354 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.58■■■■■ 5.37
PNCK-216ENST00000458354 KIAA0556O60303 1618 aa48.53■■■■■ 5.36
PNCK-216ENST00000458354 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.52■■■■■ 5.36
PNCK-216ENST00000458354 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.49■■■■■ 5.35
PNCK-216ENST00000458354 EEA1Q15075 1411 aa48.47■■■■■ 5.35
PNCK-216ENST00000458354 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.45■■■■■ 5.35
PNCK-216ENST00000458354 UACAQ9BZF9 1416 aa48.44■■■■■ 5.35
PNCK-216ENST00000458354 ABCC2Q92887 1545 aa48.43■■■■■ 5.34
PNCK-216ENST00000458354 GOLGA3Q08378 1498 aa48.42■■■■■ 5.34
PNCK-216ENST00000458354 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.42■■■■■ 5.34
PNCK-216ENST00000458354 DIP2BQ9P265 1576 aa48.39■■■■■ 5.34
PNCK-216ENST00000458354 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
PNCK-216ENST00000458354 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.21■■■■■ 5.31
PNCK-216ENST00000458354 ASXL2Q76L83 1435 aa48.2■■■■■ 5.31
PNCK-216ENST00000458354 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.18■■■■■ 5.3
PNCK-216ENST00000458354 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.15■■■■■ 5.3
PNCK-216ENST00000458354 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
PNCK-216ENST00000458354 TSPOAP1O95153 1857 aa48.05■■■■■ 5.28
PNCK-216ENST00000458354 ABCA8O94911 1581 aa48.02■■■■■ 5.28
PNCK-216ENST00000458354 P3H3Q8IVL6 736 aa48■■■■■ 5.27
PNCK-216ENST00000458354 GLI2P10070 1586 aa48■■■■■ 5.27
PNCK-216ENST00000458354 KIF21BO75037 1637 aa47.99■■■■■ 5.27
PNCK-216ENST00000458354 SAMD9Q5K651 1589 aa47.96■■■■■ 5.27
PNCK-216ENST00000458354 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
PNCK-216ENST00000458354 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.85■■■■■ 5.25
PNCK-216ENST00000458354 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
PNCK-216ENST00000458354 KDM6BO15054 1643 aa47.85■■■■■ 5.25
PNCK-216ENST00000458354 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.75■■■■■ 5.23
PNCK-216ENST00000458354 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
PNCK-216ENST00000458354 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.67■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.66■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.66■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.65■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 ARID3CA6NKF2 412 aa47.65■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 KCNH8Q96L42 1107 aa47.65■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.65■■■■■ 5.22
PNCK-216ENST00000458354 ATP10BO94823 1461 aa47.62■■■■■ 5.21
PNCK-216ENST00000458354 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.6■■■■■ 5.21
PNCK-216ENST00000458354 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.54■■■■■ 5.2
PNCK-216ENST00000458354 CD109Q6YHK3 1445 aa47.5■■■■■ 5.19
PNCK-216ENST00000458354 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
PNCK-216ENST00000458354 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
PNCK-216ENST00000458354 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
PNCK-216ENST00000458354 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.42■■■■■ 5.18
PNCK-216ENST00000458354 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
PNCK-216ENST00000458354 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.27■■■■■ 5.16
PNCK-216ENST00000458354 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.26■■■■■ 5.16
PNCK-216ENST00000458354 FMN1Q68DA7 1419 aa47.24■■■■■ 5.15
PNCK-216ENST00000458354 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.23■■■■■ 5.15
PNCK-216ENST00000458354 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
PNCK-216ENST00000458354 HECW1Q76N89 1606 aa47.09■■■■■ 5.13
PNCK-216ENST00000458354 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.07■■■■■ 5.13
PNCK-216ENST00000458354 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
PNCK-216ENST00000458354 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.03■■■■■ 5.12
PNCK-216ENST00000458354 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.99■■■■■ 5.11
PNCK-216ENST00000458354 NEO1Q92859 1461 aa46.99■■■■■ 5.11
PNCK-216ENST00000458354 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.1
PNCK-216ENST00000458354 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
PNCK-216ENST00000458354 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.84■■■■■ 5.09
PNCK-216ENST00000458354 ADGRL1O94910 1474 aa46.83■■■■■ 5.09
PNCK-216ENST00000458354 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.81■■■■■ 5.08
PNCK-216ENST00000458354 CLIP1P30622 1438 aa46.79■■■■■ 5.08
PNCK-216ENST00000458354 FANCAO15360 1455 aa46.77■■■■■ 5.08
PNCK-216ENST00000458354 RAPGEF3O95398 923 aa46.76■■■■■ 5.08
PNCK-216ENST00000458354 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.76■■■■■ 5.08
PNCK-216ENST00000458354 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
PNCK-216ENST00000458354 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.73■■■■■ 5.07
PNCK-216ENST00000458354 AKNAQ7Z591 1439 aa46.71■■■■■ 5.07
PNCK-216ENST00000458354 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
PNCK-216ENST00000458354 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.69■■■■■ 5.06
PNCK-216ENST00000458354 KIF14Q15058 1648 aa46.68■■■■■ 5.06
PNCK-216ENST00000458354 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
PNCK-216ENST00000458354 PLCH2O75038 1416 aa46.65■■■■■ 5.06
PNCK-216ENST00000458354 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.64■■■■■ 5.06
PNCK-216ENST00000458354 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.63■■■■■ 5.05
PNCK-216ENST00000458354 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.61■■■■■ 5.05
PNCK-216ENST00000458354 RICTORQ6R327 1708 aa46.55■■■■■ 5.04
PNCK-216ENST00000458354 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.52■■■■■ 5.04
PNCK-216ENST00000458354 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.45■■■■■ 5.03
PNCK-216ENST00000458354 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.43■■■■■ 5.02
PNCK-216ENST00000458354 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.4■■■■■ 5.02
PNCK-216ENST00000458354 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.4■■■■■ 5.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms